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Nanopore sequencing and the Shasta toolkit enable efficient de novo assembly of eleven human genomes
Nanopore sequencing and the Shasta toolkit enable efficient de novo assembly of eleven human genomes
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Nanopore sequencing and the Shasta toolkit enable efficient de novo assembly of eleven human genomes

Shafin, Kishwar ; Pesout, Trevor ; Lorig-Roach, Ryan ; Haukness, Marina ; Olsen, Hugh E ; Bosworth, Colleen ; Armstrong, Joel ; Tigyi, Kristof ; Maurer, Nicholas ; Koren, Sergey ; Sedlazeck, Fritz J ; Marschall, Tobias ; Mayes, Simon ; Costa, Vania ; Zook, Justin M ; Liu, Kelvin J ; Kilburn, Duncan ; Sorensen, Melanie ; Munson, Katy M ; Vollger, Mitchell R ; Monlong, Jean ; Garrison, Erik ; Eichler, Evan E ; Salama, Sofie ; Haussler, David ; Green, Richard E ; Akeson, Mark ; Phillippy, Adam ; Miga, Karen H ; Carnevali, Paolo ; Jain, Miten ; Paten, Benedict

Nature biotechnology, 2020-09, Vol.38 (9), p.1044-1053 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads
Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads
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Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads

Jain, Miten ; Koren, Sergey ; Miga, Karen H ; Quick, Josh ; Rand, Arthur C ; Sasani, Thomas A ; Tyson, John R ; Beggs, Andrew D ; Dilthey, Alexander T ; Fiddes, Ian T ; Malla, Sunir ; Marriott, Hannah ; Nieto, Tom ; O'Grady, Justin ; Olsen, Hugh E ; Pedersen, Brent S ; Rhie, Arang ; Richardson, Hollian ; Quinlan, Aaron R ; Snutch, Terrance P ; Tee, Louise ; Paten, Benedict ; Phillippy, Adam M ; Simpson, Jared T ; Loman, Nicholas J ; Loose, Matthew

Nature biotechnology, 2018-04, Vol.36 (4), p.338-345 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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13
Next-generation sequencing technologies: An overview
Next-generation sequencing technologies: An overview
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Next-generation sequencing technologies: An overview

Hu, Taishan ; Chitnis, Nilesh ; Monos, Dimitri ; Dinh, Anh

Human immunology, 2021-11, Vol.82 (11), p.801-811 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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14
Seq-Well: portable, low-cost RNA sequencing of single cells at high throughput
Seq-Well: portable, low-cost RNA sequencing of single cells at high throughput
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Seq-Well: portable, low-cost RNA sequencing of single cells at high throughput

Gierahn, Todd M ; Wadsworth, 2nd, Marc H ; Hughes, Travis K ; Bryson, Bryan D ; Butler, Andrew ; Satija, Rahul ; Fortune, Sarah ; Love, J Christopher ; Shalek, Alex K

Nature methods, 2017-04, Vol.14 (4), p.395-398 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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15
Sequencing-based methods and resources to study antimicrobial resistance
Sequencing-based methods and resources to study antimicrobial resistance
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Sequencing-based methods and resources to study antimicrobial resistance

Boolchandani, Manish ; D'Souza, Alaric W ; Dantas, Gautam

Nature reviews. Genetics, 2019-06, Vol.20 (6), p.356-370 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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Accurate circular consensus long-read sequencing improves variant detection and assembly of a human genome
Accurate circular consensus long-read sequencing improves variant detection and assembly of a human genome
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Accurate circular consensus long-read sequencing improves variant detection and assembly of a human genome

Wenger, Aaron M ; Peluso, Paul ; Rowell, William J ; Chang, Pi-Chuan ; Hall, Richard J ; Concepcion, Gregory T ; Ebler, Jana ; Fungtammasan, Arkarachai ; Kolesnikov, Alexey ; Olson, Nathan D ; Töpfer, Armin ; Alonge, Michael ; Mahmoud, Medhat ; Qian, Yufeng ; Chin, Chen-Shan ; Phillippy, Adam M ; Schatz, Michael C ; Myers, Gene ; DePristo, Mark A ; Ruan, Jue ; Marschall, Tobias ; Sedlazeck, Fritz J ; Zook, Justin M ; Li, Heng ; Koren, Sergey ; Carroll, Andrew ; Rank, David R ; Hunkapiller, Michael W

Nature biotechnology, 2019-10, Vol.37 (10), p.1155-1162 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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17
Harnessing the power of RADseq for ecological and evolutionary genomics
Harnessing the power of RADseq for ecological and evolutionary genomics
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Harnessing the power of RADseq for ecological and evolutionary genomics

Andrews, Kimberly R ; Good, Jeffrey M ; Miller, Michael R ; Luikart, Gordon ; Hohenlohe, Paul A

Nature reviews. Genetics, 2016-02, Vol.17 (2), p.81-92 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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18
The Oxford Nanopore MinION: delivery of nanopore sequencing to the genomics community
The Oxford Nanopore MinION: delivery of nanopore sequencing to the genomics community
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The Oxford Nanopore MinION: delivery of nanopore sequencing to the genomics community

Jain, Miten ; Olsen, Hugh E ; Paten, Benedict ; Akeson, Mark

Genome Biology, 2016-11, Vol.17 (1), p.239, Article 239 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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19
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly
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Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly

Ghurye, Jay ; Rhie, Arang ; Walenz, Brian P ; Schmitt, Anthony ; Selvaraj, Siddarth ; Pop, Mihai ; Phillippy, Adam M ; Koren, Sergey Ioshikhes, Ilya

PLoS computational biology, 2019-08, Vol.15 (8), p.e1007273 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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Ultra-high-throughput microbial community analysis on the Illumina HiSeq and MiSeq platforms
Ultra-high-throughput microbial community analysis on the Illumina HiSeq and MiSeq platforms
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Ultra-high-throughput microbial community analysis on the Illumina HiSeq and MiSeq platforms

Caporaso, J Gregory ; Lauber, Christian L ; Walters, William A ; Berg-Lyons, Donna ; Huntley, James ; Fierer, Noah ; Owens, Sarah M ; Betley, Jason ; Fraser, Louise ; Bauer, Markus ; Gormley, Niall ; Gilbert, Jack A ; Smith, Geoff ; Knight, Rob

The ISME Journal, 2012-08, Vol.6 (8), p.1621-1624 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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