skip to main content
Idioma:
Tipo de recurso Mostra resultados com: Mostra resultados com: Índice

Sistema colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV

Araújo, Luciano Vieira De

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática 2008-05-13

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

  • Título:
    Sistema colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV
  • Autor: Araújo, Luciano Vieira De
  • Orientador: Ferreira, João Eduardo
  • Assuntos: Bioinformática
  • Notas: Tese (Doutorado)
  • Notas Locais: Programa Interunidades de Pós-graduação em Bioinformática
  • Descrição: Este trabalho apresenta o DBCollHIV, um ambiente computacional para estudos sobre o HIV. Ele é composto por um banco de dados e um conjunto de ferramentas de bioinformática para análise dos dados armazenados. O DBCollHIV atende desafios biológicos relacionados às pesquisas sobre HIV/AIDS como a criação de software para gerenciamento e análise de dados genéticos, clínicos, epidemiológicos e laboratoriais sobre o HIV em larga escala e com foco na validação da qualidade dos dados. Para tanto, sua arquitetura modular permite adaptar as estruturas de coleta e análise de dados para atender as necessidades apresentadas pelo avanço do conhecimento científico. O conjunto de ferramentas de análise desenvolvidas e disponíveis no DBCollHIV é formado pelo software PCR-Contamination utilizado para a identificação de possíveis contaminações ocorridas durante a obtenção das seqüências genéticas por PCR, pelo software HIVSetSubtype usado para subtipagem automática das seqüências do HIV, sejam de subtipos puros ou recombinantes e pelo software HIVdag, um ambiente para criação e execução de algoritmos para identificação de resistência às drogas usadas no tratamento de pacientes. Com o HIVdag, as regras de resistência às drogas são mapeadas para expressões da álgebra de processo, o que permite uso do arcabouço algébrico para geração automática e precisa dos algoritmos propostos pelos pesquisadores. O DBCollHIV permite o trabalho cooperativo por meio do compartilhamento de dados gerenciado pelo proprietário do dado e pelo reaproveitamento e evolução de sua estrutura computacional.
  • DOI: 10.11606/T.95.2008.tde-20230725-114553
  • Editor: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática
  • Data de criação/publicação: 2008-05-13
  • Formato: Adobe PDF
  • Idioma: Português
Links
Voltar para lista de resultados
Resultado  1 AvançarIr para próxima página

  • Realização: ABCD-USP USP   Logos de Redes Sociais: Freepik

Buscando em bases de dados remotas. Favor aguardar.