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Nanopore sequencing technology, bioinformatics and applications
Nanopore sequencing technology, bioinformatics and applications
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Nanopore sequencing technology, bioinformatics and applications

Wang, Yunhao ; Zhao, Yue ; Bollas, Audrey ; Wang, Yuru ; Au, Kin Fai

Nature biotechnology, 2021-11, Vol.39 (11), p.1348-1365 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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Large-scale cis- and trans-eQTL analyses identify thousands of genetic loci and polygenic scores that regulate blood gene expression
Large-scale cis- and trans-eQTL analyses identify thousands of genetic loci and polygenic scores that regulate blood gene expression
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Large-scale cis- and trans-eQTL analyses identify thousands of genetic loci and polygenic scores that regulate blood gene expression

Võsa, Urmo ; Claringbould, Annique ; Bonder, Marc Jan ; Deelen, Patrick ; Zeng, Biao ; Kirsten, Holger ; Saha, Ashis ; Yazar, Seyhan ; Brugge, Harm ; Oelen, Roy ; van der Wijst, Monique G P ; Kasela, Silva ; Pervjakova, Natalia ; Alves, Isabel ; Favé, Marie-Julie ; Agbessi, Mawussé ; Christiansen, Mark W ; Jansen, Rick ; Seppälä, Ilkka ; Tong, Lin ; Teumer, Alexander ; Schramm, Katharina ; Verlouw, Joost ; Yaghootkar, Hanieh ; Sönmez Flitman, Reyhan ; Brown, Andrew ; Kukushkina, Viktorija ; Kalnapenkis, Anette ; Rüeger, Sina ; Porcu, Eleonora ; Kronberg, Jaanika ; Kettunen, Johannes ; Lee, Bernett ; Zhang, Futao ; Qi, Ting ; Hernandez, Jose Alquicira ; Arindrarto, Wibowo ; Beutner, Frank ; Dmitrieva, Julia ; Elansary, Mahmoud ; Fairfax, Benjamin P ; Georges, Michel ; Heijmans, Bastiaan T ; Hewitt, Alex W ; Kähönen, Mika ; Kim, Yungil ; Knight, Julian C ; Kovacs, Peter ; Krohn, Knut ; Li, Shuang ; Loeffler, Markus ; Marigorta, Urko M ; Mei, Hailang ; Momozawa, Yukihide ; Müller-Nurasyid, Martina ; Nauck, Matthias ; Nivard, Michel G ; Penninx, Brenda W J H ; Pritchard, Jonathan K ; Raitakari, Olli T ; Rotzschke, Olaf ; Slagboom, Eline P ; Stehouwer, Coen D A ; Stumvoll, Michael ; Sullivan, Patrick ; 't Hoen, Peter A C ; Thiery, Joachim ; Tönjes, Anke ; van Dongen, Jenny ; van Iterson, Maarten ; Völker, Uwe ; Warmerdam, Robert ; Wijmenga, Cisca ; Swertz, Morris ; Andiappan, Anand ; Montgomery, Grant W ; Ripatti, Samuli ; Perola, Markus ; Kutalik, Zoltan ; Dermitzakis, Emmanouil ; Bergmann, Sven ; Frayling, Timothy ; van Meurs, Joyce ; Prokisch, Holger ; Ahsan, Habibul ; Pierce, Brandon L ; Lehtimäki, Terho ; Psaty, Bruce M ; Gharib, Sina A ; Awadalla, Philip ; Milani, Lili ; Ouwehand, Willem H ; Downes, Kate ; Battle, Alexis ; Yang, Jian ; Scholz, Markus ; Powell, Joseph ; Gibson, Greg ; Esko, Tõnu ; Franke, Lude

Nature genetics, 2021-09, Vol.53 (9), p.1300-1310 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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3
A deep proteome and transcriptome abundance atlas of 29 healthy human tissues
A deep proteome and transcriptome abundance atlas of 29 healthy human tissues
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A deep proteome and transcriptome abundance atlas of 29 healthy human tissues

Wang, Dongxue ; Eraslan, Basak ; Wieland, Thomas ; Hallström, Björn ; Hopf, Thomas ; Zolg, Daniel Paul ; Zecha, Jana ; Asplund, Anna ; Li, Li‐hua ; Meng, Chen ; Frejno, Martin ; Schmidt, Tobias ; Schnatbaum, Karsten ; Wilhelm, Mathias ; Ponten, Frederik ; Uhlen, Mathias ; Gagneur, Julien ; Hahne, Hannes ; Kuster, Bernhard

