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Nanopore sequencing technology, bioinformatics and applications
Nanopore sequencing technology, bioinformatics and applications
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Nanopore sequencing technology, bioinformatics and applications

Wang, Yunhao ; Zhao, Yue ; Bollas, Audrey ; Wang, Yuru ; Au, Kin Fai

Nature biotechnology, 2021-11, Vol.39 (11), p.1348-1365 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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Review of Clinical Next-Generation Sequencing
Review of Clinical Next-Generation Sequencing
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Review of Clinical Next-Generation Sequencing

Yohe, Sophia ; Thyagarajan, Bharat

Archives of pathology & laboratory medicine (1976), 2017-11, Vol.141 (11), p.1544-1557 [Periódico revisado por pares]

United States: College of American Pathologists

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Nanopore sequencing and the Shasta toolkit enable efficient de novo assembly of eleven human genomes
Nanopore sequencing and the Shasta toolkit enable efficient de novo assembly of eleven human genomes
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Nanopore sequencing and the Shasta toolkit enable efficient de novo assembly of eleven human genomes

Shafin, Kishwar ; Pesout, Trevor ; Lorig-Roach, Ryan ; Haukness, Marina ; Olsen, Hugh E ; Bosworth, Colleen ; Armstrong, Joel ; Tigyi, Kristof ; Maurer, Nicholas ; Koren, Sergey ; Sedlazeck, Fritz J ; Marschall, Tobias ; Mayes, Simon ; Costa, Vania ; Zook, Justin M ; Liu, Kelvin J ; Kilburn, Duncan ; Sorensen, Melanie ; Munson, Katy M ; Vollger, Mitchell R ; Monlong, Jean ; Garrison, Erik ; Eichler, Evan E ; Salama, Sofie ; Haussler, David ; Green, Richard E ; Akeson, Mark ; Phillippy, Adam ; Miga, Karen H ; Carnevali, Paolo ; Jain, Miten ; Paten, Benedict

Nature biotechnology, 2020-09, Vol.38 (9), p.1044-1053 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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Nanopore Sequencing as a Rapidly Deployable Ebola Outbreak Tool
Nanopore Sequencing as a Rapidly Deployable Ebola Outbreak Tool
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Nanopore Sequencing as a Rapidly Deployable Ebola Outbreak Tool

Hoenen, Thomas ; Groseth, Allison ; Rosenke, Kyle ; Fischer, Robert J ; Hoenen, Andreas ; Judson, Seth D ; Martellaro, Cynthia ; Falzarano, Darryl ; Marzi, Andrea ; Squires, R Burke ; Wollenberg, Kurt R ; de Wit, Emmie ; Prescott, Joseph ; Safronetz, David ; van Doremalen, Neeltje ; Bushmaker, Trenton ; Feldmann, Friederike ; McNally, Kristin ; Bolay, Fatorma K ; Fields, Barry ; Sealy, Tara ; Rayfield, Mark ; Nichol, Stuart T ; Zoon, Kathryn C ; Massaquoi, Moses ; Munster, Vincent J ; Feldmann, Heinz

Emerging infectious diseases, 2016-02, Vol.22 (2), p.331-334 [Periódico revisado por pares]

United States: U.S. National Center for Infectious Diseases

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Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads
Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads
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Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads

Jain, Miten ; Koren, Sergey ; Miga, Karen H ; Quick, Josh ; Rand, Arthur C ; Sasani, Thomas A ; Tyson, John R ; Beggs, Andrew D ; Dilthey, Alexander T ; Fiddes, Ian T ; Malla, Sunir ; Marriott, Hannah ; Nieto, Tom ; O'Grady, Justin ; Olsen, Hugh E ; Pedersen, Brent S ; Rhie, Arang ; Richardson, Hollian ; Quinlan, Aaron R ; Snutch, Terrance P ; Tee, Louise ; Paten, Benedict ; Phillippy, Adam M ; Simpson, Jared T ; Loman, Nicholas J ; Loose, Matthew

Nature biotechnology, 2018-04, Vol.36 (4), p.338-345 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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The Oxford Nanopore MinION: delivery of nanopore sequencing to the genomics community
The Oxford Nanopore MinION: delivery of nanopore sequencing to the genomics community
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The Oxford Nanopore MinION: delivery of nanopore sequencing to the genomics community

Jain, Miten ; Olsen, Hugh E ; Paten, Benedict ; Akeson, Mark

Genome Biology, 2016-11, Vol.17 (1), p.239, Article 239 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central

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7
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly
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Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly

Ghurye, Jay ; Rhie, Arang ; Walenz, Brian P ; Schmitt, Anthony ; Selvaraj, Siddarth ; Pop, Mihai ; Phillippy, Adam M ; Koren, Sergey Ioshikhes, Ilya

PLoS computational biology, 2019-08, Vol.15 (8), p.e1007273-e1007273 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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8
Systematic Evaluation of Sanger Validation of Next-Generation Sequencing Variants
Systematic Evaluation of Sanger Validation of Next-Generation Sequencing Variants
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Systematic Evaluation of Sanger Validation of Next-Generation Sequencing Variants

Beck, Tyler F ; Mullikin, James C ; Biesecker, Leslie G

Clinical chemistry (Baltimore, Md.), 2016-04, Vol.62 (4), p.647-654 [Periódico revisado por pares]

England: American Association for Clinical Chemistry, Inc

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9
Seq-Well: portable, low-cost RNA sequencing of single cells at high throughput
Seq-Well: portable, low-cost RNA sequencing of single cells at high throughput
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Seq-Well: portable, low-cost RNA sequencing of single cells at high throughput

Gierahn, Todd M ; Wadsworth, 2nd, Marc H ; Hughes, Travis K ; Bryson, Bryan D ; Butler, Andrew ; Satija, Rahul ; Fortune, Sarah ; Love, J Christopher ; Shalek, Alex K

Nature methods, 2017-04, Vol.14 (4), p.395-398 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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Trycycler: consensus long-read assemblies for bacterial genomes
Trycycler: consensus long-read assemblies for bacterial genomes
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Trycycler: consensus long-read assemblies for bacterial genomes

Wick, Ryan R ; Judd, Louise M ; Cerdeira, Louise T ; Hawkey, Jane ; Méric, Guillaume ; Vezina, Ben ; Wyres, Kelly L ; Holt, Kathryn E

Genome Biology, 2021-09, Vol.22 (1), p.266-266, Article 266 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central

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