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Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data
Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data
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Complex heatmaps reveal patterns and correlations in multidimensional genomic data

Gu, Zuguang ; Eils, Roland ; Schlesner, Matthias

Bioinformatics (Oxford, England), 2016-09, Vol.32 (18), p.2847-2849 [Periódico revisado por pares]

England

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PhenoScanner V2: an expanded tool for searching human genotype–phenotype associations
PhenoScanner V2: an expanded tool for searching human genotype–phenotype associations
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PhenoScanner V2: an expanded tool for searching human genotype–phenotype associations

Kamat, Mihir A ; Blackshaw, James A ; Young, Robin ; Surendran, Praveen ; Burgess, Stephen ; Danesh, John ; Butterworth, Adam S ; Staley, James R Kelso, Janet

Bioinformatics, 2019-11, Vol.35 (22), p.4851-4853 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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3
BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs
BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs
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BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs

Simão, Felipe A ; Waterhouse, Robert M ; Ioannidis, Panagiotis ; Kriventseva, Evgenia V ; Zdobnov, Evgeny M

Bioinformatics, 2015-10, Vol.31 (19), p.3210-3212 [Periódico revisado por pares]

England

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CoV-Spectrum: analysis of globally shared SARS-CoV-2 data to identify and characterize new variants
CoV-Spectrum: analysis of globally shared SARS-CoV-2 data to identify and characterize new variants
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CoV-Spectrum: analysis of globally shared SARS-CoV-2 data to identify and characterize new variants

Chen, Chaoran ; Nadeau, Sarah ; Yared, Michael ; Voinov, Philippe ; Xie, Ning ; Roemer, Cornelius ; Stadler, Tanja Alkan, Can

Bioinformatics, 2022-03, Vol.38 (6), p.1735-1737 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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5
HTSeq--a Python framework to work with high-throughput sequencing data
HTSeq--a Python framework to work with high-throughput sequencing data
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HTSeq--a Python framework to work with high-throughput sequencing data

Anders, Simon ; Pyl, Paul Theodor ; Huber, Wolfgang

Bioinformatics (Oxford, England), 2015-01, Vol.31 (2), p.166-169 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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6
Scater: pre-processing, quality control, normalization and visualization of single-cell RNA-seq data in R
Scater: pre-processing, quality control, normalization and visualization of single-cell RNA-seq data in R
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Scater: pre-processing, quality control, normalization and visualization of single-cell RNA-seq data in R

McCarthy, Davis J ; Campbell, Kieran R ; Lun, Aaron T L ; Wills, Quin F Hofacker, Ivo

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-04, Vol.33 (8), p.1179-1186 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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7
Predicting multicellular function through multi-layer tissue networks
Predicting multicellular function through multi-layer tissue networks
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Predicting multicellular function through multi-layer tissue networks

Zitnik, Marinka ; Leskovec, Jure

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-07, Vol.33 (14), p.i190-i198 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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8
SynergyFinder: a web application for analyzing drug combination dose-response matrix data
SynergyFinder: a web application for analyzing drug combination dose-response matrix data
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SynergyFinder: a web application for analyzing drug combination dose-response matrix data

Ianevski, Aleksandr ; He, Liye ; Aittokallio, Tero ; Tang, Jing Stegle, Oliver

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-08, Vol.33 (15), p.2413-2415 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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9
Manta: rapid detection of structural variants and indels for germline and cancer sequencing applications
Manta: rapid detection of structural variants and indels for germline and cancer sequencing applications
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Manta: rapid detection of structural variants and indels for germline and cancer sequencing applications

Chen, Xiaoyu ; Schulz-Trieglaff, Ole ; Shaw, Richard ; Barnes, Bret ; Schlesinger, Felix ; Källberg, Morten ; Cox, Anthony J ; Kruglyak, Semyon ; Saunders, Christopher T

Bioinformatics, 2016-04, Vol.32 (8), p.1220-1222 [Periódico revisado por pares]

England

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10
GOplot: an R package for visually combining expression data with functional analysis
GOplot: an R package for visually combining expression data with functional analysis
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GOplot: an R package for visually combining expression data with functional analysis

Walter, Wencke ; Sánchez-Cabo, Fátima ; Ricote, Mercedes

Bioinformatics (Oxford, England), 2015-09, Vol.31 (17), p.2912-2914 [Periódico revisado por pares]

England

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