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Identification of quantitative trait loci (QTL) for plant structure, growth habit and yield in lentil

Pérez de la Vega, M ; Fratini, R ; Durán, Y ; García, P.,Universidad de León (España). Facultad de Ciencias Biológicas y Ambientales

Spanish journal of agricultural research : SJAR, 2007-09, Vol.5 (3), p.348-356 [Periódico revisado por pares]

Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA)

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Título:
Identification of quantitative trait loci (QTL) for plant structure, growth habit and yield in lentil
Autor: Pérez de la Vega, M ; Fratini, R ; Durán, Y ; García, P.,Universidad de León (España). Facultad de Ciencias Biológicas y Ambientales
Assuntos: AMELIORATION DES PLANTES ; ANATOMIA DE LA PLANTA ; ANATOMIE VEGETALE ; CARTE GENETIQUE ; cartografiado de características métricas ; CROP YIELD ; ETAPAS DE DESARROLLO DE LA PLANTA ; F2 HYBRIDS ; FITOMEJORAMIENTO ; genetic map ; GENETIC MAPS ; GENETIC MARKERS ; HIBRIDACION INTERESPECIFICA ; HIBRIDOS F2 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_10176 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_16092 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_24002 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_24030 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_26794 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_3791 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_37974 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_4261 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_5954 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_5956 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_5959 ; HYBRIDATION INTERSPECIFIQUE ; HYBRIDE F2 ; IDENTIFICACION ; IDENTIFICATION ; INTERSPECIFIC HYBRIDIZATION ; LENS CULINARIS ; linkage map ; LOCI DE RASGOS CUANTITATIVOS ; LOCUS DES CARACTERES QUANTITATIFS ; mapa de ligamiento ; mapa genético ; MAPAS GENETICOS ; mapping metric characteristics ; MARCADORES GENETICOS ; marcadores genéticos ; MARQUEUR GENETIQUE ; PLANT ANATOMY ; PLANT BREEDING ; PLANT DEVELOPMENTAL STAGES ; QUANTITATIVE TRAIT LOCI ; RENDEMENT DES CULTURES ; RENDIMIENTO DE CULTIVOS ; STADE DE DEVELOPPEMENT VEGETAL
É parte de: Spanish journal of agricultural research : SJAR, 2007-09, Vol.5 (3), p.348-356
Notas: 2007001856
F30
http://www.inia.es/gcontrec/pub/348-356-Identification_1188556256531.pdf
Descrição: Se han cartografiado loci cuantitativos (QTL) de lenteja relacionados con la estructura de la planta (ramificaciones en el primer nudo, altura del primer nudo, número total de ramificaciones, altura de la planta), el ciclo de crecimiento (momento de floración, dehiscencia de vainas) y el rendimiento (número de semillas, peso de la semilla, diámetro de la semilla) utilizando una población F2 derivada del cruzamiento intersubespecífico de Lens culinaris ssp. culinaris por L. c. ssp. orientalis. Se encontraron varias características significativamente correlacionadas. Aplicando los métodos de los marcadores flanqueantes simple y compuesto, se localizó un total de 23 QTL para nueve características cuantitativas. No se identificó ningún QTL para el número de semillas F3 producidas. Se localizaron seis QTL respectivamente en los grupos de ligamiento III y VI, y cinco QTL en el grupo de ligamiento I. En cada uno de los restantes grupos de ligamiento se localizó uno o dos QTL, excepto en los grupos de ligamiento VII y IX, en los que no se hallaron QTL. El modelo múltiple de QTL explicó más de un 80% de la varianza fenotípica observada con valores del logaritmo decimal del cociente de verosimilitudes (LOD) por encima de 10 para tres de las características cuantitativas analizadas (ramificaciones en el primer nudo, momento de floración, dehiscencia de vainas). La varianza fenotípica explicada para el resto de las características fue relativamente baja, entre 50% y 20%, con valores LOD oscilando entre 4 y 8. Se discute la posible homología entre algunos QTL y otros previamente descritos en relación a su localización cromosómica. Lentil quantitative trait loci (QTL) related to plant structure (branches at first node, height of first node, total number of branches, plant height), growth habit (flowering time, pod dehiscence) and yield (number of seeds, seed weight, seed diameter) were located using a F2 population of 113 individuals derived from the intersubspecific cross of Lens culinaris ssp. culinaris and L. c. ssp. orientalis. Several traits were found to be significantly correlated. Using interval and composite interval mapping a total of 23 QTL for nine quantitative traits were located. No QTL was identified for the number of F3 seed produced. Six QTL were positioned respectively in linkage groups III and VI, and five QTL in linkage group I. Each remaining group included one or two QTL, except groups VII and IX where no QTL was found. The multiple QTL model explained more than 80% of the observed phenotypic variance with logarithm of the odds (LOD) scores above 10 for three of the quantitative traits analyzed (branches at first node, flowering time, and dehiscence). For the remaining traits the phenotypic variance explained was relatively low, between the 50% and 20%, and the LOD scores ranged between 4 and 8. The possible homology between some QTL and other previously described is discussed in relation to their chromosomal location.
Editor: Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA)
Idioma: Inglês

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Identification of quantitative trait loci (QTL) for plant structure, growth habit and yield in lentil

Pérez de la Vega, M ; Fratini, R ; Durán, Y ; García, P.,Universidad de León (España). Facultad de Ciencias Biológicas y Ambientales

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