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Could graph neural networks learn better molecular representation for drug discovery? A comparison study of descriptor-based and graph-based models
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Could graph neural networks learn better molecular representation for drug discovery? A comparison study of descriptor-based and graph-based models

Jiang, Dejun ; Wu, Zhenxing ; Hsieh, Chang-Yu ; Chen, Guangyong ; Liao, Ben ; Wang, Zhe ; Shen, Chao ; Cao, Dongsheng ; Wu, Jian ; Hou, Tingjun

Journal of cheminformatics, 2021-02, Vol.13 (1), p.12-12, Article 12 [Periódico revisado por pares]

Cham: Springer International Publishing

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2
Molecular representations in AI-driven drug discovery: a review and practical guide
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Molecular representations in AI-driven drug discovery: a review and practical guide

David, Laurianne ; Thakkar, Amol ; Mercado, Rocío ; Engkvist, Ola

Journal of cheminformatics, 2020-09, Vol.12 (1), p.56-56, Article 56 [Periódico revisado por pares]

Cham: Springer International Publishing

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3
COCONUT online: Collection of Open Natural Products database
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COCONUT online: Collection of Open Natural Products database

Sorokina, Maria ; Merseburger, Peter ; Rajan, Kohulan ; Yirik, Mehmet Aziz ; Steinbeck, Christoph

Journal of cheminformatics, 2021-01, Vol.13 (1), p.2-2, Article 2 [Periódico revisado por pares]

Cham: Springer International Publishing

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4
Review on natural products databases: where to find data in 2020
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Review on natural products databases: where to find data in 2020

Sorokina, Maria ; Steinbeck, Christoph

Journal of cheminformatics, 2020-04, Vol.12 (1), p.20-20, Article 20 [Periódico revisado por pares]

Cham: Springer International Publishing

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5
The CompTox Chemistry Dashboard: a community data resource for environmental chemistry
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The CompTox Chemistry Dashboard: a community data resource for environmental chemistry

Williams, Antony J. ; Grulke, Christopher M. ; Edwards, Jeff ; McEachran, Andrew D. ; Mansouri, Kamel ; Baker, Nancy C. ; Patlewicz, Grace ; Shah, Imran ; Wambaugh, John F. ; Judson, Richard S. ; Richard, Ann M.

Journal of cheminformatics, 2017-11, Vol.9 (1), p.61-27, Article 61 [Periódico revisado por pares]

Cham: Springer International Publishing

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6
Deterministic single exponential time algorithms for connectivity problems parameterized by treewidth
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Deterministic single exponential time algorithms for connectivity problems parameterized by treewidth

Bodlaender, Hans L. ; Cygan, Marek ; Kratsch, Stefan ; Nederlof, Jesper

Information and computation, 2015-08, Vol.243, p.86-111 [Periódico revisado por pares]

Elsevier Inc

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7
BioBERT: a pre-trained biomedical language representation model for biomedical text mining
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BioBERT: a pre-trained biomedical language representation model for biomedical text mining

Lee, Jinhyuk ; Yoon, Wonjin ; Kim, Sungdong ; Kim, Donghyeon ; Kim, Sunkyu ; So, Chan Ho ; Kang, Jaewoo Wren, Jonathan

Bioinformatics, 2020-02, Vol.36 (4), p.1234-1240 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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8
RAxML-NG: a fast, scalable and user-friendly tool for maximum likelihood phylogenetic inference
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RAxML-NG: a fast, scalable and user-friendly tool for maximum likelihood phylogenetic inference

Kozlov, Alexey M ; Darriba, Diego ; Flouri, Tomáš ; Morel, Benoit ; Stamatakis, Alexandros Wren, Jonathan

Bioinformatics, 2019-11, Vol.35 (21), p.4453-4455 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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9
Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data
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Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data

Gu, Zuguang ; Eils, Roland ; Schlesner, Matthias

Bioinformatics (Oxford, England), 2016-09, Vol.32 (18), p.2847-2849 [Periódico revisado por pares]

England

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10
fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor
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fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor

Chen, Shifu ; Zhou, Yanqing ; Chen, Yaru ; Gu, Jia

Bioinformatics, 2018-09, Vol.34 (17), p.i884-i890 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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