Molecular systems biology, 2019-02, Vol.15 (2), p.e8503-n/a [Periódico revisado por pares]

England: EMBO Press

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Single-Cell Sequencing of Brain Cell Transcriptomes and Epigenomes
Single-Cell Sequencing of Brain Cell Transcriptomes and Epigenomes
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Single-Cell Sequencing of Brain Cell Transcriptomes and Epigenomes

Armand, Ethan J ; Li, Junhao ; Xie, Fangming ; Luo, Chongyuan ; Mukamel, Eran A

Neuron (Cambridge, Mass.), 2021-01, Vol.109 (1), p.11-26 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Limited

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5
Methods and applications for single-cell and spatial multi-omics
Methods and applications for single-cell and spatial multi-omics
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Methods and applications for single-cell and spatial multi-omics

Vandereyken, Katy ; Sifrim, Alejandro ; Thienpont, Bernard ; Voet, Thierry

Nature reviews. Genetics, 2023-08, Vol.24 (8), p.494-515 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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6
Integrative analyses of metabolome and genome‐wide transcriptome reveal the regulatory network governing flavor formation in kiwifruit (Actinidia chinensis)
Integrative analyses of metabolome and genome‐wide transcriptome reveal the regulatory network governing flavor formation in kiwifruit (Actinidia chinensis)
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Integrative analyses of metabolome and genome‐wide transcriptome reveal the regulatory network governing flavor formation in kiwifruit (Actinidia chinensis)

Wang, Ruochen ; Shu, Peng ; Zhang, Chi ; Zhang, Junlin ; Chen, Ya ; Zhang, Yaoxin ; Du, Kui ; Xie, Yue ; Li, Mingzhang ; Ma, Tao ; Zhang, Yang ; Li, Zhengguo ; Grierson, Don ; Pirrello, Julien ; Chen, Kunsong ; Bouzayen, Mondher ; Zhang, Bo ; Liu, Mingchun

The New phytologist, 2022-01, Vol.233 (1), p.373-389 [Periódico revisado por pares]

England: Wiley Subscription Services, Inc

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microRNAs in action: biogenesis, function and regulation
microRNAs in action: biogenesis, function and regulation
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microRNAs in action: biogenesis, function and regulation

Shang, Renfu ; Lee, Seungjae ; Senavirathne, Gayan ; Lai, Eric C

Nature reviews. Genetics, 2023-12, Vol.24 (12), p.816-833 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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Highly sensitive spatial transcriptomics at near-cellular resolution with Slide-seqV2
Highly sensitive spatial transcriptomics at near-cellular resolution with Slide-seqV2
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Highly sensitive spatial transcriptomics at near-cellular resolution with Slide-seqV2

Stickels, Robert R ; Murray, Evan ; Kumar, Pawan ; Li, Jilong ; Marshall, Jamie L ; Di Bella, Daniela J ; Arlotta, Paola ; Macosko, Evan Z ; Chen, Fei

Nature biotechnology, 2021-03, Vol.39 (3), p.313-319 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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rnaSPAdes: a de novo transcriptome assembler and its application to RNA-Seq data
rnaSPAdes: a de novo transcriptome assembler and its application to RNA-Seq data
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rnaSPAdes: a de novo transcriptome assembler and its application to RNA-Seq data

Bushmanova, Elena ; Antipov, Dmitry ; Lapidus, Alla ; Prjibelski, Andrey D

Gigascience, 2019-09, Vol.8 (9) [Periódico revisado por pares]

United States: Oxford University Press

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Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex
Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex
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Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex

Maynard, Kristen R ; Collado-Torres, Leonardo ; Weber, Lukas M ; Uytingco, Cedric ; Barry, Brianna K ; Williams, Stephen R ; Catallini, 2nd, Joseph L ; Tran, Matthew N ; Besich, Zachary ; Tippani, Madhavi ; Chew, Jennifer ; Yin, Yifeng ; Kleinman, Joel E ; Hyde, Thomas M ; Rao, Nikhil ; Hicks, Stephanie C ; Martinowich, Keri ; Jaffe, Andrew E

Nature neuroscience, 2021-03, Vol.24 (3), p.425-436 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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