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Genome-driven evolutionary game theory helps understand the rise of metabolic interdependencies in microbial communities
Genome-driven evolutionary game theory helps understand the rise of metabolic interdependencies in microbial communities
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Genome-driven evolutionary game theory helps understand the rise of metabolic interdependencies in microbial communities

Zomorrodi, Ali R ; Segrè, Daniel

Nature communications, 2017-11, Vol.8 (1), p.1563-12, Article 1563 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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2
Visualization of Metabolic Interaction Networks in Microbial Communities Using VisANT 5.0
Visualization of Metabolic Interaction Networks in Microbial Communities Using VisANT 5.0
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Visualization of Metabolic Interaction Networks in Microbial Communities Using VisANT 5.0

Granger, Brian R ; Chang, Yi-Chien ; Wang, Yan ; DeLisi, Charles ; Segrè, Daniel ; Hu, Zhenjun Prlic, Andreas

PLoS computational biology, 2016-04, Vol.12 (4), p.e1004875-e1004875 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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3
Deep sequencing of the oral microbiome reveals signatures of periodontal disease
Deep sequencing of the oral microbiome reveals signatures of periodontal disease
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Deep sequencing of the oral microbiome reveals signatures of periodontal disease

Liu, Bo ; Faller, Lina L ; Klitgord, Niels ; Mazumdar, Varun ; Ghodsi, Mohammad ; Sommer, Daniel D ; Gibbons, Theodore R ; Treangen, Todd J ; Chang, Yi-Chien ; Li, Shan ; Stine, O Colin ; Hasturk, Hatice ; Kasif, Simon ; Segrè, Daniel ; Pop, Mihai ; Amar, Salomon Highlander, Sarah K.

PloS one, 2012-06, Vol.7 (6), p.e37919 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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4
Dialogue between skin microbiota and immunity
Dialogue between skin microbiota and immunity
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Dialogue between skin microbiota and immunity

Belkaid, Yasmine ; Segre, Julia A.

Science (American Association for the Advancement of Science), 2014-11, Vol.346 (6212), p.954-959 [Periódico revisado por pares]

United States: American Association for the Advancement of Science

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Interaction between the microbiome and TP53 in human lung cancer
Interaction between the microbiome and TP53 in human lung cancer
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Interaction between the microbiome and TP53 in human lung cancer

Greathouse, K Leigh ; White, James R ; Vargas, Ashely J ; Bliskovsky, Valery V ; Beck, Jessica A ; von Muhlinen, Natalia ; Polley, Eric C ; Bowman, Elise D ; Khan, Mohammed A ; Robles, Ana I ; Cooks, Tomer ; Ryan, Bríd M ; Padgett, Noah ; Dzutsev, Amiran H ; Trinchieri, Giorgio ; Pineda, Marbin A ; Bilke, Sven ; Meltzer, Paul S ; Hokenstad, Alexis N ; Stickrod, Tricia M ; Walther-Antonio, Marina R ; Earl, Joshua P ; Mell, Joshua C ; Krol, Jaroslaw E ; Balashov, Sergey V ; Bhat, Archana S ; Ehrlich, Garth D ; Valm, Alex ; Deming, Clayton ; Conlan, Sean ; Oh, Julia ; Segre, Julie A ; Harris, Curtis C

Genome Biology, 2018-08, Vol.19 (1), p.123-16, Article 123 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central

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6
Species-level analysis of DNA sequence data from the NIH Human Microbiome Project
Species-level analysis of DNA sequence data from the NIH Human Microbiome Project
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Species-level analysis of DNA sequence data from the NIH Human Microbiome Project

Conlan, Sean ; Kong, Heidi H ; Segre, Julia A Highlander, Sarah K.

PloS one, 2012-10, Vol.7 (10), p.e47075-e47075 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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7
The skin microbiome
The skin microbiome
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The skin microbiome

Segre, Julia A ; Grice, Elizabeth A

Nature reviews. Microbiology, 2011-04, Vol.9 (4), p.244-253 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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8
Exploiting the GTEx resources to decipher the mechanisms at GWAS loci
Exploiting the GTEx resources to decipher the mechanisms at GWAS loci
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Exploiting the GTEx resources to decipher the mechanisms at GWAS loci

Barbeira, Alvaro N ; Bonazzola, Rodrigo ; Gamazon, Eric R ; Liang, Yanyu ; Park, YoSon ; Kim-Hellmuth, Sarah ; Wang, Gao ; Jiang, Zhuoxun ; Zhou, Dan ; Hormozdiari, Farhad ; Liu, Boxiang ; Rao, Abhiram ; Hamel, Andrew R ; Pividori, Milton D ; Aguet, François ; Bastarache, Lisa ; Jordan, Daniel M ; Verbanck, Marie ; Do, Ron ; Stephens, Matthew ; Ardlie, Kristin ; McCarthy, Mark ; Montgomery, Stephen B ; Segrè, Ayellet V ; Brown, Christopher D ; Lappalainen, Tuuli ; Wen, Xiaoquan ; Im, Hae Kyung

Genome Biology, 2021-01, Vol.22 (1), p.49-49, Article 49 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central

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9
Using an atlas of gene regulation across 44 human tissues to inform complex disease- and trait-associated variation
Using an atlas of gene regulation across 44 human tissues to inform complex disease- and trait-associated variation
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Using an atlas of gene regulation across 44 human tissues to inform complex disease- and trait-associated variation

Gamazon, Eric R ; Segrè, Ayellet V ; van de Bunt, Martijn ; Wen, Xiaoquan ; Xi, Hualin S ; Hormozdiari, Farhad ; Ongen, Halit ; Konkashbaev, Anuar ; Derks, Eske M ; Aguet, François ; Quan, Jie ; Nicolae, Dan L ; Eskin, Eleazar ; Kellis, Manolis ; Getz, Gad ; McCarthy, Mark I ; Dermitzakis, Emmanouil T ; Cox, Nancy J ; Ardlie, Kristin G

Nature genetics, 2018-07, Vol.50 (7), p.956-967 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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10
Biogeography and individuality shape function in the human skin metagenome
Biogeography and individuality shape function in the human skin metagenome
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Biogeography and individuality shape function in the human skin metagenome

Oh, Julia ; Byrd, Allyson L ; Deming, Clay ; Conlan, Sean ; Kong, Heidi H ; Segre, Julia A

Nature (London), 2014-10, Vol.514 (7520), p.59-64 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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