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Diversification of the type IV filament superfamily into machines for adhesion, protein secretion, DNA uptake, and motility
Diversification of the type IV filament superfamily into machines for adhesion, protein secretion, DNA uptake, and motility
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Diversification of the type IV filament superfamily into machines for adhesion, protein secretion, DNA uptake, and motility

Denise, Rémi ; Abby, Sophie S ; Rocha, Eduardo P C Beeby, Morgan

PLoS biology, 2019-07, Vol.17 (7), p.e3000390-e3000390 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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Interplay between the cell envelope and mobile genetic elements shapes gene flow in populations of the nosocomial pathogen Klebsiella pneumoniae
Interplay between the cell envelope and mobile genetic elements shapes gene flow in populations of the nosocomial pathogen Klebsiella pneumoniae
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Interplay between the cell envelope and mobile genetic elements shapes gene flow in populations of the nosocomial pathogen Klebsiella pneumoniae

Haudiquet, Matthieu ; Buffet, Amandine ; Rendueles, Olaya ; Rocha, Eduardo P. C. de Visser, J. Arjan G. M.

PLoS biology, 2021-07, Vol.19 (7), p.e3001276-e3001276 [Periódico revisado por pares]

San Francisco: Public Library of Science

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3
Neutral Theory, Microbial Practice: Challenges in Bacterial Population Genetics
Neutral Theory, Microbial Practice: Challenges in Bacterial Population Genetics
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Neutral Theory, Microbial Practice: Challenges in Bacterial Population Genetics

Rocha, Eduardo P C Kumar, Sudhir

Molecular biology and evolution, 2018-06, Vol.35 (6), p.1338-1347 [Periódico revisado por pares]

United States: Oxford University Press (OUP)

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PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a partitioned pangenome graph
PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a partitioned pangenome graph
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PPanGGOLiN: Depicting microbial diversity via a partitioned pangenome graph

Gautreau, Guillaume ; Bazin, Adelme ; Gachet, Mathieu ; Planel, Rémi ; Burlot, Laura ; Dubois, Mathieu ; Perrin, Amandine ; Médigue, Claudine ; Calteau, Alexandra ; Cruveiller, Stéphane ; Matias, Catherine ; Ambroise, Christophe ; Rocha, Eduardo P C ; Vallenet, David Ouzounis, Christos A.

PLoS computational biology, 2020-03, Vol.16 (3), p.e1007732-e1007732 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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5
Integrative and conjugative elements and their hosts: composition, distribution and organization
Integrative and conjugative elements and their hosts: composition, distribution and organization
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Integrative and conjugative elements and their hosts: composition, distribution and organization

Cury, Jean ; Touchon, Marie ; Rocha, Eduardo P C

Nucleic acids research, 2017-09, Vol.45 (15), p.8943-8956 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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Microbial defenses against mobile genetic elements and viruses: Who defends whom from what?
Microbial defenses against mobile genetic elements and viruses: Who defends whom from what?
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Microbial defenses against mobile genetic elements and viruses: Who defends whom from what?

Rocha, Eduardo P C ; Bikard, David

PLoS biology, 2022-01, Vol.20 (1), p.e3001514-e3001514 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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Using Sex to Cure the Genome
Using Sex to Cure the Genome
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Using Sex to Cure the Genome

Rocha, Eduardo P C

PLoS biology, 2016-03, Vol.14 (3), p.e1002417-e1002417 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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8
Causes of Insertion Sequences Abundance in Prokaryotic Genomes
Causes of Insertion Sequences Abundance in Prokaryotic Genomes
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Causes of Insertion Sequences Abundance in Prokaryotic Genomes

Touchon, Marie ; Rocha, Eduardo P. C

Molecular biology and evolution, 2007-04, Vol.24 (4), p.969-981 [Periódico revisado por pares]

United States: Oxford University Press

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9
Key components of the eight classes of type IV secretion systems involved in bacterial conjugation or protein secretion
Key components of the eight classes of type IV secretion systems involved in bacterial conjugation or protein secretion
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Key components of the eight classes of type IV secretion systems involved in bacterial conjugation or protein secretion

Guglielmini, Julien ; Néron, Bertrand ; Abby, Sophie S ; Garcillán-Barcia, María Pilar ; la Cruz, Fernando de ; Rocha, Eduardo P. C

Nucleic acids research, 2014-05, Vol.42 (9), p.5715-5727 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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10
CRISPRCasFinder, an update of CRISRFinder, includes a portable version, enhanced performance and integrates search for Cas proteins
CRISPRCasFinder, an update of CRISRFinder, includes a portable version, enhanced performance and integrates search for Cas proteins
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CRISPRCasFinder, an update of CRISRFinder, includes a portable version, enhanced performance and integrates search for Cas proteins

Couvin, David ; Bernheim, Aude ; Toffano-Nioche, Claire ; Touchon, Marie ; Michalik, Juraj ; Néron, Bertrand ; Rocha, Eduardo P C ; Vergnaud, Gilles ; Gautheret, Daniel ; Pourcel, Christine

Nucleic acids research, 2018-07, Vol.46 (W1), p.W246-W251 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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