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Seleção e caracterização de bactérias degradadoras de hidrocarbonetos em amostras de solo e sedimento da Amazônia e Antártica

Juliana Cedro Souza Vivian Helena Pellizari

2009

Localização: ICB - Inst. Ciências Biomédicas    (T-ICB BIOT QH323.6 S729sc 2009 )(Acessar)

  • Título:
    Seleção e caracterização de bactérias degradadoras de hidrocarbonetos em amostras de solo e sedimento da Amazônia e Antártica
  • Autor: Juliana Cedro Souza
  • Vivian Helena Pellizari
  • Assuntos: BACTÉRIAS; BIODEGRADAÇÃO -- AMAZÔNIA ANTÁRTICA; HIDROCARBONETOS; BIOTECNOLOGIA
  • Notas: Dissertação (Mestrado)
  • Notas Locais: Programa Interunidades em Biotecnologia EP/FMVZ/IPT/IB/ICB/I. BUTANTAN;Nome do Programa Interunidades no site do Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo
  • Descrição: Uma grande versatilidade metabólica e adaptabilidade genética fazem dos microrganismos importantes biotransformadores de hidrocarbonetos, permitindo que sejam empregados em processos de biocatálise (reações catalisadas por enzimas biológicas com a finalidade de produzir compostos de interesse comercial) e de biodegradação (a transformação de um composto tóxico em um menos tóxico, também aplicado à tecnologia de biorremediação). As enzimas chaves responsáveis pela biodegradação de hidrocarbonetos são as mono e dioxigenases. A detecção de genes catabólicos, codificantes dessas enzimas, permite estudos de interesse econômico e ambiental. Também permite determinar a distribuição geográfica das bactérias em estudo, servindo como modelo para a compreensão de padrões de dispersão de microorganismos autóctones. O presente estudo tem como objetivo selecionar e caracterizar bactérias capazes de degradar hidrocarbonetos em amostras de solos e sedimentos preservados ou influenciados por atividade antrópica, da Amazônia e da Antártica. Também se buscou detectar os genes funcionais desses microrganismos que codificam enzimas de interesse biodegradativo e biocatalítico. Para obtenção das cepas, foram empregados dois processos de isolamento em meio mineral K1, enriquecimento e cultivo direto, utilizando bifenilo, nonano, xileno ou naftaleno como única fonte de carbono. A eficiência de degradação dos isolados foi verificada utilizando Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (HPLC). A detecção dos genes catabólicos foi realizada utilizando a técnica de PCR com primers degenerados (ARHDa-1 ARHDa-/1 e 355f/924r) e específicos (ndo). A caracterização filognética das cepas obtidas foi feita através do sequenciamento parcial do gene RNAr 16S, obtido por PCR com os primers 27f e 1401 r. Foram obtidos 36 isolados,
    25 da Antártica (NA) e 11 da Amazônia (NR), provenientes dos solos inoculados em meio contendo naftaleno. Os isolados, comparando-se suas seqüências com seqüências depositadas nos bancos do RDPII e NCBI, foram identificados como Rhodococcus (2 cepas), Pseudomonas (14 cepas), Paracoccus (1 cepa) e Enterobacter (19 cepas). Os gêneros Rhodococcus e Paracoccus foram apenas isolados a partir dos solos antárticos. De 24 isolados testados com naftaleno, 23 obtiveram sua degradação comprovada e quando submetidos ao teste com fenantreno,16 degradaram o substrato. Duas cepas afiliadas ao gênero Pseudomonas (NR06 e NA 16) apresentaram altas taxas de degradação de naftaleno (90% e 98%, respectivamente) e de fenantreno (65% e 78%, respectivamente). A cepa de Paracoccus (NA26) mostrou habilidade em degradar, além do naftaleno e fenantreno, pireno e bifenilo. Os primers específicos e degenerados testados para os genes catabólicos não permitiram a amplificação de fragmentos desejados, tanto a partir do DNA cromossomal quanto do plasmidial. Todos os isolados obtidos pertencem a gêneros já descritos como deqradadores de compostos xenobióticos, e, portanto, apresentam potencial biotecnológico para biorremediação
  • Data de criação/publicação: 2009
  • Formato: 93 p.
  • Idioma: Português
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