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CD-HIT: accelerated for clustering the next-generation sequencing data
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CD-HIT: accelerated for clustering the next-generation sequencing data

Fu, Limin ; Niu, Beifang ; Zhu, Zhengwei ; Wu, Sitao ; Li, Weizhong

Bioinformatics, 2012-12, Vol.28 (23), p.3150-3152 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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12
GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research—an update
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GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research—an update

PEAKALL, Rod ; SMOUSE, Peter E

Bioinformatics (Oxford, England), 2012-10, Vol.28 (19), p.2537-2539 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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13
Geneious Basic: An integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data
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Geneious Basic: An integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data

KEARSE, Matthew ; MOIR, Richard ; THIERER, Tobias ; ASHTON, Bruce ; MEINTJES, Peter ; DRUMMOND, Alexei ; WILSON, Amy ; STONES-HAVAS, Steven ; CHEUNG, Matthew ; STURROCK, Shane ; BUXTON, Simon ; COOPER, Alex ; MARKOWITZ, Sidney ; DURAN, Chris

Bioinformatics (Oxford, England), 2012-06, Vol.28 (12), p.1647-1649 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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14
Chelex 100 as a Medium for Simple Extraction of DNA for PCR-Based Typing from Forensic Material
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Chelex 100 as a Medium for Simple Extraction of DNA for PCR-Based Typing from Forensic Material

Walsh, P. Sean ; Metzger, David A ; Higuchi, Russell

BioTechniques, 2013-03, Vol.54 (3), p.134-139 [Periódico revisado por pares]

Natick, MA: Future Science Ltd

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Towards a unified paradigm for sequence-based identification of fungi
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Towards a unified paradigm for sequence-based identification of fungi

Kõljalg, Urmas ; Nilsson, R. Henrik ; Abarenkov, Kessy ; Tedersoo, Leho ; Taylor, Andy F. S. ; Bahram, Mohammad ; Bates, Scott T. ; Bruns, Thomas D. ; Bengtsson-Palme, Johan ; Callaghan, Tony M. ; Douglas, Brian ; Drenkhan, Tiia ; Eberhardt, Ursula ; Dueñas, Margarita ; Grebenc, Tine ; Griffith, Gareth W. ; Hartmann, Martin ; Kirk, Paul M. ; Kohout, Petr ; Larsson, Ellen ; Lindahl, Björn D. ; Lücking, Robert ; Martín, María P. ; Matheny, P. Brandon ; Nguyen, Nhu H. ; Niskanen, Tuula ; Oja, Jane ; Peay, Kabir G. ; Peintner, Ursula ; Peterson, Marko ; Põldmaa, Kadri ; Saag, Lauri ; Saar, Irja ; Schüßler, Arthur ; Scott, James A. ; Senés, Carolina ; Smith, Matthew E. ; Suija, Ave ; Taylor, D. Lee ; Telleria, M. Teresa ; Weiss, Michael ; Larsson, Karl-Henrik

Molecular ecology, 2013-11, Vol.22 (21), p.5271-5277 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Blackwell Publishing Ltd

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SINA: Accurate high-throughput multiple sequence alignment of ribosomal RNA genes
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SINA: Accurate high-throughput multiple sequence alignment of ribosomal RNA genes

PRUESSE, Elmar ; PEPLIES, Jörg ; GLÖCKNER, Frank Oliver

Bioinformatics, 2012-07, Vol.28 (14), p.1823-1829 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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17
A high-performance computing toolset for relatedness and principal component analysis of SNP data
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A high-performance computing toolset for relatedness and principal component analysis of SNP data

XIUWEN ZHENG ; LEVINE, David ; SHEN, Jess ; GOGARTEN, Stephanie M ; LAURIE, Cathy ; WEIR, Bruce S

Bioinformatics, 2012-12, Vol.28 (24), p.3326-3328 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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FLASH: fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies
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FLASH: fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies

Mago, Tanja ; Salzberg, Steven L

Bioinformatics, 2011-11, Vol.27 (21), p.2957-2963 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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19
The sva package for removing batch effects and other unwanted variation in high-throughput experiments
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The sva package for removing batch effects and other unwanted variation in high-throughput experiments

LEEK, Jeffrey T ; EVAN JOHNSON, W ; PARKER, Hilary S ; JAFFE, Andrew E ; STOREY, John D

Bioinformatics (Oxford, England), 2012-03, Vol.28 (6), p.882-883 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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20
UCHIME improves sensitivity and speed of chimera detection
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UCHIME improves sensitivity and speed of chimera detection

Edgar, Robert C ; Haas, Brian J ; Clemente, Jose C ; Quince, Christopher ; Knight, Rob

Bioinformatics, 2011-08, Vol.27 (16), p.2194-2200 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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