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The scale bar represents the number of inferred substitutions per 100 sites (amino acid residues)
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Sanchez-Pulido, Luis ; Rojas, Ana M ; Valencia, Alfonso ; Martínez-A, Carlos ; Andrade, Miguel A

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Modular arrangements of sequences containing the NEAT domain
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Andrade, Miguel A ; Ciccarelli, Francesca D ; Perez-Iratxeta, Carolina ; Bork, Peer

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Conserved genome organization around the components of a putative Fe siderophore transporter (from STRING 26,27 or from the literature when the genome is not present in STRING)
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Andrade, Miguel A ; Ciccarelli, Francesca D ; Perez-Iratxeta, Carolina ; Bork, Peer

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Multiple alignment of the occurrences of the NEAT domain, generated with the ClustalW program 28
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Andrade, Miguel A ; Ciccarelli, Francesca D ; Perez-Iratxeta, Carolina ; Bork, Peer

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Phylogenetic tree of the domain instances generated from the multiple alignment shown in Figure
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Andrade, Miguel A ; Ciccarelli, Francesca D ; Perez-Iratxeta, Carolina ; Bork, Peer

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The numbers correspond to HMMer E-values from global profile search results 20, 21 that connect independently each family with the others
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Sanchez-Pulido, Luis ; Rojas, Ana M ; Valencia, Alfonso ; Martínez-A, Carlos ; Andrade, Miguel A

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It is viewed with the Belvu program 33
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Sanchez-Pulido, Luis ; Rojas, Ana M ; Valencia, Alfonso ; Martínez-A, Carlos ; Andrade, Miguel A

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The representative sequences selected correspond to: YEDZ, SW:YEDZ ECOLI; STEAP, SW:STEA HUMAN; TSAP6, SP:Q80ZF3; NOX1, SW:NOX1 HUMAN; NOX5, SP:Q96PH2; DUOX1, SP:Q9NRD9
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Precision/Recall curves for genes selected by the gap method and k-means
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Krzyzanowski, Paul M ; Andrade-Navarro, Miguel A

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Phylogenetic distribution of stem cell markers and their close paralogs in four protein families
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  1. Andrade, A
  2. Motta, P

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