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Architecture and regulation of filamentous human cystathionine beta-synthase
Architecture and regulation of filamentous human cystathionine beta-synthase
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Architecture and regulation of filamentous human cystathionine beta-synthase

McCorvie, Thomas J ; Adamoski, Douglas ; Machado, Raquel A C ; Tang, Jiazhi ; Bailey, Henry J ; Ferreira, Douglas S M ; Strain-Damerell, Claire ; Baslé, Arnaud ; Ambrosio, Andre L B ; Dias, Sandra M G ; Yue, Wyatt W

Nature communications, 2024-04, Vol.15 (1), p.2931-2931, Article 2931 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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2
μeV electron spectromicroscopy using free-space light
μeV electron spectromicroscopy using free-space light
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μeV electron spectromicroscopy using free-space light

Auad, Yves ; Dias, Eduardo J C ; Tencé, Marcel ; Blazit, Jean-Denis ; Li, Xiaoyan ; Zagonel, Luiz Fernando ; Stéphan, Odile ; Tizei, Luiz H G ; García de Abajo, F Javier ; Kociak, Mathieu

Nature communications, 2023-07, Vol.14 (1), p.4442-4442, Article 4442 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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3
Preclinical development of kinetin as a safe error-prone SARS-CoV-2 antiviral able to attenuate virus-induced inflammation
Preclinical development of kinetin as a safe error-prone SARS-CoV-2 antiviral able to attenuate virus-induced inflammation
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Preclinical development of kinetin as a safe error-prone SARS-CoV-2 antiviral able to attenuate virus-induced inflammation

Souza, Thiago Moreno L ; Pinho, Vagner D ; Setim, Cristina F ; Sacramento, Carolina Q ; Marcon, Rodrigo ; Fintelman-Rodrigues, Natalia ; Chaves, Otavio A ; Heller, Melina ; Temerozo, Jairo R ; Ferreira, André C ; Mattos, Mayara ; Momo, Patrícia B ; Dias, Suelen S G ; Gesto, João S M ; Pereira-Dutra, Filipe ; Viola, João P B ; Queiroz-Junior, Celso Martins ; Guimarães, Lays Cordeiro ; Chaves, Ian Meira ; Guimarães, Pedro Pires Goulart ; Costa, Vivian Vasconcelos ; Teixeira, Mauro Martins ; Bou-Habib, Dumith Chequer ; Bozza, Patrícia T ; Aguillón, Anderson R ; Siqueira-Junior, Jarbas ; Macedo-Junior, Sergio ; Andrade, Edineia L ; Fadanni, Guilherme P ; Tolouei, Sara E L ; Potrich, Francine B ; Santos, Adara A ; Marques, Naiani F ; Calixto, João B ; Rabi, Jaime A

Nature communications, 2023-01, Vol.14 (1), p.199-17, Article 199 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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4
Using both qualitative and quantitative data in parameter identification for systems biology models
Using both qualitative and quantitative data in parameter identification for systems biology models
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Using both qualitative and quantitative data in parameter identification for systems biology models

Mitra, Eshan D. ; Dias, Raquel ; Posner, Richard G. ; Hlavacek, William S.

Nature communications, 2018-09, Vol.9 (1) [Periódico revisado por pares]

United Kingdom: Nature Publishing Group

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5
dia-PASEF data analysis using FragPipe and DIA-NN for deep proteomics of low sample amounts
dia-PASEF data analysis using FragPipe and DIA-NN for deep proteomics of low sample amounts
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dia-PASEF data analysis using FragPipe and DIA-NN for deep proteomics of low sample amounts

Demichev, Vadim ; Szyrwiel, Lukasz ; Yu, Fengchao ; Teo, Guo Ci ; Rosenberger, George ; Niewienda, Agathe ; Ludwig, Daniela ; Decker, Jens ; Kaspar-Schoenefeld, Stephanie ; Lilley, Kathryn S ; Mülleder, Michael ; Nesvizhskii, Alexey I ; Ralser, Markus

Nature communications, 2022-07, Vol.13 (1), p.3944-3944, Article 3944 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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6
Analysis of DIA proteomics data using MSFragger-DIA and FragPipe computational platform
Analysis of DIA proteomics data using MSFragger-DIA and FragPipe computational platform
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Analysis of DIA proteomics data using MSFragger-DIA and FragPipe computational platform

Yu, Fengchao ; Teo, Guo Ci ; Kong, Andy T ; Fröhlich, Klemens ; Li, Ginny Xiaohe ; Demichev, Vadim ; Nesvizhskii, Alexey I

Nature communications, 2023-07, Vol.14 (1), p.4154-4154, Article 4154 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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7
Generating high quality libraries for DIA MS with empirically corrected peptide predictions
Generating high quality libraries for DIA MS with empirically corrected peptide predictions
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Generating high quality libraries for DIA MS with empirically corrected peptide predictions

Searle, Brian C ; Swearingen, Kristian E ; Barnes, Christopher A ; Schmidt, Tobias ; Gessulat, Siegfried ; Küster, Bernhard ; Wilhelm, Mathias

Nature communications, 2020-03, Vol.11 (1), p.1548-1548, Article 1548 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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8
DeepPhospho accelerates DIA phosphoproteome profiling through in silico library generation
DeepPhospho accelerates DIA phosphoproteome profiling through in silico library generation
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DeepPhospho accelerates DIA phosphoproteome profiling through in silico library generation

Lou, Ronghui ; Liu, Weizhen ; Li, Rongjie ; Li, Shanshan ; He, Xuming ; Shui, Wenqing

Nature communications, 2021-11, Vol.12 (1), p.6685-6685, Article 6685 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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9
Benchmarking commonly used software suites and analysis workflows for DIA proteomics and phosphoproteomics
Benchmarking commonly used software suites and analysis workflows for DIA proteomics and phosphoproteomics
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Benchmarking commonly used software suites and analysis workflows for DIA proteomics and phosphoproteomics

Lou, Ronghui ; Cao, Ye ; Li, Shanshan ; Lang, Xiaoyu ; Li, Yunxia ; Zhang, Yaoyang ; Shui, Wenqing

Nature communications, 2023-01, Vol.14 (1), p.94-94, Article 94 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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10
Time-resolved in vivo ubiquitinome profiling by DIA-MS reveals USP7 targets on a proteome-wide scale
Time-resolved in vivo ubiquitinome profiling by DIA-MS reveals USP7 targets on a proteome-wide scale
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Time-resolved in vivo ubiquitinome profiling by DIA-MS reveals USP7 targets on a proteome-wide scale

Steger, Martin ; Demichev, Vadim ; Backman, Mattias ; Ohmayer, Uli ; Ihmor, Phillip ; Müller, Stefan ; Ralser, Markus ; Daub, Henrik

Nature communications, 2021-09, Vol.12 (1), p.5399-5399, Article 5399 [Periódico revisado por pares]

London: Nature Publishing Group

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