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1
Ultra-fast FFT protein docking on graphics processors
Ultra-fast FFT protein docking on graphics processors
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Ultra-fast FFT protein docking on graphics processors

Ritchie, David W. ; Venkatraman, Vishwesh

Bioinformatics, 2010-10, Vol.26 (19), p.2398-2405 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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2
HexServer: an FFT-based protein docking server powered by graphics processors
HexServer: an FFT-based protein docking server powered by graphics processors
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HexServer: an FFT-based protein docking server powered by graphics processors

Macindoe, Gary ; Mavridis, Lazaros ; Venkatraman, Vishwesh ; Devignes, Marie-Dominique ; Ritchie, David W

Nucleic acids research, 2010-07, Vol.38 (Web Server issue), p.W445-W449 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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3
GrAPFI: predicting enzymatic function of proteins from domain similarity graphs
GrAPFI: predicting enzymatic function of proteins from domain similarity graphs
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GrAPFI: predicting enzymatic function of proteins from domain similarity graphs

Sarker, Bishnu ; Ritchie, David W ; Aridhi, Sabeur

BMC bioinformatics, 2020-04, Vol.21 (1), p.168-168, Article 168 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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4
Accelerating and focusing protein–protein docking correlations using multi-dimensional rotational FFT generating functions
Accelerating and focusing protein–protein docking correlations using multi-dimensional rotational FFT generating functions
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Accelerating and focusing protein–protein docking correlations using multi-dimensional rotational FFT generating functions

Ritchie, David W. ; Kozakov, Dima ; Vajda, Sandor

Bioinformatics, 2008-09, Vol.24 (17), p.1865-1873 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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5
Calculating and scoring high quality multiple flexible protein structure alignments
Calculating and scoring high quality multiple flexible protein structure alignments
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Calculating and scoring high quality multiple flexible protein structure alignments

Ritchie, David W

Bioinformatics (Oxford, England), 2016-09, Vol.32 (17), p.2650-2658 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press (OUP)

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6
Protein–protein docking by fast generalized Fourier transforms on 5D rotational manifolds
Protein–protein docking by fast generalized Fourier transforms on 5D rotational manifolds
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Protein–protein docking by fast generalized Fourier transforms on 5D rotational manifolds

Padhorny, Dzmitry ; Kazennov, Andrey ; Zerbe, Brandon S. ; Porter, Kathryn A. ; Xia, Bing ; Mottarella, Scott E. ; Kholodov, Yaroslav ; Ritchie, David W. ; Vajda, Sandor ; Kozakov, Dima

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2016-07, Vol.113 (30), p.E4286-E4293 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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7
PEPSI-Dock: a detailed data-driven protein-protein interaction potential accelerated by polar Fourier correlation
PEPSI-Dock: a detailed data-driven protein-protein interaction potential accelerated by polar Fourier correlation
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PEPSI-Dock: a detailed data-driven protein-protein interaction potential accelerated by polar Fourier correlation

Neveu, Emilie ; Ritchie, David W ; Popov, Petr ; Grudinin, Sergei

Bioinformatics (Oxford, England), 2016-09, Vol.32 (17), p.i693-i701 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press (OUP)

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8
T Cell Fitness and Autologous CAR T Cell Therapy in Haematologic Malignancy
T Cell Fitness and Autologous CAR T Cell Therapy in Haematologic Malignancy
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T Cell Fitness and Autologous CAR T Cell Therapy in Haematologic Malignancy

Mehta, Palak H ; Fiorenza, Salvatore ; Koldej, Rachel M ; Jaworowski, Anthony ; Ritchie, David S ; Quinn, Kylie M

Frontiers in immunology, 2021-11, Vol.12, p.780442-780442 [Periódico revisado por pares]

Switzerland: Frontiers Media S.A

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9
Computational discovery of direct associations between GO terms and protein domains
Computational discovery of direct associations between GO terms and protein domains
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Computational discovery of direct associations between GO terms and protein domains

Alborzi, Seyed Ziaeddin ; Ritchie, David W ; Devignes, Marie-Dominique

BMC bioinformatics, 2018-11, Vol.19 (Suppl 14), p.413-66, Article 413 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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10
Pediatric aplastic anemia treatment patterns and responses; power in the numbers
Pediatric aplastic anemia treatment patterns and responses; power in the numbers
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Pediatric aplastic anemia treatment patterns and responses; power in the numbers

Fox, Lucy C ; Ritchie, David S

Haematologica (Roma), 2019-10, Vol.104 (10), p.1909-1912 [Periódico revisado por pares]

Italy: Ferrata Storti Foundation

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