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A new paradigm for molecular dynamics databases: the COVID-19 database, the legacy of a titanic community effort
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A new paradigm for molecular dynamics databases: the COVID-19 database, the legacy of a titanic community effort

Beltrán, Daniel ; Hospital Gasch, Adam ; Gelpí Buchaca, Josep Lluís ; Orozco López, Modesto

2023-01

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2
Lenalidomide Stabilizes Protein-Protein Complexes by Turning Labile Intermolecular H-Bonds into Robust Interactions
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Lenalidomide Stabilizes Protein-Protein Complexes by Turning Labile Intermolecular H-Bonds into Robust Interactions

Miñarro Lleonar, Marina ; Bertran-Mostazo, Andrea ; Duro Gómez, Jorge ; Barril Alonso, Xavier ; Juárez Jiménez, Jordi

American Chemical Society 2023-04

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3
Small obstacle in a large polar flock
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Small obstacle in a large polar flock

Codina, Joan ; Mahault, Benoît ; Dobnikar, Jure ; Pagonabarraga Mora, Ignacio ; Shi, Xia-qing ; Chaté, Hugues

American Physical Society 2022-05

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4
Molecular dynamics simulations of an alfa-synuclein NAC domain fragment with a ff14IDPSFF IDP-specific force field suggest beta-sheet intermediate states of fibrillation
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Molecular dynamics simulations of an alfa-synuclein NAC domain fragment with a ff14IDPSFF IDP-specific force field suggest beta-sheet intermediate states of fibrillation

Privat, Cristian ; Madurga Díez, Sergio ; Mas i Pujadas, Francesc ; Rubio Martínez, Jaime

Royal Society of Chemistry 2022-07

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5
Size-Pore-Dependent Methanol Sequestration from Water-Methanol Mixtures by an Embedded Graphene Slit
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Size-Pore-Dependent Methanol Sequestration from Water-Methanol Mixtures by an Embedded Graphene Slit

Bellido Peralta, Roger ; Leoni, Fabio ; Calero Borrallo, Carles ; Franzese, Giancarlo

MDPI 2023-04

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6
Effect of set up protocols on the accuracy of alchemical free energy calculation over a set of ACK1 inhibitors
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Effect of set up protocols on the accuracy of alchemical free energy calculation over a set of ACK1 inhibitors

Granadino Roldán, José M ; Mey, Antonia S. J. S ; Pérez González, Juan J ; Bosisio, Stefano ; Rubio Martínez, Jaime ; Michel, Julien

Public Library of Science (PLoS) 2019-03

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7
Exploring optimal graphene slit-pore width for the physical separation of water-methanol mixture
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Exploring optimal graphene slit-pore width for the physical separation of water-methanol mixture

Bellido Peralta, Roger ; Leoni, Fabio ; Calero Borrallo, Carles ; Franzese, Giancarlo

Elsevier B.V 2023-10

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8
The Optimal Permeation of Cyclic Boronates to Cross the Outer Membrane via the Porin Pathway
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The Optimal Permeation of Cyclic Boronates to Cross the Outer Membrane via the Porin Pathway

Marco Tuveri, Gian ; Ceccarelli, Matteo ; Pira, Alessandro ; Bodrenko, Igor V

2022-06

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9
Fragment Dissolved molecular dynamics: A systematic and efficient method to locate binding sites
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Fragment Dissolved molecular dynamics: A systematic and efficient method to locate binding sites

Privat-Contreras, Cristian ; Granadino Roldán, José M ; Bonet, Jordi ; Santos Tomas, M ; Pérez González, Juan J ; Rubio Martínez, Jaime

Royal Society of Chemistry 2020-12

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10
Unfolding the prospects of computational (bio)materials modelling
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Unfolding the prospects of computational (bio)materials modelling

Sevink, Geert Jan Agur ; Liwo, Adam ; Asinari, Pietro ; MacKernan, Donal ; Milano, Giuseppe ; Pagonabarraga Mora, Ignacio

American Institute of Physics 2020-09

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