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Pathway enrichment analysis and visualization of omics data using g:Profiler, GSEA, Cytoscape and EnrichmentMap
Pathway enrichment analysis and visualization of omics data using g:Profiler, GSEA, Cytoscape and EnrichmentMap
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Pathway enrichment analysis and visualization of omics data using g:Profiler, GSEA, Cytoscape and EnrichmentMap

Reimand, Jüri ; Isserlin, Ruth ; Voisin, Veronique ; Kucera, Mike ; Tannus-Lopes, Christian ; Rostamianfar, Asha ; Wadi, Lina ; Meyer, Mona ; Wong, Jeff ; Xu, Changjiang ; Merico, Daniele ; Bader, Gary D

Nature protocols, 2019-02, Vol.14 (2), p.482-517 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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Deep learning is combined with massive-scale citizen science to improve large-scale image classification
Deep learning is combined with massive-scale citizen science to improve large-scale image classification
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Deep learning is combined with massive-scale citizen science to improve large-scale image classification

Sullivan, Devin P ; Winsnes, Casper F ; Åkesson, Lovisa ; Hjelmare, Martin ; Wiking, Mikaela ; Schutten, Rutger ; Campbell, Linzi ; Leifsson, Hjalti ; Rhodes, Scott ; Nordgren, Andie ; Smith, Kevin ; Revaz, Bernard ; Finnbogason, Bergur ; Szantner, Attila ; Lundberg, Emma

Nature biotechnology, 2018-10, Vol.36 (9), p.820-828 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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Quantifying and contextualizing the impact of bioRxiv preprints through automated social media audience segmentation
Quantifying and contextualizing the impact of bioRxiv preprints through automated social media audience segmentation
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Quantifying and contextualizing the impact of bioRxiv preprints through automated social media audience segmentation

Carlson, Jedidiah ; Harris, Kelley Blekhman, Ran

PLoS Biology, 2020-09, Vol.18 (9), p.e3000860-e3000860 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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ibex: An open infrastructure software platform to facilitate collaborative work in radiomics
ibex: An open infrastructure software platform to facilitate collaborative work in radiomics
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ibex: An open infrastructure software platform to facilitate collaborative work in radiomics

Zhang, Lifei ; Fried, David V. ; Fave, Xenia J. ; Hunter, Luke A. ; Yang, Jinzhong ; Court, Laurence E.

Medical physics (Lancaster), 2015-03, Vol.42 (3), p.1341-1353 [Periódico revisado por pares]

United States: American Association of Physicists in Medicine

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CA1 pyramidal cell diversity enabling parallel information processing in the hippocampus
CA1 pyramidal cell diversity enabling parallel information processing in the hippocampus
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CA1 pyramidal cell diversity enabling parallel information processing in the hippocampus

Soltesz, Ivan ; Losonczy, Attila

Nature neuroscience, 2018-04, Vol.21 (4), p.484-493 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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A wellness study of 108 individuals using personal, dense, dynamic data clouds
A wellness study of 108 individuals using personal, dense, dynamic data clouds
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A wellness study of 108 individuals using personal, dense, dynamic data clouds

Price, Nathan D ; Magis, Andrew T ; Earls, John C ; Glusman, Gustavo ; Levy, Roie ; Lausted, Christopher ; McDonald, Daniel T ; Kusebauch, Ulrike ; Moss, Christopher L ; Zhou, Yong ; Qin, Shizhen ; Moritz, Robert L ; Brogaard, Kristin ; Omenn, Gilbert S ; Lovejoy, Jennifer C ; Hood, Leroy

Nature biotechnology, 2017-08, Vol.35 (8), p.747-756 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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REST: a toolkit for resting-state functional magnetic resonance imaging data processing
REST: a toolkit for resting-state functional magnetic resonance imaging data processing
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REST: a toolkit for resting-state functional magnetic resonance imaging data processing

Song, Xiao-Wei ; Dong, Zhang-Ye ; Long, Xiang-Yu ; Li, Su-Fang ; Zuo, Xi-Nian ; Zhu, Chao-Zhe ; He, Yong ; Yan, Chao-Gan ; Zang, Yu-Feng Harrison, Ben J.

PloS one, 2011-09, Vol.6 (9), p.e25031-e25031 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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MEGAN Community Edition - Interactive Exploration and Analysis of Large-Scale Microbiome Sequencing Data
MEGAN Community Edition - Interactive Exploration and Analysis of Large-Scale Microbiome Sequencing Data
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MEGAN Community Edition - Interactive Exploration and Analysis of Large-Scale Microbiome Sequencing Data

Huson, Daniel H ; Beier, Sina ; Flade, Isabell ; Górska, Anna ; El-Hadidi, Mohamed ; Mitra, Suparna ; Ruscheweyh, Hans-Joachim ; Tappu, Rewati Poisot, Timothée

PLoS computational biology, 2016-06, Vol.12 (6), p.e1004957-e1004957 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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19
Mass detection in digital breast tomosynthesis: Deep convolutional neural network with transfer learning from mammography
Mass detection in digital breast tomosynthesis: Deep convolutional neural network with transfer learning from mammography
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Mass detection in digital breast tomosynthesis: Deep convolutional neural network with transfer learning from mammography

Samala, Ravi K. ; Chan, Heang-Ping ; Hadjiiski, Lubomir ; Helvie, Mark A. ; Wei, Jun ; Cha, Kenny

Medical physics (Lancaster), 2016-12, Vol.43 (12), p.6654-6666 [Periódico revisado por pares]

United States: American Association of Physicists in Medicine

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Quantitative assessment of single-cell RNA-sequencing methods
Quantitative assessment of single-cell RNA-sequencing methods
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Quantitative assessment of single-cell RNA-sequencing methods

Wu, Angela R ; Neff, Norma F ; Kalisky, Tomer ; Dalerba, Piero ; Treutlein, Barbara ; Rothenberg, Michael E ; Mburu, Francis M ; Mantalas, Gary L ; Sim, Sopheak ; Clarke, Michael F ; Quake, Stephen R

Nature methods, 2014, Vol.11 (1), p.41-46 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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