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GATK hard filtering: tunable parameters to improve variant calling for next generation sequencing targeted gene panel data
GATK hard filtering: tunable parameters to improve variant calling for next generation sequencing targeted gene panel data
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GATK hard filtering: tunable parameters to improve variant calling for next generation sequencing targeted gene panel data

De Summa, Simona ; Malerba, Giovanni ; Pinto, Rosamaria ; Mori, Antonio ; Mijatovic, Vladan ; Tommasi, Stefania

BMC bioinformatics, 2017-03, Vol.18 (Suppl 5), p.119-119 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central

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12
Transcriptome sequencing and de novo analysis for Yesso scallop (Patinopecten yessoensis) using 454 GS FLX
Transcriptome sequencing and de novo analysis for Yesso scallop (Patinopecten yessoensis) using 454 GS FLX
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Transcriptome sequencing and de novo analysis for Yesso scallop (Patinopecten yessoensis) using 454 GS FLX

Hou, Rui ; Bao, Zhenmin ; Wang, Shan ; Su, Hailin ; Li, Yan ; Du, Huixia ; Hu, Jingjie ; Wang, Shi ; Hu, Xiaoli Steinke, Dirk

PloS one, 2011-06, Vol.6 (6), p.e21560-e21560 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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13
The fast changing landscape of sequencing technologies and their impact on microbial genome assemblies and annotation
The fast changing landscape of sequencing technologies and their impact on microbial genome assemblies and annotation
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The fast changing landscape of sequencing technologies and their impact on microbial genome assemblies and annotation

Mavromatis, Konstantinos ; Land, Miriam L ; Brettin, Thomas S ; Quest, Daniel J ; Copeland, Alex ; Clum, Alicia ; Goodwin, Lynne ; Woyke, Tanja ; Lapidus, Alla ; Klenk, Hans Peter ; Cottingham, Robert W ; Kyrpides, Nikos C Liu, Zhanjiang

PloS one, 2012-12, Vol.7 (12), p.e48837-e48837 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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14
Temperature-Wise Calibration Increases the Accuracy of DNA Methylation Levels Determined by High-Resolution Melting (HRM)
Temperature-Wise Calibration Increases the Accuracy of DNA Methylation Levels Determined by High-Resolution Melting (HRM)
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Temperature-Wise Calibration Increases the Accuracy of DNA Methylation Levels Determined by High-Resolution Melting (HRM)

Zappe, Katja ; Cichna-Markl, Margit

International journal of molecular sciences, 2024-05, Vol.25 (10), p.5082 [Periódico revisado por pares]

Switzerland: MDPI AG

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15
Clinical utility of custom-designed NGS panel testing in pediatric tumors
Clinical utility of custom-designed NGS panel testing in pediatric tumors
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Clinical utility of custom-designed NGS panel testing in pediatric tumors

Surrey, Lea F ; MacFarland, Suzanne P ; Chang, Fengqi ; Cao, Kajia ; Rathi, Komal S ; Akgumus, Gozde T ; Gallo, Daniel ; Lin, Fumin ; Gleason, Adam ; Raman, Pichai ; Aplenc, Richard ; Bagatell, Rochelle ; Minturn, Jane ; Mosse, Yael ; Santi, Mariarita ; Tasian, Sarah K ; Waanders, Angela J ; Sarmady, Mahdi ; Maris, John M ; Hunger, Stephen P ; Li, Marilyn M

Genome medicine, 2019-05, Vol.11 (1), p.32-32, Article 32 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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16
Synthetic STARR-seq reveals how DNA shape and sequence modulate transcriptional output and noise
Synthetic STARR-seq reveals how DNA shape and sequence modulate transcriptional output and noise
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Synthetic STARR-seq reveals how DNA shape and sequence modulate transcriptional output and noise

Schöne, Stefanie ; Bothe, Melissa ; Einfeldt, Edda ; Borschiwer, Marina ; Benner, Philipp ; Vingron, Martin ; Thomas-Chollier, Morgane ; Meijsing, Sebastiaan H Reddy, Timothy E.

PLoS genetics, 2018-11, Vol.14 (11), p.e1007793-e1007793 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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17
A precise chloroplast genome of Nelumbo nucifera (Nelumbonaceae) evaluated with Sanger, Illumina MiSeq, and PacBio RS II sequencing platforms: insight into the plastid evolution of basal eudicots
A precise chloroplast genome of Nelumbo nucifera (Nelumbonaceae) evaluated with Sanger, Illumina MiSeq, and PacBio RS II sequencing platforms: insight into the plastid evolution of basal eudicots
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A precise chloroplast genome of Nelumbo nucifera (Nelumbonaceae) evaluated with Sanger, Illumina MiSeq, and PacBio RS II sequencing platforms: insight into the plastid evolution of basal eudicots

Wu, Zhihua ; Gui, Songtao ; Quan, Zhiwu ; Pan, Lei ; Wang, Shuzhen ; Ke, Weidong ; Liang, Dequan ; Ding, Yi

BMC plant biology, 2014-11, Vol.14 (1), p.289-289, Article 289 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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18
ddPCR allows 16S rRNA gene amplicon sequencing of very small DNA amounts from low-biomass samples
ddPCR allows 16S rRNA gene amplicon sequencing of very small DNA amounts from low-biomass samples
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ddPCR allows 16S rRNA gene amplicon sequencing of very small DNA amounts from low-biomass samples

Abellan-Schneyder, Isabel ; Schusser, Andrea Janina ; Neuhaus, Klaus

BMC microbiology, 2021-12, Vol.21 (1), p.349-349, Article 349 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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SAG-RAD: A Method for Single-Cell Population Genomics of Unicellular Eukaryotes
SAG-RAD: A Method for Single-Cell Population Genomics of Unicellular Eukaryotes
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SAG-RAD: A Method for Single-Cell Population Genomics of Unicellular Eukaryotes

Gollnisch, Raphael ; Wallenius, Joel ; Gribble, Kristin E ; Ahrén, Dag ; Rengefors, Karin Hepp, Crystal

Molecular biology and evolution, 2023-05, Vol.40 (5) [Periódico revisado por pares]

US: Oxford University Press

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20
Highly accurate long reads are crucial for realizing the potential of biodiversity genomics
Highly accurate long reads are crucial for realizing the potential of biodiversity genomics
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Highly accurate long reads are crucial for realizing the potential of biodiversity genomics

Hotaling, Scott ; Wilcox, Edward R ; Heckenhauer, Jacqueline ; Stewart, Russell J ; Frandsen, Paul B

BMC genomics, 2023-03, Vol.24 (1), p.117-117, Article 117 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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