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1
PyRates-A code-generation tool for modeling dynamical systems in biology and beyond
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PyRates-A code-generation tool for modeling dynamical systems in biology and beyond

Gast, Richard ; Knösche, Thomas R ; Kennedy, Ann Marinazzo, Daniele

PLoS computational biology, 2023-12, Vol.19 (12), p.e1011761-e1011761 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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2
Bellman's GAP--a language and compiler for dynamic programming in sequence analysis
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Bellman's GAP--a language and compiler for dynamic programming in sequence analysis

Sauthoff, Georg ; Möhl, Mathias ; Janssen, Stefan ; Giegerich, Robert

Bioinformatics, 2013-03, Vol.29 (5), p.551-560 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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3
A software tool for assessing the performance of and implementing water distribution system solution methods
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A software tool for assessing the performance of and implementing water distribution system solution methods

Qiu, Mengning ; Alexander, Bradley ; Simpson, Angus R. ; Elhay, Sylvan

Environmental modelling & software : with environment data news, 2019-02, Vol.112, p.52-69 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Elsevier Ltd

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4
DLRS: gene tree evolution in light of a species tree
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DLRS: gene tree evolution in light of a species tree

SJÖSTRAND, Joel ; SENNBLAD, Bengt ; ARVESTAD, Lars ; LAGERGREN, Jens

Bioinformatics, 2012-11, Vol.28 (22), p.2994-2995 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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5
circlize Implements and enhances circular visualization in R
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circlize Implements and enhances circular visualization in R

Gu, Zuguang ; Gu, Lei ; Eils, Roland ; Schlesner, Matthias ; Brors, Benedikt

Bioinformatics (Oxford, England), 2014-10, Vol.30 (19), p.2811-2812 [Periódico revisado por pares]

England

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6
An Introduction to Programming for Bioscientists: A Python-Based Primer
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An Introduction to Programming for Bioscientists: A Python-Based Primer

Ekmekci, Berk ; McAnany, Charles E ; Mura, Cameron Ouellette, Francis

PLoS computational biology, 2016-06, Vol.12 (6), p.e1004867-e1004867 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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7
A5-miseq: an updated pipeline to assemble microbial genomes from Illumina MiSeq data
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A5-miseq: an updated pipeline to assemble microbial genomes from Illumina MiSeq data

Coil, David ; Jospin, Guillaume ; Darling, Aaron E

Bioinformatics (Oxford, England), 2015-02, Vol.31 (4), p.587-589 [Periódico revisado por pares]

England

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8
geiger v2.0: an expanded suite of methods for fitting macroevolutionary models to phylogenetic trees
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geiger v2.0: an expanded suite of methods for fitting macroevolutionary models to phylogenetic trees

Pennell, Matthew W ; Eastman, Jonathan M ; Slater, Graham J ; Brown, Joseph W ; Uyeda, Josef C ; FitzJohn, Richard G ; Alfaro, Michael E ; Harmon, Luke J

Bioinformatics (Oxford, England), 2014-08, Vol.30 (15), p.2216-2218 [Periódico revisado por pares]

England

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9
Geneious Basic: An integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data
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Geneious Basic: An integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data

KEARSE, Matthew ; MOIR, Richard ; THIERER, Tobias ; ASHTON, Bruce ; MEINTJES, Peter ; DRUMMOND, Alexei ; WILSON, Amy ; STONES-HAVAS, Steven ; CHEUNG, Matthew ; STURROCK, Shane ; BUXTON, Simon ; COOPER, Alex ; MARKOWITZ, Sidney ; DURAN, Chris

Bioinformatics (Oxford, England), 2012-06, Vol.28 (12), p.1647-1649 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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10
LPmerge: an R package for merging genetic maps by linear programming
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LPmerge: an R package for merging genetic maps by linear programming

Endelman, Jeffrey B ; Plomion, Christophe

Bioinformatics, 2014-06, Vol.30 (11), p.1623-1624 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press (OUP)

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