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Human commensal gut Proteobacteria withstand type VI secretion attacks through immunity protein-independent mechanisms
Human commensal gut Proteobacteria withstand type VI secretion attacks through immunity protein-independent mechanisms
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Human commensal gut Proteobacteria withstand type VI secretion attacks through immunity protein-independent mechanisms

Flaugnatti, Nicolas ; Isaac, Sandrine ; Lemos Rocha, Leonardo F. ; Stutzmann, Sandrine ; Rendueles, Olaya ; Stoudmann, Candice ; Vesel, Nina ; Garcia-Garcera, Marc ; Buffet, Amandine ; Sana, Thibault G. ; Rocha, Eduardo P. C. ; Blokesch, Melanie

Nature communications, 2021-10, Vol.12 (1), p.5751-5751, Article 5751 [Periódico revisado por pares]

London: Nature Publishing Group

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Interplay between the cell envelope and mobile genetic elements shapes gene flow in populations of the nosocomial pathogen Klebsiella pneumoniae
Interplay between the cell envelope and mobile genetic elements shapes gene flow in populations of the nosocomial pathogen Klebsiella pneumoniae
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Interplay between the cell envelope and mobile genetic elements shapes gene flow in populations of the nosocomial pathogen Klebsiella pneumoniae

Haudiquet, Matthieu ; Buffet, Amandine ; Rendueles, Olaya ; Rocha, Eduardo P. C. de Visser, J. Arjan G. M.

PLoS Biology, 2021-07, Vol.19 (7), p.e3001276-e3001276 [Periódico revisado por pares]

San Francisco: Public Library of Science

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Integrative and conjugative elements and their hosts: composition, distribution and organization
Integrative and conjugative elements and their hosts: composition, distribution and organization
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Integrative and conjugative elements and their hosts: composition, distribution and organization

Cury, Jean ; Touchon, Marie ; Rocha, Eduardo P C

Nucleic acids research, 2017-09, Vol.45 (15), p.8943-8956 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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The repertoire of ICE in prokaryotes underscores the unity, diversity, and ubiquity of conjugation
The repertoire of ICE in prokaryotes underscores the unity, diversity, and ubiquity of conjugation
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The repertoire of ICE in prokaryotes underscores the unity, diversity, and ubiquity of conjugation

Guglielmini, Julien ; Quintais, Leonor ; Garcillán-Barcia, Maria Pilar ; de la Cruz, Fernando ; Rocha, Eduardo P C Casadesús, Josep

PLoS genetics, 2011-08, Vol.7 (8), p.e1002222-e1002222 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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15
The systemic imprint of growth and its uses in ecological (meta)genomics
The systemic imprint of growth and its uses in ecological (meta)genomics
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The systemic imprint of growth and its uses in ecological (meta)genomics

Vieira-Silva, Sara ; Rocha, Eduardo P C Moran, Nancy A.

PLoS genetics, 2010-01, Vol.6 (1), p.e1000808 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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16
Phage-plasmids promote recombination and emergence of phages and plasmids
Phage-plasmids promote recombination and emergence of phages and plasmids
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Phage-plasmids promote recombination and emergence of phages and plasmids

Pfeifer, Eugen ; Rocha, Eduardo P C

Nature communications, 2024-02, Vol.15 (1), p.1545-1545 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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17
Adaptation to novel spatially-structured environments is driven by the capsule and alters virulence-associated traits
Adaptation to novel spatially-structured environments is driven by the capsule and alters virulence-associated traits
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Adaptation to novel spatially-structured environments is driven by the capsule and alters virulence-associated traits

Nucci, Amandine ; Rocha, Eduardo P. C. ; Rendueles, Olaya

Nature communications, 2022-08, Vol.13 (1), p.4751-4751, Article 4751 [Periódico revisado por pares]

London: Nature Publishing Group

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PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a partitioned pangenome graph
PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a partitioned pangenome graph
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PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a partitioned pangenome graph

Gautreau, Guillaume ; Bazin, Adelme ; Gachet, Mathieu ; Planel, Rémi ; Burlot, Laura ; Dubois, Mathieu ; Perrin, Amandine ; Médigue, Claudine ; Calteau, Alexandra ; Cruveiller, Stéphane ; Matias, Catherine ; Ambroise, Christophe ; Rocha, Eduardo P C ; Vallenet, David Ouzounis, Christos A.

PLoS computational biology, 2020-03, Vol.16 (3), p.e1007732-e1007732 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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Ultrafast search of all deposited bacterial and viral genomic data
Ultrafast search of all deposited bacterial and viral genomic data
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Ultrafast search of all deposited bacterial and viral genomic data

Bradley, Phelim ; den Bakker, Henk C ; Rocha, Eduardo P C ; McVean, Gil ; Iqbal, Zamin

Nature biotechnology, 2019-02, Vol.37 (2), p.152-159 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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20
Community diversity and habitat structure shape the repertoire of extracellular proteins in bacteria
Community diversity and habitat structure shape the repertoire of extracellular proteins in bacteria
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Community diversity and habitat structure shape the repertoire of extracellular proteins in bacteria

Garcia-Garcera, Marc ; Rocha, Eduardo P C

Nature communications, 2020-02, Vol.11 (1), p.758-758, Article 758 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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