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GTDB-Tk: a toolkit to classify genomes with the Genome Taxonomy Database
GTDB-Tk: a toolkit to classify genomes with the Genome Taxonomy Database
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GTDB-Tk: a toolkit to classify genomes with the Genome Taxonomy Database

Chaumeil, Pierre-Alain ; Mussig, Aaron J ; Hugenholtz, Philip ; Parks, Donovan H Hancock, John

Bioinformatics, 2019-11, Vol.36 (6), p.1925-1927 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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2
UpSetR: an R package for the visualization of intersecting sets and their properties
UpSetR: an R package for the visualization of intersecting sets and their properties
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UpSetR: an R package for the visualization of intersecting sets and their properties

Conway, Jake R ; Lex, Alexander ; Gehlenborg, Nils Hancock, John

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-09, Vol.33 (18), p.2938-2940 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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3
GTDB-Tk v2: memory friendly classification with the genome taxonomy database
GTDB-Tk v2: memory friendly classification with the genome taxonomy database
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

GTDB-Tk v2: memory friendly classification with the genome taxonomy database

Chaumeil, Pierre-Alain ; Mussig, Aaron J ; Hugenholtz, Philip ; Parks, Donovan H Borgwardt, Karsten

Bioinformatics (Oxford, England), 2022-11, Vol.38 (23), p.5315-5316 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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4
YaHS: yet another Hi-C scaffolding tool
YaHS: yet another Hi-C scaffolding tool
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YaHS: yet another Hi-C scaffolding tool

Zhou, Chenxi ; McCarthy, Shane A ; Durbin, Richard Alkan, Can

Bioinformatics (Oxford, England), 2023-01, Vol.39 (1) [Periódico revisado por pares]

England

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5
GraphDTA: predicting drug–target binding affinity with graph neural networks
GraphDTA: predicting drug–target binding affinity with graph neural networks
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GraphDTA: predicting drug–target binding affinity with graph neural networks

Nguyen, Thin ; Le, Hang ; Quinn, Thomas P ; Nguyen, Tri ; Le, Thuc Duy ; Venkatesh, Svetha Pier Luigi, Martelli

Bioinformatics, 2021-05, Vol.37 (8), p.1140-1147 [Periódico revisado por pares]

Oxford University Press

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6
MAFFT online service: multiple sequence alignment, interactive sequence choice and visualization
MAFFT online service: multiple sequence alignment, interactive sequence choice and visualization
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MAFFT online service: multiple sequence alignment, interactive sequence choice and visualization

Katoh, Kazutaka ; Rozewicki, John ; Yamada, Kazunori D

Briefings in bioinformatics, 2019-07, Vol.20 (4), p.1160-1166 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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7
ape 5.0: an environment for modern phylogenetics and evolutionary analyses in R
ape 5.0: an environment for modern phylogenetics and evolutionary analyses in R
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ape 5.0: an environment for modern phylogenetics and evolutionary analyses in R

Paradis, Emmanuel ; Schliep, Klaus Schwartz, Russell

Bioinformatics, 2019-02, Vol.35 (3), p.526-528 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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8
BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs
BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs
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BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs

Simão, Felipe A ; Waterhouse, Robert M ; Ioannidis, Panagiotis ; Kriventseva, Evgenia V ; Zdobnov, Evgeny M

Bioinformatics, 2015-10, Vol.31 (19), p.3210-3212 [Periódico revisado por pares]

England

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9
BioBERT: a pre-trained biomedical language representation model for biomedical text mining
BioBERT: a pre-trained biomedical language representation model for biomedical text mining
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BioBERT: a pre-trained biomedical language representation model for biomedical text mining

Lee, Jinhyuk ; Yoon, Wonjin ; Kim, Sungdong ; Kim, Donghyeon ; Kim, Sunkyu ; So, Chan Ho ; Kang, Jaewoo Wren, Jonathan

Bioinformatics, 2020-02, Vol.36 (4), p.1234-1240 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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10
Parallelization of MAFFT for large-scale multiple sequence alignments
Parallelization of MAFFT for large-scale multiple sequence alignments
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Parallelization of MAFFT for large-scale multiple sequence alignments

Nakamura, Tsukasa ; Yamada, Kazunori D ; Tomii, Kentaro ; Katoh, Kazutaka Hancock, John

Bioinformatics, 2018-07, Vol.34 (14), p.2490-2492 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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