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A brief history of bioinformatics
A brief history of bioinformatics
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A brief history of bioinformatics

Gauthier, Jeff ; Vincent, Antony T ; Charette, Steve J ; Derome, Nicolas

Briefings in bioinformatics, 2019-11, Vol.20 (6), p.1981-1996 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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2
High-quality de novo assembly of the apple genome and methylome dynamics of early fruit development
High-quality de novo assembly of the apple genome and methylome dynamics of early fruit development
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High-quality de novo assembly of the apple genome and methylome dynamics of early fruit development

Daccord, Nicolas ; Celton, Jean-Marc ; Linsmith, Gareth ; Becker, Claude ; Choisne, Nathalie ; Schijlen, Elio ; van de Geest, Henri ; Bianco, Luca ; Micheletti, Diego ; Velasco, Riccardo ; Di Pierro, Erica Adele ; Gouzy, Jérôme ; Rees, D Jasper G ; Guérif, Philippe ; Muranty, Hélène ; Durel, Charles-Eric ; Laurens, François ; Lespinasse, Yves ; Gaillard, Sylvain ; Aubourg, Sébastien ; Quesneville, Hadi ; Weigel, Detlef ; van de Weg, Eric ; Troggio, Michela ; Bucher, Etienne

Nature genetics, 2017-07, Vol.49 (7), p.1099-1106 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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3
Comparative genomics of the nonlegume Parasponia reveals insights into evolution of nitrogen-fixing rhizobium symbioses
Comparative genomics of the nonlegume Parasponia reveals insights into evolution of nitrogen-fixing rhizobium symbioses
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Comparative genomics of the nonlegume Parasponia reveals insights into evolution of nitrogen-fixing rhizobium symbioses

van Velzen, Robin ; Holmer, Rens ; Bu, Fengjiao ; Rutten, Luuk ; van Zeijl, Arjan ; Liu, Wei ; Santuari, Luca ; Cao, Qingqin ; Sharma, Trupti ; Shen, Defeng ; Roswanjaya, Yuda ; Wardhani, Titis A. K. ; Kalhor, Maryam Seifi ; Jansen, Joelle ; van den Hoogen, Johan ; Güngör, Berivan ; Hartog, Marijke ; Hontelez, Jan ; Verver, Jan ; Yang, Wei-Cai ; Schijlen, Elio ; Repin, Rimi ; Schilthuizen, Menno ; Schranz, M. Eric ; Heidstra, Renze ; Miyata, Kana ; Fedorova, Elena ; Kohlen, Wouter ; Bisseling, Ton ; Smit, Sandra ; Geurts, Rene

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2018-05, Vol.115 (20), p.E4700-E4709 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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4
raxmlGUI 2.0: A graphical interface and toolkit for phylogenetic analyses using RAxML
raxmlGUI 2.0: A graphical interface and toolkit for phylogenetic analyses using RAxML
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raxmlGUI 2.0: A graphical interface and toolkit for phylogenetic analyses using RAxML

Edler, Daniel ; Klein, Johannes ; Antonelli, Alexandre ; Silvestro, Daniele ; Matschiner, Michael Matschiner, Michael

Methods in ecology and evolution, 2021-02, Vol.12 (2), p.373-377 [Periódico revisado por pares]

London: John Wiley & Sons, Inc

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5
Next-Generation Sequencing and Agriculture
Next-Generation Sequencing and Agriculture
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Next-Generation Sequencing and Agriculture

Bayer, Philipp ; Edwards, David David, Edwards ; Philipp E., Bayer

Oxford: CABI 2022

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Fast and Accurate Protein False Discovery Rates on Large-Scale Proteomics Data Sets with Percolator 3.0
Fast and Accurate Protein False Discovery Rates on Large-Scale Proteomics Data Sets with Percolator 3.0
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Fast and Accurate Protein False Discovery Rates on Large-Scale Proteomics Data Sets with Percolator 3.0

The, Matthew ; MacCoss, Michael J. ; Noble, William S. ; Käll, Lukas

Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2016-11, Vol.27 (11), p.1719-1727 [Periódico revisado por pares]

New York: Springer US

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7
The UNITE database for molecular identification of fungi: handling dark taxa and parallel taxonomic classifications
The UNITE database for molecular identification of fungi: handling dark taxa and parallel taxonomic classifications
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The UNITE database for molecular identification of fungi: handling dark taxa and parallel taxonomic classifications

Nilsson, Rolf Henrik ; Larsson, Karl-Henrik ; Taylor, Andy F S ; Bengtsson-Palme, Johan ; Jeppesen, Thomas S ; Schigel, Dmitry ; Kennedy, Peter ; Picard, Kathryn ; Glöckner, Frank Oliver ; Tedersoo, Leho ; Saar, Irja ; Kõljalg, Urmas ; Abarenkov, Kessy

Nucleic acids research, 2019-01, Vol.47 (D1), p.D259-D264 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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8
HiC-Pro: an optimized and flexible pipeline for Hi-C data processing
HiC-Pro: an optimized and flexible pipeline for Hi-C data processing
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HiC-Pro: an optimized and flexible pipeline for Hi-C data processing

Servant, Nicolas ; Varoquaux, Nelle ; Lajoie, Bryan R ; Viara, Eric ; Chen, Chong-Jian ; Vert, Jean-Philippe ; Heard, Edith ; Dekker, Job ; Barillot, Emmanuel

Genome Biology, 2015-12, Vol.16 (1), p.259-259, Article 259 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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9
Mathematical Foundations of Quantum Information and Computation and Its Applications to Nano- and Bio-systems
Mathematical Foundations of Quantum Information and Computation and Its Applications to Nano- and Bio-systems
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Mathematical Foundations of Quantum Information and Computation and Its Applications to Nano- and Bio-systems

Ohya, Masanori Volovich, I

Dordrecht: Springer Nature 2011

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10
Trends in the development of miRNA bioinformatics tools
Trends in the development of miRNA bioinformatics tools
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Trends in the development of miRNA bioinformatics tools

Chen, Liang ; Heikkinen, Liisa ; Wang, Changliang ; Yang, Yang ; Sun, Huiyan ; Wong, Garry

Briefings in bioinformatics, 2019-09, Vol.20 (5), p.1836-1852 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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