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Interplay between the cell envelope and mobile genetic elements shapes gene flow in populations of the nosocomial pathogen Klebsiella pneumoniae
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Interplay between the cell envelope and mobile genetic elements shapes gene flow in populations of the nosocomial pathogen Klebsiella pneumoniae

Haudiquet, Matthieu ; Buffet, Amandine ; Rendueles, Olaya ; Rocha, Eduardo P. C. de Visser, J. Arjan G. M.

PLoS biology, 2021-07, Vol.19 (7), p.e3001276-e3001276 [Periódico revisado por pares]

San Francisco: Public Library of Science

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12
Integrative and conjugative elements and their hosts: composition, distribution and organization
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Integrative and conjugative elements and their hosts: composition, distribution and organization

Cury, Jean ; Touchon, Marie ; Rocha, Eduardo P C

Nucleic acids research, 2017-09, Vol.45 (15), p.8943-8956 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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13
The repertoire of ICE in prokaryotes underscores the unity, diversity, and ubiquity of conjugation
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The repertoire of ICE in prokaryotes underscores the unity, diversity, and ubiquity of conjugation

Guglielmini, Julien ; Quintais, Leonor ; Garcillán-Barcia, Maria Pilar ; de la Cruz, Fernando ; Rocha, Eduardo P C Casadesús, Josep

PLoS genetics, 2011-08, Vol.7 (8), p.e1002222-e1002222 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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14
The systemic imprint of growth and its uses in ecological (meta)genomics
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The systemic imprint of growth and its uses in ecological (meta)genomics

Vieira-Silva, Sara ; Rocha, Eduardo P C Moran, Nancy A.

PLoS genetics, 2010-01, Vol.6 (1), p.e1000808 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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15
A Computational Approach Applied to the Study of Potential Allosteric Inhibitors Protease NS2B/NS3 from Dengue Virus
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A Computational Approach Applied to the Study of Potential Allosteric Inhibitors Protease NS2B/NS3 from Dengue Virus

Costa, Renato A. da ; Rocha, João A. P. da ; Pinheiro, Alan S. ; Costa, Andréia do S. S. da ; Rocha, Elaine C. M. da ; Silva, Rai. C. ; Gonçalves, Arlan da S. ; Santos, Cleydson B. R. ; Brasil, Davi do S. B.

Molecules (Basel, Switzerland), 2022-06, Vol.27 (13), p.4118 [Periódico revisado por pares]

Basel: MDPI AG

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PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a partitioned pangenome graph
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PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a partitioned pangenome graph

Gautreau, Guillaume ; Bazin, Adelme ; Gachet, Mathieu ; Planel, Rémi ; Burlot, Laura ; Dubois, Mathieu ; Perrin, Amandine ; Médigue, Claudine ; Calteau, Alexandra ; Cruveiller, Stéphane ; Matias, Catherine ; Ambroise, Christophe ; Rocha, Eduardo P C ; Vallenet, David Ouzounis, Christos A.

PLoS computational biology, 2020-03, Vol.16 (3), p.e1007732-e1007732 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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17
The adaptation of temperate bacteriophages to their host genomes
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The adaptation of temperate bacteriophages to their host genomes

Bobay, Louis-Marie ; Rocha, Eduardo P C ; Touchon, Marie

Molecular biology and evolution, 2013-04, Vol.30 (4), p.737-751 [Periódico revisado por pares]

United States: Oxford Publishing Limited (England)

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18
Evolution of ColE1-like plasmids across γ-Proteobacteria: From bacteriocin production to antimicrobial resistance
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Evolution of ColE1-like plasmids across γ-Proteobacteria: From bacteriocin production to antimicrobial resistance

Ares-Arroyo, Manuel ; Rocha, Eduardo P C ; Gonzalez-Zorn, Bruno Casadesús, Josep

PLoS genetics, 2021-11, Vol.17 (11), p.e1009919-e1009919 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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19
Phage-Plasmids Spread Antibiotic Resistance Genes through Infection and Lysogenic Conversion
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Phage-Plasmids Spread Antibiotic Resistance Genes through Infection and Lysogenic Conversion

Pfeifer, Eugen ; Bonnin, Rémy A. ; Rocha, Eduardo P. C. Goldman, Gustavo H.

mBio, 2022-10, Vol.13 (5), p.e0185122-e0185122 [Periódico revisado por pares]

1752 N St., N.W., Washington, DC: American Society for Microbiology

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20
Key components of the eight classes of type IV secretion systems involved in bacterial conjugation or protein secretion
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Key components of the eight classes of type IV secretion systems involved in bacterial conjugation or protein secretion

Guglielmini, Julien ; Néron, Bertrand ; Abby, Sophie S ; Garcillán-Barcia, María Pilar ; la Cruz, Fernando de ; Rocha, Eduardo P. C

Nucleic acids research, 2014-05, Vol.42 (9), p.5715-5727 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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