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1
Propagating annotations of molecular networks using in silico fragmentation
Propagating annotations of molecular networks using in silico fragmentation
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Propagating annotations of molecular networks using in silico fragmentation

da Silva, Ricardo R ; Wang, Mingxun ; Nothias, Louis-Félix ; van der Hooft, Justin J J ; Caraballo-Rodríguez, Andrés Mauricio ; Fox, Evan ; Balunas, Marcy J ; Klassen, Jonathan L ; Lopes, Norberto Peporine ; Dorrestein, Pieter C Schlessinger, Avner

PLoS computational biology, 2018-04, Vol.14 (4), p.e1006089-e1006089 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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2
A hybrid MBE-based growth method for large-area synthesis of stacked hexagonal boron nitride/graphene heterostructures
A hybrid MBE-based growth method for large-area synthesis of stacked hexagonal boron nitride/graphene heterostructures
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A hybrid MBE-based growth method for large-area synthesis of stacked hexagonal boron nitride/graphene heterostructures

Wofford, Joseph M ; Nakhaie, Siamak ; Krause, Thilo ; Liu, Xianjie ; Ramsteiner, Manfred ; Hanke, Michael ; Riechert, Henning ; J Lopes, J Marcelo

Scientific reports, 2017-02, Vol.7 (1), p.43644-43644, Article 43644 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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3
Identification of mammalian-adapting mutations in the polymerase complex of an avian H5N1 influenza virus
Identification of mammalian-adapting mutations in the polymerase complex of an avian H5N1 influenza virus
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Identification of mammalian-adapting mutations in the polymerase complex of an avian H5N1 influenza virus

Taft, Andrew S ; Ozawa, Makoto ; Fitch, Adam ; Depasse, Jay V ; Halfmann, Peter J ; Hill-Batorski, Lindsay ; Hatta, Masato ; Friedrich, Thomas C ; Lopes, Tiago J S ; Maher, Eileen A ; Ghedin, Elodie ; Macken, Catherine A ; Neumann, Gabriele ; Kawaoka, Yoshihiro

Nature communications, 2015-06, Vol.6 (1), p.7491-7491, Article 7491 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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4
Contribution of the buffer layer to the Raman spectrum of epitaxial graphene on SiC(0001)
Contribution of the buffer layer to the Raman spectrum of epitaxial graphene on SiC(0001)
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Contribution of the buffer layer to the Raman spectrum of epitaxial graphene on SiC(0001)

Fromm, F ; Oliveira Jr, M H ; Molina-Sánchez, A ; Hundhausen, M ; Lopes, J M J ; Riechert, H ; Wirtz, L ; Seyller, T

New journal of physics, 2013-04, Vol.15 (4), p.43031-11 [Periódico revisado por pares]

IOP Publishing

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5
Protein residue network analysis reveals fundamental properties of the human coagulation factor VIII
Protein residue network analysis reveals fundamental properties of the human coagulation factor VIII
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Protein residue network analysis reveals fundamental properties of the human coagulation factor VIII

Lopes, Tiago J. S. ; Rios, Ricardo ; Nogueira, Tatiane ; Mello, Rodrigo F.

Scientific reports, 2021-06, Vol.11 (1), p.12625-12625, Article 12625 [Periódico revisado por pares]

London: Nature Publishing Group

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6
Integrating Transcriptomic and Proteomic Data Using Predictive Regulatory Network Models of Host Response to Pathogens
Integrating Transcriptomic and Proteomic Data Using Predictive Regulatory Network Models of Host Response to Pathogens
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Integrating Transcriptomic and Proteomic Data Using Predictive Regulatory Network Models of Host Response to Pathogens

Chasman, Deborah ; Walters, Kevin B ; Lopes, Tiago J S ; Eisfeld, Amie J ; Kawaoka, Yoshihiro ; Roy, Sushmita Leslie, Christina S.

PLoS computational biology, 2016-07, Vol.12 (7), p.e1005013-e1005013 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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7
A Machine Learning Framework Predicts the Clinical Severity of Hemophilia B Caused by Point-Mutations
A Machine Learning Framework Predicts the Clinical Severity of Hemophilia B Caused by Point-Mutations
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A Machine Learning Framework Predicts the Clinical Severity of Hemophilia B Caused by Point-Mutations

Lopes, Tiago J. S. ; Nogueira, Tatiane ; Rios, Ricardo

Frontiers in bioinformatics, 2022-06, Vol.2, p.912112-912112 [Periódico revisado por pares]

Frontiers Media S.A

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8
Candida Infections and Therapeutic Strategies: Mechanisms of Action for Traditional and Alternative Agents
Candida Infections and Therapeutic Strategies: Mechanisms of Action for Traditional and Alternative Agents
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Candida Infections and Therapeutic Strategies: Mechanisms of Action for Traditional and Alternative Agents

de Oliveira Santos, Giselle C ; Vasconcelos, Cleydlenne C ; Lopes, Alberto J O ; de Sousa Cartágenes, Maria do S ; Filho, Allan K D B ; do Nascimento, Flávia R F ; Ramos, Ricardo M ; Pires, Emygdia R R B ; de Andrade, Marcelo S ; Rocha, Flaviane M G ; de Andrade Monteiro, Cristina

Frontiers in microbiology, 2018-07, Vol.9, p.1351-1351 [Periódico revisado por pares]

Switzerland: Frontiers Media S.A

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9
Adding protein context to the human protein-protein interaction network to reveal meaningful interactions
Adding protein context to the human protein-protein interaction network to reveal meaningful interactions
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Adding protein context to the human protein-protein interaction network to reveal meaningful interactions

Schaefer, Martin H ; Lopes, Tiago J S ; Mah, Nancy ; Shoemaker, Jason E ; Matsuoka, Yukiko ; Fontaine, Jean-Fred ; Louis-Jeune, Caroline ; Eisfeld, Amie J ; Neumann, Gabriele ; Perez-Iratxeta, Carol ; Kawaoka, Yoshihiro ; Kitano, Hiroaki ; Andrade-Navarro, Miguel A Rzhetsky, Andrey

PLoS computational biology, 2013-01, Vol.9 (1), p.e1002860-e1002860 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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10
Molecular parallelisms between pigmentation in the avian iris and the integument of ectothermic vertebrates
Molecular parallelisms between pigmentation in the avian iris and the integument of ectothermic vertebrates
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Molecular parallelisms between pigmentation in the avian iris and the integument of ectothermic vertebrates

Andrade, Pedro ; Gazda, Małgorzata A ; Araújo, Pedro M ; Afonso, Sandra ; Rasmussen, Jacob A ; Marques, Cristiana I ; Lopes, Ricardo J ; Gilbert, M Thomas P ; Carneiro, Miguel Dyer, Kelly A.

PLoS genetics, 2021-02, Vol.17 (2), p.e1009404 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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