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Evaluation of genetic variability of sorghum ( Sorghum bicolor L. Moench) in northwestern Morocco by ISSR and RAPD markers

Medraoui, Leila ; Ater, Mohammed ; Benlhabib, Ouafae ; Msikine, Driss ; Filali-Maltouf, Abdelkarim

Comptes rendus. Biologies, 2007-11, Vol.330 (11), p.789-797 [Periódico revisado por pares]

Paris: Elsevier SAS

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  • Título:
    Evaluation of genetic variability of sorghum ( Sorghum bicolor L. Moench) in northwestern Morocco by ISSR and RAPD markers
  • Autor: Medraoui, Leila ; Ater, Mohammed ; Benlhabib, Ouafae ; Msikine, Driss ; Filali-Maltouf, Abdelkarim
  • Assuntos: Agronomy. Soil science and plant productions ; Biological and medical sciences ; DNA, Plant - genetics ; DNA, Plant - isolation & purification ; Fundamental and applied biological sciences. Psychology ; Generalities. Genetics. Plant material ; Genetic Markers ; Genetic resources, diversity ; Genetic variability ; Genetic Variation ; Genetics and breeding of economic plants ; Geography ; ISSR ; Moroccan landraces ; Morocco ; Phylogeny ; Plant material ; Polymorphism, Genetic ; Random Amplified Polymorphic DNA Technique ; RAPD ; Sorghum ; Sorghum - classification ; Sorghum - genetics ; Sorghum bicolor ; Sorghum bicolor L. Moench ; Variabilité génétique ; Variétés-populations
  • É parte de: Comptes rendus. Biologies, 2007-11, Vol.330 (11), p.789-797
  • Notas: ObjectType-Article-1
    SourceType-Scholarly Journals-1
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  • Descrição: The study of the genetic variability of the Moroccan landraces of sorghum constitutes a necessary step that can be exploited in the programs of improvement and valorisation of this marginalized species. The aim of this investigation is to evaluate the variability of sorghum populations and to establish their phylogenetic relations using RAPD and ISSR markers. Sampling was taken in 33 fields of northern regions where this species is most cultivated. Individual plants (398) were collected in 13, 11, 5, and 4 fields of Larache, Tangier, Chefchaouen, and Tetouan, respectively. Thirty-eight RAPD primers and four ISSR primers were used. The percentage of polymorphic fragments revealed with ISSR (98%) is higher than the one revealed with RAPD (85%). The level of the variability obtained through the two techniques is very high. Nevertheless, ISSR markers revealed more diversity than RAPD ( 0.995 ± 0.006 against 0.946 ± 0.031 ). The classification based on Jaccard's similarity index distinguished the totality of fields. Data analysis revealed a genetic structure that is closely related to the micro-geographical repartition of the different fields. To cite this article: L. Medraoui et al., C. R. Biologies 330 (2007). L'étude de la variabilité génétique des variétés-populations de sorgho grain marocain constitue une étape nécessaire à exploiter dans les programmes d'amélioration et de valorisation de cette céréale marginalisée. L'objectif de cette étude est d'évaluer la variabilité des populations de sorgho et d'établir leurs relations phylogénétiques via les marqueurs RAPD et ISSR. L'échantillonnage a été réalisé dans 33 champs au niveau de la région nord du Maroc, où cette espèce est largement cultivée. Il concerne 398 individus collectés respectivement dans 13, 11, 5 et 4 champs de Larache, Tanger, Chefchaouen et Tétouan. Trente-huit amorces RAPD et quatre amorces ISSR ont été utilisées. Le pourcentage de polymorphisme révélé avec ISSR (98%) est supérieur à celui révélé avec RAPD (85%). Le niveau de diversité obtenu par les deux techniques est élevé. Néanmoins, l'ISSR a montré plus de diversité que le RAPD ( 0 , 995 ± 0 , 006 , contre 0 , 946 ± 0 , 031 ). La classification selon l'indice de similarité de Jaccard a permis la distinction de la totalité des champs étudiés. L'analyse des données a révélé une structure génétique qui est étroitement liée à la répartition micro-géographique des différents champs. Pour citer cet article : L. Medraoui et al., C. R. Biologies 330 (2007).
  • Editor: Paris: Elsevier SAS
  • Idioma: Inglês;Francês
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