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GB2sequin - A file converter preparing custom GenBank files for database submission
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GB2sequin - A file converter preparing custom GenBank files for database submission

Lehwark, Pascal ; Greiner, Stephan

Genomics (San Diego, Calif.), 2019-07, Vol.111 (4), p.759-761 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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12
Haplotype phasing: existing methods and new developments
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Haplotype phasing: existing methods and new developments

Browning, Sharon R ; Browning, Brian L

Nature reviews. Genetics, 2011-10, Vol.12 (10), p.703-714 [Periódico revisado por pares]

London: Nature Publishing Group

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13
Progress, Challenges, and Surprises in Annotating the Human Genome
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Progress, Challenges, and Surprises in Annotating the Human Genome

Zerbino, Daniel R ; Frankish, Adam ; Flicek, Paul

Annual review of genomics and human genetics, 2020-08, Vol.21 (1), p.55-79 [Periódico revisado por pares]

United States: Annual Reviews

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14
A New Reference Genome Assembly for the Microcrustacean Daphnia pulex
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A New Reference Genome Assembly for the Microcrustacean Daphnia pulex

Ye, Zhiqiang ; Xu, Sen ; Spitze, Ken ; Asselman, Jana ; Jiang, Xiaoqian ; Ackerman, Matthew S ; Lopez, Jacqueline ; Harker, Brent ; Raborn, R Taylor ; Thomas, W Kelley ; Ramsdell, Jordan ; Pfrender, Michael E ; Lynch, Michael

G3 : genes - genomes - genetics, 2017-05, Vol.7 (5), p.1405-1416 [Periódico revisado por pares]

United States: Genetics Society of America

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15
Identifying pseudoenzymes using functional annotation: pitfalls of common practice
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Identifying pseudoenzymes using functional annotation: pitfalls of common practice

Ribeiro, Antonio J. M. ; Tyzack, Jonathan D. ; Borkakoti, Neera ; Thornton, Janet M.

The FEBS journal, 2020-10, Vol.287 (19), p.4128-4140 [Periódico revisado por pares]

England: Blackwell Publishing Ltd

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16
Improving GENCODE reference gene annotation using a high-stringency proteogenomics workflow
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Improving GENCODE reference gene annotation using a high-stringency proteogenomics workflow

Wright, James C ; Mudge, Jonathan ; Weisser, Hendrik ; Barzine, Mitra P ; Gonzalez, Jose M ; Brazma, Alvis ; Choudhary, Jyoti S ; Harrow, Jennifer

Nature communications, 2016-06, Vol.7 (1), p.11778-11778, Article 11778 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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17
SEED servers: high-performance access to the SEED genomes, annotations, and metabolic models
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SEED servers: high-performance access to the SEED genomes, annotations, and metabolic models

Aziz, Ramy K ; Devoid, Scott ; Disz, Terrence ; Edwards, Robert A ; Henry, Christopher S ; Olsen, Gary J ; Olson, Robert ; Overbeek, Ross ; Parrello, Bruce ; Pusch, Gordon D ; Stevens, Rick L ; Vonstein, Veronika ; Xia, Fangfang Ahmed, Niyaz

PloS one, 2012-10, Vol.7 (10), p.e48053-e48053 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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18
Twelve quick steps for genome assembly and annotation in the classroom
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Twelve quick steps for genome assembly and annotation in the classroom

Jung, Hyungtaek ; Ventura, Tomer ; Chung, J Sook ; Kim, Woo-Jin ; Nam, Bo-Hye ; Kong, Hee Jeong ; Kim, Young-Ok ; Jeon, Min-Seung ; Eyun, Seong-Il Ouellette, Francis

PLoS computational biology, 2020-11, Vol.16 (11), p.e1008325-e1008325 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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19
Evaluation of chloroplast genome annotation tools and application to analysis of the evolution of coffee species
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Evaluation of chloroplast genome annotation tools and application to analysis of the evolution of coffee species

Guyeux, Christophe ; Charr, Jean-Claude ; Tran, Hue T M ; Furtado, Agnelo ; Henry, Robert J ; Crouzillat, Dominique ; Guyot, Romain ; Hamon, Perla Chiang, Tzen-Yuh

PloS one, 2019-06, Vol.14 (6), p.e0216347-e0216347 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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20
Accurate Transposable Element Annotation Is Vital When Analyzing New Genome Assemblies
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Accurate Transposable Element Annotation Is Vital When Analyzing New Genome Assemblies

Platt, 2nd, Roy N ; Blanco-Berdugo, Laura ; Ray, David A

Genome biology and evolution, 2016-02, Vol.8 (2), p.403-410

England: Oxford University Press

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