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UniRule: a unified rule resource for automatic annotation in the UniProt Knowledgebase
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UniRule: a unified rule resource for automatic annotation in the UniProt Knowledgebase

MacDougall, Alistair ; Volynkin, Vladimir ; Saidi, Rabie ; Poggioli, Diego ; Zellner, Hermann ; Hatton-Ellis, Emma ; Joshi, Vishal ; O’Donovan, Claire ; Orchard, Sandra ; Auchincloss, Andrea H ; Baratin, Delphine ; Bolleman, Jerven ; Coudert, Elisabeth ; de Castro, Edouard ; Hulo, Chantal ; Masson, Patrick ; Pedruzzi, Ivo ; Rivoire, Catherine ; Arighi, Cecilia ; Wang, Qinghua ; Chen, Chuming ; Huang, Hongzhan ; Garavelli, John ; Vinayaka, C R ; Yeh, Lai-Su ; Natale, Darren A ; Laiho, Kati ; Martin, Maria-Jesus ; Renaux, Alexandre ; Pichler, Klemens Robinson, Peter

Bioinformatics, 2020-11, Vol.36 (17), p.4643-4648 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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2
SNPassoc: an R package to perform whole genome association studies
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SNPassoc: an R package to perform whole genome association studies

González, Juan R ; Armengol, Lluís ; Solé, Xavier ; Guinó, Elisabet ; Mercader, Josep M ; Estivill, Xavier ; Moreno, Víctor

Bioinformatics, 2007-03, Vol.23 (5), p.654-655 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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3
PARS: a web server for the prediction of Protein Allosteric and Regulatory Sites
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PARS: a web server for the prediction of Protein Allosteric and Regulatory Sites

Panjkovich, Alejandro ; Daura, Xavier

Bioinformatics, 2014-05, Vol.30 (9), p.1314-1315 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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4
CNN-PepPred: an open-source tool to create convolutional NN models for the discovery of patterns in peptide sets—application to peptide–MHC class II binding prediction
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CNN-PepPred: an open-source tool to create convolutional NN models for the discovery of patterns in peptide sets—application to peptide–MHC class II binding prediction

Junet, Valentin ; Daura, Xavier Marschall, Tobias

Bioinformatics, 2021-12, Vol.37 (23), p.4567-4568 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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5
SNPStats: a web tool for the analysis of association studies
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SNPStats: a web tool for the analysis of association studies

Solé, Xavier ; Guinó, Elisabet ; Valls, Joan ; Iniesta, Raquel ; Moreno, Víctor

Bioinformatics, 2006-08, Vol.22 (15), p.1928-1929 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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6
tcsBU: a tool to extend TCS network layout and visualization
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tcsBU: a tool to extend TCS network layout and visualization

Múrias dos Santos, António ; Cabezas, Maria Pilar ; Tavares, Ana Isabel ; Xavier, Raquel ; Branco, Madalena

Bioinformatics, 2016-02, Vol.32 (4), p.627-628 [Periódico revisado por pares]

England

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7
MDpocket: open-source cavity detection and characterization on molecular dynamics trajectories
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MDpocket: open-source cavity detection and characterization on molecular dynamics trajectories

Schmidtke, Peter ; Bidon-Chanal, Axel ; Luque, F. Javier ; Barril, Xavier

Bioinformatics, 2011-12, Vol.27 (23), p.3276-3285 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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8
Extended connectivity interaction features: improving binding affinity prediction through chemical description
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Extended connectivity interaction features: improving binding affinity prediction through chemical description

Sánchez-Cruz, Norberto ; Medina-Franco, José L ; Mestres, Jordi ; Barril, Xavier Arne, Elofsson

Bioinformatics, 2021-06, Vol.37 (10), p.1376-1382 [Periódico revisado por pares]

Oxford University Press

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9
CAAStools: a toolbox to identify and test Convergent Amino Acid Substitutions
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CAAStools: a toolbox to identify and test Convergent Amino Acid Substitutions

Barteri, Fabio ; Valenzuela, Alejandro ; Farré, Xavier ; de Juan, David ; Muntané, Gerard ; Esteve-Altava, Borja ; Navarro, Arcadi Alkan, Can

Bioinformatics (Oxford, England), 2023-10, Vol.39 (10) [Periódico revisado por pares]

Oxford University Press

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10
Assessing heterogeneity in spatial data using the HTA index with applications to spatial transcriptomics and imaging
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Assessing heterogeneity in spatial data using the HTA index with applications to spatial transcriptomics and imaging

Levy-Jurgenson, Alona ; Tekpli, Xavier ; Yakhini, Zohar Vitek, Olga

Bioinformatics (Oxford, England), 2021-11, Vol.37 (21), p.3796-3804 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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