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1
A microfluidics-based in vitro model of the gastrointestinal human-microbe interface
A microfluidics-based in vitro model of the gastrointestinal human-microbe interface
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A microfluidics-based in vitro model of the gastrointestinal human-microbe interface

Shah, Pranjul ; Fritz, Joëlle V ; Glaab, Enrico ; Desai, Mahesh S ; Greenhalgh, Kacy ; Frachet, Audrey ; Niegowska, Magdalena ; Estes, Matthew ; Jäger, Christian ; Seguin-Devaux, Carole ; Zenhausern, Frederic ; Wilmes, Paul

Nature communications, 2016-05, Vol.7 (1), p.11535-11535, Article 11535 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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2
A deep learning system for prostate cancer diagnosis and grading in whole slide images of core needle biopsies
A deep learning system for prostate cancer diagnosis and grading in whole slide images of core needle biopsies
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A deep learning system for prostate cancer diagnosis and grading in whole slide images of core needle biopsies

Singhal, Nitin ; Soni, Shailesh ; Bonthu, Saikiran ; Chattopadhyay, Nilanjan ; Samanta, Pranab ; Joshi, Uttara ; Jojera, Amit ; Chharchhodawala, Taher ; Agarwal, Ankur ; Desai, Mahesh ; Ganpule, Arvind

Scientific reports, 2022-03, Vol.12 (1), p.3383-3383, Article 3383 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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3
Maternal diet and gut microbiome composition modulate early‐life immune development
Maternal diet and gut microbiome composition modulate early‐life immune development
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Maternal diet and gut microbiome composition modulate early‐life immune development

Grant, Erica T ; Boudaud, Marie ; Muller, Arnaud ; Macpherson, Andrew J ; Desai, Mahesh S

EMBO molecular medicine, 2023-08, Vol.15 (8), p.e17241-n/a [Periódico revisado por pares]

England: EMBO Press

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4
Diet-driven differential response of Akkermansia muciniphila modulates pathogen susceptibility
Diet-driven differential response of Akkermansia muciniphila modulates pathogen susceptibility
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Diet-driven differential response of Akkermansia muciniphila modulates pathogen susceptibility

Wolter, Mathis ; Grant, Erica T ; Boudaud, Marie ; Pudlo, Nicholas A ; Pereira, Gabriel V ; Eaton, Kathryn A ; Martens, Eric C ; Desai, Mahesh S

Molecular systems biology, 2024-05, Vol.20 (6), p.596-625 [Periódico revisado por pares]

London: Nature Publishing Group UK

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5
From meta-omics to causality: experimental models for human microbiome research
From meta-omics to causality: experimental models for human microbiome research
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From meta-omics to causality: experimental models for human microbiome research

Fritz, Joëlle V ; Desai, Mahesh S ; Shah, Pranjul ; Schneider, Jochen G ; Wilmes, Paul

Microbiome, 2013-05, Vol.1 (1), p.14-14, Article 14 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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6
The extracellular RNA complement of Escherichia coli
The extracellular RNA complement of Escherichia coli
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The extracellular RNA complement of Escherichia coli

Ghosal, Anubrata ; Upadhyaya, Bimal Babu ; Fritz, Joëlle V. ; Heintz‐Buschart, Anna ; Desai, Mahesh S. ; Yusuf, Dilmurat ; Huang, David ; Baumuratov, Aidos ; Wang, Kai ; Galas, David ; Wilmes, Paul

MicrobiologyOpen (Weinheim), 2015-04, Vol.4 (2), p.252-266 [Periódico revisado por pares]

England: John Wiley & Sons, Inc

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7
Concentrated Raw Fibers Enhance the Fiber-Degrading Capacity of a Synthetic Human Gut Microbiome
Concentrated Raw Fibers Enhance the Fiber-Degrading Capacity of a Synthetic Human Gut Microbiome
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Concentrated Raw Fibers Enhance the Fiber-Degrading Capacity of a Synthetic Human Gut Microbiome

Steimle, Alex ; Neumann, Mareike ; Grant, Erica T. ; Turner, Jonathan D. ; Desai, Mahesh S.

International journal of molecular sciences, 2021-06, Vol.22 (13), p.6855 [Periódico revisado por pares]

Basel: MDPI AG

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8
Akkermansia muciniphila and Parabacteroides distasonis synergistically protect from colitis by promoting ILC3 in the gut
Akkermansia muciniphila and Parabacteroides distasonis synergistically protect from colitis by promoting ILC3 in the gut
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Akkermansia muciniphila and Parabacteroides distasonis synergistically protect from colitis by promoting ILC3 in the gut

Gaifem, Joana ; Mendes-Frias, Ana ; Wolter, Mathis ; Steimle, Alex ; Garzón, Maria Jose ; Ubeda, Carles ; Nobre, Clarisse ; González, Abigail ; Pinho, Salomé S ; Cunha, Cristina ; Carvalho, Agostinho ; Castro, António Gil ; Desai, Mahesh S ; Rodrigues, Fernando ; Silvestre, Ricardo Comstock, Laurie E.

mBio, 2024-04, Vol.15 (4), p.e0007824 [Periódico revisado por pares]

United States: American Society for Microbiology

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9
Dietary Modulation Alters Susceptibility to Listeria monocytogenes and Salmonella Typhimurium with or without a Gut Microbiota
Dietary Modulation Alters Susceptibility to Listeria monocytogenes and Salmonella Typhimurium with or without a Gut Microbiota
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Dietary Modulation Alters Susceptibility to Listeria monocytogenes and Salmonella Typhimurium with or without a Gut Microbiota

Wolter, Mathis ; Steimle, Alex ; Parrish, Amy ; Zimmer, Jacques ; Desai, Mahesh S Rawls, John F ; Rawls, John F.

mSystems, 2021-12, Vol.6 (6), p.e0071721-e0071721 [Periódico revisado por pares]

United States: American Society for Microbiology

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10
Statistical and Machine Learning Techniques in Human Microbiome Studies: Contemporary Challenges and Solutions
Statistical and Machine Learning Techniques in Human Microbiome Studies: Contemporary Challenges and Solutions
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Statistical and Machine Learning Techniques in Human Microbiome Studies: Contemporary Challenges and Solutions

Moreno-Indias, Isabel ; Lahti, Leo ; Nedyalkova, Miroslava ; Elbere, Ilze ; Roshchupkin, Gennady ; Adilovic, Muhamed ; Aydemir, Onder ; Bakir-Gungor, Burcu ; Santa Pau, Enrique Carrillo-de ; D'Elia, Domenica ; Desai, Mahesh S ; Falquet, Laurent ; Gundogdu, Aycan ; Hron, Karel ; Klammsteiner, Thomas ; Lopes, Marta B ; Marcos-Zambrano, Laura Judith ; Marques, Cláudia ; Mason, Michael ; May, Patrick ; Pašić, Lejla ; Pio, Gianvito ; Pongor, Sándor ; Promponas, Vasilis J ; Przymus, Piotr ; Saez-Rodriguez, Julio ; Sampri, Alexia ; Shigdel, Rajesh ; Stres, Blaz ; Suharoschi, Ramona ; Truu, Jaak ; Truică, Ciprian-Octavian ; Vilne, Baiba ; Vlachakis, Dimitrios ; Yilmaz, Ercument ; Zeller, Georg ; Zomer, Aldert L ; Gómez-Cabrero, David ; Claesson, Marcus J

Frontiers in microbiology, 2021-02, Vol.12, p.635781-635781 [Periódico revisado por pares]

Switzerland: Frontiers Media S.A

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