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Simulação computacional distribuída: aplicação a problemas de folding de heteropolímeros

Silva, Pablo Andrei

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto 2017-01-17

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

  • Título:
    Simulação computacional distribuída: aplicação a problemas de folding de heteropolímeros
  • Autor: Silva, Pablo Andrei
  • Orientador: Caliri, Antonio
  • Assuntos: Computação Distribuída; Folding; Proteínas; Distributed Computing; Proteins
  • Notas: Dissertação (Mestrado)
  • Descrição: Nesta dissertação apresentamos o desenvolvimento de ferramentas computacionais dedicadas a racionalizar processos que envolvem simulações Monte Carlo e análises de suas aplicações; são evocados conceitos pertinentes às principais áreas envolvidas (computação, tecnologia da informação, matemática e física). São introduzidas e discutidas técnicas de simulação computacional distribuída e o método Monte Carlo, com ênfase à aplicação em heteropolímeros. Exemplos ilustrativos de aplicação da ferramenta também são providos, mediante simulações e análise dos resultados de três tipos de cadeias heteropoliméricas em rede regular: cadeia polar (todos monômeros polares); cadeia hidrofóbica (todos monômeros apolares); cadeia com mescla de monômeros polares e apolares (modelo HP). O propósito motivador deste trabalho é o estudo do problema de folding de heteropolímeros, o que inclui proteínas. Contudo, a ferramenta em questão, poderá ser generalizada e aplicada a praticamente todos os tipos de polímeros lineares em rede, pois o usuário poderá definir e implementar o modelo de cadeia que desejar
  • DOI: 10.11606/D.60.2017.tde-04052017-093725
  • Editor: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto
  • Data de criação/publicação: 2017-01-17
  • Formato: Adobe PDF
  • Idioma: Português

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