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1
Fast and accurate short read alignment with Burrows–Wheeler transform
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Fast and accurate short read alignment with Burrows–Wheeler transform

Li, Heng ; Durbin, Richard

Bioinformatics, 2009-07, Vol.25 (14), p.1754-1760 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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2
TopHat: discovering splice junctions with RNA-Seq
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TopHat: discovering splice junctions with RNA-Seq

Trapnell, Cole ; Pachter, Lior ; Salzberg, Steven L.

Bioinformatics, 2009-05, Vol.25 (9), p.1105-1111 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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3
The Sequence Alignment/Map format and SAMtools
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The Sequence Alignment/Map format and SAMtools

Li, Heng ; Handsaker, Bob ; Wysoker, Alec ; Fennell, Tim ; Ruan, Jue ; Homer, Nils ; Marth, Gabor ; Abecasis, Goncalo ; Durbin, Richard

Bioinformatics, 2009-08, Vol.25 (16), p.2078-2079 [Periódico revisado por pares]

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4
DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data
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DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data

Librado, P. ; Rozas, J.

Bioinformatics, 2009-06, Vol.25 (11), p.1451-1452 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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5
Jalview Version 2—a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
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Jalview Version 2—a multiple sequence alignment editor and analysis workbench

Waterhouse, Andrew M. ; Procter, James B. ; Martin, David M. A. ; Clamp, Michèle ; Barton, Geoffrey J.

Bioinformatics, 2009-05, Vol.25 (9), p.1189-1191 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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6
SOAP2: an improved ultrafast tool for short read alignment
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SOAP2: an improved ultrafast tool for short read alignment

Li, Ruiqiang ; Yu, Chang ; Li, Yingrui ; Lam, Tak-Wah ; Yiu, Siu-Ming ; Kristiansen, Karsten ; Wang, Jun

Bioinformatics, 2009-08, Vol.25 (15), p.1966-1967 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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7
ClueGO: a Cytoscape plug-in to decipher functionally grouped gene ontology and pathway annotation networks
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ClueGO: a Cytoscape plug-in to decipher functionally grouped gene ontology and pathway annotation networks

Bindea, Gabriela ; Mlecnik, Bernhard ; Hackl, Hubert ; Charoentong, Pornpimol ; Tosolini, Marie ; Kirilovsky, Amos ; Fridman, Wolf-Herman ; Pagès, Franck ; Trajanoski, Zlatko ; Galon, Jérôme

Bioinformatics, 2009-04, Vol.25 (8), p.1091-1093 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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8
Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics
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Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics

Cock, Peter J. A. ; Antao, Tiago ; Chang, Jeffrey T. ; Chapman, Brad A. ; Cox, Cymon J. ; Dalke, Andrew ; Friedberg, Iddo ; Hamelryck, Thomas ; Kauff, Frank ; Wilczynski, Bartek ; de Hoon, Michiel J. L.

Bioinformatics, 2009-06, Vol.25 (11), p.1422-1423 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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9
adegenet: a R package for the multivariate analysis of genetic markers
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adegenet: a R package for the multivariate analysis of genetic markers

Jombart, Thibaut

Bioinformatics, 2008-06, Vol.24 (11), p.1403-1405 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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10
Clustal W and Clustal X version 2.0
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Clustal W and Clustal X version 2.0

Larkin, M.A. ; Blackshields, G. ; Brown, N.P. ; Chenna, R. ; McGettigan, P.A. ; McWilliam, H. ; Valentin, F. ; Wallace, I.M. ; Wilm, A. ; Lopez, R. ; Thompson, J.D. ; Gibson, T.J. ; Higgins, D.G.

Bioinformatics, 2007-11, Vol.23 (21), p.2947-2948 [Periódico revisado por pares]

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