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Accurate De Novo Prediction of Protein Contact Map by Ultra-Deep Learning Model
Accurate De Novo Prediction of Protein Contact Map by Ultra-Deep Learning Model
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Accurate De Novo Prediction of Protein Contact Map by Ultra-Deep Learning Model

Wang, Sheng ; Sun, Siqi ; Li, Zhen ; Zhang, Renyu ; Xu, Jinbo Schlessinger, Avner

PLoS computational biology, 2017-01, Vol.13 (1), p.e1005324-e1005324 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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2
DeepConv-DTI: Prediction of drug-target interactions via deep learning with convolution on protein sequences
DeepConv-DTI: Prediction of drug-target interactions via deep learning with convolution on protein sequences
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DeepConv-DTI: Prediction of drug-target interactions via deep learning with convolution on protein sequences

Lee, Ingoo ; Keum, Jongsoo ; Nam, Hojung Briggs, James M.

PLoS computational biology, 2019-06, Vol.15 (6), p.e1007129 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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3
IBS: an illustrator for the presentation and visualization of biological sequences
IBS: an illustrator for the presentation and visualization of biological sequences
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IBS: an illustrator for the presentation and visualization of biological sequences

Liu, Wenzhong ; Xie, Yubin ; Ma, Jiyong ; Luo, Xiaotong ; Nie, Peng ; Zuo, Zhixiang ; Lahrmann, Urs ; Zhao, Qi ; Zheng, Yueyuan ; Zhao, Yong ; Xue, Yu ; Ren, Jian

Bioinformatics, 2015-10, Vol.31 (20), p.3359-3361 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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4
Fluorescence lifetime imaging microscopy: fundamentals and advances in instrumentation, analysis, and applications
Fluorescence lifetime imaging microscopy: fundamentals and advances in instrumentation, analysis, and applications
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Fluorescence lifetime imaging microscopy: fundamentals and advances in instrumentation, analysis, and applications

Datta, Rupsa ; Heaster, Tiffany M ; Sharick, Joe T ; Gillette, Amani A ; Skala, Melissa C

Journal of biomedical optics, 2020-07, Vol.25 (7), p.071203-071203 [Periódico revisado por pares]

United States: Society of Photo-Optical Instrumentation Engineers

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5
MDHGI: Matrix Decomposition and Heterogeneous Graph Inference for miRNA-disease association prediction
MDHGI: Matrix Decomposition and Heterogeneous Graph Inference for miRNA-disease association prediction
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MDHGI: Matrix Decomposition and Heterogeneous Graph Inference for miRNA-disease association prediction

Chen, Xing ; Yin, Jun ; Qu, Jia ; Huang, Li Wang, Edwin

PLoS computational biology, 2018-08, Vol.14 (8), p.e1006418-e1006418 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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6
MitoHiFi: a python pipeline for mitochondrial genome assembly from PacBio high fidelity reads
MitoHiFi: a python pipeline for mitochondrial genome assembly from PacBio high fidelity reads
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MitoHiFi: a python pipeline for mitochondrial genome assembly from PacBio high fidelity reads

Uliano-Silva, Marcela ; Ferreira, João Gabriel R N ; Krasheninnikova, Ksenia ; Formenti, Giulio ; Abueg, Linelle ; Torrance, James ; Myers, Eugene W ; Durbin, Richard ; Blaxter, Mark ; McCarthy, Shane A

BMC bioinformatics, 2023-07, Vol.24 (1), p.288-288, Article 288 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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7
InterProScan 5: genome-scale protein function classification
InterProScan 5: genome-scale protein function classification
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InterProScan 5: genome-scale protein function classification

Jones, Philip ; Binns, David ; Chang, Hsin-Yu ; Fraser, Matthew ; Li, Weizhong ; McAnulla, Craig ; McWilliam, Hamish ; Maslen, John ; Mitchell, Alex ; Nuka, Gift ; Pesseat, Sebastien ; Quinn, Antony F ; Sangrador-Vegas, Amaia ; Scheremetjew, Maxim ; Yong, Siew-Yit ; Lopez, Rodrigo ; Hunter, Sarah

Bioinformatics, 2014-05, Vol.30 (9), p.1236-1240 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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8
Accelerated Profile HMM Searches
Accelerated Profile HMM Searches
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Accelerated Profile HMM Searches

Eddy, Sean R Pearson, William R.

PLoS computational biology, 2011-10, Vol.7 (10), p.e1002195-e1002195 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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9
MEGAN Community Edition - Interactive Exploration and Analysis of Large-Scale Microbiome Sequencing Data
MEGAN Community Edition - Interactive Exploration and Analysis of Large-Scale Microbiome Sequencing Data
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MEGAN Community Edition - Interactive Exploration and Analysis of Large-Scale Microbiome Sequencing Data

Huson, Daniel H ; Beier, Sina ; Flade, Isabell ; Górska, Anna ; El-Hadidi, Mohamed ; Mitra, Suparna ; Ruscheweyh, Hans-Joachim ; Tappu, Rewati Poisot, Timothée

PLoS computational biology, 2016-06, Vol.12 (6), p.e1004957-e1004957 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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10
Modeling aspects of the language of life through transfer-learning protein sequences
Modeling aspects of the language of life through transfer-learning protein sequences
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Modeling aspects of the language of life through transfer-learning protein sequences

Heinzinger, Michael ; Elnaggar, Ahmed ; Wang, Yu ; Dallago, Christian ; Nechaev, Dmitrii ; Matthes, Florian ; Rost, Burkhard

BMC bioinformatics, 2019-12, Vol.20 (1), p.723-723, Article 723 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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