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| Result Number | Material Type | Add to My Shelf Action | Record Details and Options |
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Material Type: Artigo
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BioAutoML automated feature engineering and metalearning to predict noncoding RNAs in bacteriaRobson Parmezan Bonidia Anderson Paulo Avila Santos; Breno Lívio Silva de Almeida; Peter F Stadler; Ulisses Nunes da Rocha; Danilo Sipoli Sanches; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de CarvalhoBriefings in Bioinformatics Oxford v. 23, n. 4, p. 1-13, 2022Oxford 2022Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação (PROD-3084111 )(Acessar) |
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Material Type: Artigo
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Information theory for biological sequence classification a novel feature extraction technique based on Tsallis entropyRobson Parmezan Bonidia Anderson Paulo Avila Santos; Breno Lívio Silva de Almeida; Peter F Stadler; Ulisses Nunes da Rocha; Danilo Sipoli Sanches; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de CarvalhoEntropy Basel v. 24, n. 10, p. 1-17, 2022Basel 2022Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação (PROD-3105627 )(Acessar) |
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Material Type: Artigo
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MarineMetagenomeDB a public repository for curated and standardized metadata for marine metagenomesMuhammad Kabiru Nata'ala Anderson Paulo Avila Santos; Jonas Coelho Kasmanas; Alexander Bartholomäus; João Pedro Saraiva; Sandra Godinho Silva; Tina Keller-Costa; Rodrigo Costa; Newton Carlos Marcial Gomes; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Peter F Stadler; Danilo Sipoli Sanches; Ulisses Nunes da RochaEnvironmental Microbiome London v. 17, p. 1-10, 2022London 2022Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação (PROD-3108433 )(Acessar) |
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Material Type: Tese de Doutorado
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Detecção de anomalia através da comparação de modelos representativosGelatti, Giovana JaskulskiBiblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação 2021-03-23Acesso online |
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Material Type: Artigo de Congresso
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MathPIP classification of proinflammatory peptides using mathematical descriptorsJoão Pedro Uchôa Cavalcante Anderson Cardoso Gonçalves; Robson Parmezan Bonidia; Danilo Sipoli Sanches; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Brazilian Symposium on Bioinformatics - BSB (14. 2021 Virtual Event)Lecture Notes in Bioinformatics Cham : Springer v. 13063, p. 131-136, 2021Cham Springer 2021Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação (PROD-3052868 )(Acessar) |
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Material Type: Artigo
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Casboundary automated definition of integral Cas cassettesVictor Alexandre Padilha Omer S Alkhnbashi; Van Dinh Tran; Shiraz A Shah; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Rolf BackofenBioinformatics Oxford v. 37, n. 10, p. 1352-1359, 2021Oxford 2021Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação (PROD-3016922 )(Acessar) |
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Material Type: Artigo
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Feature extraction approaches for biological sequences a comparative study of mathematical featuresRobson Parmezan Bonidia Lucas Dias Hiera Sampaio; Douglas S Domingues; Alexandre Rossi Paschoal; Fabrício Martins Lopes; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Danilo Sipoli SanchesBriefings in Bioinformatics Oxford v. 22, n. 5, p. 1-20, Sep. 2021Oxford 2021Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação (PROD-3020209 )(Acessar) |
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Material Type: Artigo
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CRISPRloci comprehensive and accurate annotation of CRISPR-Cas systemsOmer S Alkhnbashi Alexander Mitrofanov; Robson Parmezan Bonidia; Martin Raden; Van Dinh Tran; Florian Eggenhofer; Shiraz A Shah; Ekrem Ozturk; Victor Alexandre Padilha; Danilo Sipoli Sanches; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Rolf BackofenNucleic Acids Research Oxford v. 49, p. w125-w130, 2021Oxford 2021Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação (PROD-3036972 )(Acessar) |
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Material Type: Artigo de Congresso
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Feature importance analysis of non-coding DNA/RNA sequences based on machine learning approachesBreno Lívio Silva de Almeida Alvaro Pedroso Queiroz; Anderson Paulo Avila Santos; Robson Parmezan Bonidia; Ulisses Nunes da Rocha; Danilo Sipoli Sanches; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Brazilian Symposium on Bioinformatics - BSB (14. 2021 Virtual Event)Lecture Notes in Bioinformatics Cham : Springer v. 13063, p. 81-92, 2021Cham Springer 2021Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação (PROD-3052859 )(Acessar) |
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Material Type: Tese de Doutorado
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Machine Learning Tools for Bioinformatics ProblemsPadilha, Victor AlexandreBiblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação 2020-10-01Acesso online |
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