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Pervasive domestication of defective prophages by bacteria
Pervasive domestication of defective prophages by bacteria
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Pervasive domestication of defective prophages by bacteria

Bobay, Louis-Marie ; Touchon, Marie ; Rocha, Eduardo P. C.

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2014-08, Vol.111 (33), p.12127-12132 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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2
CRISPRCasFinder, an update of CRISRFinder, includes a portable version, enhanced performance and integrates search for Cas proteins
CRISPRCasFinder, an update of CRISRFinder, includes a portable version, enhanced performance and integrates search for Cas proteins
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CRISPRCasFinder, an update of CRISRFinder, includes a portable version, enhanced performance and integrates search for Cas proteins

Couvin, David ; Bernheim, Aude ; Toffano-Nioche, Claire ; Touchon, Marie ; Michalik, Juraj ; Néron, Bertrand ; Rocha, Eduardo P C ; Vergnaud, Gilles ; Gautheret, Daniel ; Pourcel, Christine

Nucleic acids research, 2018-07, Vol.46 (W1), p.W246-W251 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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3
Neutral Theory, Microbial Practice: Challenges in Bacterial Population Genetics
Neutral Theory, Microbial Practice: Challenges in Bacterial Population Genetics
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Neutral Theory, Microbial Practice: Challenges in Bacterial Population Genetics

Rocha, Eduardo P C Kumar, Sudhir

Molecular biology and evolution, 2018-06, Vol.35 (6), p.1338-1347 [Periódico revisado por pares]

United States: Oxford University Press (OUP)

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4
Mobility of Plasmids
Mobility of Plasmids
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Mobility of Plasmids

SMILLIE, Chris ; GARCILLAN-BARCIA, M. Pilar ; FRANCIA, M. Victoria ; ROCHA, Eduardo P. C ; DE LA CRUZ, Fernando

Microbiology and Molecular Biology Reviews, 2010-09, Vol.74 (3), p.434-452 [Periódico revisado por pares]

Washington, DC: American Society for Microbiology

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5
The repertoire of ICE in prokaryotes underscores the unity, diversity, and ubiquity of conjugation
The repertoire of ICE in prokaryotes underscores the unity, diversity, and ubiquity of conjugation
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The repertoire of ICE in prokaryotes underscores the unity, diversity, and ubiquity of conjugation

Guglielmini, Julien ; Quintais, Leonor ; Garcillán-Barcia, Maria Pilar ; de la Cruz, Fernando ; Rocha, Eduardo P C Casadesús, Josep

PLoS genetics, 2011-08, Vol.7 (8), p.e1002222-e1002222 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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6
The systemic imprint of growth and its uses in ecological (meta)genomics
The systemic imprint of growth and its uses in ecological (meta)genomics
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The systemic imprint of growth and its uses in ecological (meta)genomics

Vieira-Silva, Sara ; Rocha, Eduardo P C Moran, Nancy A.

PLoS genetics, 2010-01, Vol.6 (1), p.e1000808 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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7
Embracing the enemy: the diversification of microbial gene repertoires by phage-mediated horizontal gene transfer
Embracing the enemy: the diversification of microbial gene repertoires by phage-mediated horizontal gene transfer
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Embracing the enemy: the diversification of microbial gene repertoires by phage-mediated horizontal gene transfer

Touchon, Marie ; Moura de Sousa, Jorge A ; Rocha, Eduardo PC

Current opinion in microbiology, 2017-08, Vol.38, p.66-73 [Periódico revisado por pares]

England: Elsevier Ltd

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8
After the bottleneck: Genome-wide diversification of the Mycobacterium tuberculosis complex by mutation, recombination, and natural selection
After the bottleneck: Genome-wide diversification of the Mycobacterium tuberculosis complex by mutation, recombination, and natural selection
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After the bottleneck: Genome-wide diversification of the Mycobacterium tuberculosis complex by mutation, recombination, and natural selection

Namouchi, Amine ; Didelot, Xavier ; Schöck, Ulrike ; Gicquel, Brigitte ; Rocha, Eduardo P C

Genome research, 2012-04, Vol.22 (4), p.721-734 [Periódico revisado por pares]

United States: Cold Spring Harbor Laboratory Press

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9
What traits are carried on mobile genetic elements, and why?
What traits are carried on mobile genetic elements, and why?
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What traits are carried on mobile genetic elements, and why?

Rankin, D J ; Rocha, E P C ; Brown, S P

Heredity, 2011-01, Vol.106 (1), p.1-10 [Periódico revisado por pares]

England: Springer Nature B.V

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10
Unlinked rRNA genes are widespread among bacteria and archaea
Unlinked rRNA genes are widespread among bacteria and archaea
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Unlinked rRNA genes are widespread among bacteria and archaea

Brewer, Tess E ; Albertsen, Mads ; Edwards, Arwyn ; Kirkegaard, Rasmus H ; Rocha, Eduardo P C ; Fierer, Noah

The ISME Journal, 2020-02, Vol.14 (2), p.597-608 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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