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Obtenção da fração de recombinação e da fase de ligação entre locos de marcadores moleculares em cana-de-açúcar, usando o programa Joinmap

M. M. Pastina A. N Meza; E. A Kido; A. P. de Souza; Antonio Vargas de Oliveira Figueira; Eugênio César Ulian; Antonio Augusto Franco Garcia; Simpósio Internacional de Iniciação Cientifica da Universidade de São Paulo (12. 2004 Piracicaba, SP)

Agropecuária; resumos São Paulo : USP, 2004

São Paulo USP 2004

Localização: ESALQ - Biblioteca Central    (CD E 757 12/2004 1430857 ) e outros locais(Acessar)

  • Título:
    Obtenção da fração de recombinação e da fase de ligação entre locos de marcadores moleculares em cana-de-açúcar, usando o programa Joinmap
  • Autor: M. M. Pastina
  • A. N Meza; E. A Kido; A. P. de Souza; Antonio Vargas de Oliveira Figueira; Eugênio César Ulian; Antonio Augusto Franco Garcia; Simpósio Internacional de Iniciação Cientifica da Universidade de São Paulo (12. 2004 Piracicaba, SP)
  • Assuntos: MARCADOR MOLECULAR; CANA-DE-AÇÚCAR
  • É parte de: Agropecuária; resumos São Paulo : USP, 2004
  • Descrição: A cana-de-açúcar, por ser uma espécie poliplóide, apresenta grande complexidade genômica. Uma das dificuldades adicionais para o mapeamento genético dessa espécie, é o fato de as fases de ligação entre os marcadores serem inicialmente desconhecidas. Entretanto, existem diversas metodologias estatísticas que permitem a estimativa dessas fases de ligação (associação ou repulsão). Nesse contexto, o presente trabalho teve por objetivo, primeiramente, identificar os grupos de ligação e a fase de ligação entre marcadores RFLP, SSR e AFLP localizados num mesmo cromossomo, e posteriormente, construir o mapa genético para a população em estudo, através do programa JoinMap. Os dados utilizados são referentes a uma progênie F1 proveniente do cruzamento entre duas variedades comerciais de cana-de-açúcar (SP 80-180 x SP 80-4966). Definiu-se frequência de recombinação 0,5 e LOD 5, como sendo os melhores critérios para a formação dos grupos de ligação, em virtude do elevado número de marcas (1118). As distâncias de mapeamento, expressas em centiMorgans (cM), foram calculadas com base na frequência de recombinação por meio da função de Kosambi. Ao final da etapa de mapeamento, foi obtido um mapa genético com 98 cromossomos, que apresentou comprimento total de 1331,09 cM, comprimento médio de 13,6 cM , número médio de 2,21 marcas por grupo num total de 217 marcas agrupadas e uma distância média entre locos de 6,13 cM
  • Editor: São Paulo USP
  • Data de criação/publicação: 2004
  • Formato: CD-ROM.
  • Idioma: Português
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