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Evidence of a new rotavirus P genotype in porcine samples from southern Brazil

S S Kroeff V Munford; T A R Caruzo; Edison Luiz Durigon; M L Rácz; Congresso Instituto Ciências Biomédicas, IV (2002 São Paulo)

Resumos São Paulo: Comissão de Cultura e Extensão Universitária do ICB/USP, 2002

São Paulo Comissão de Cultura e Extensão Universitária do ICB/USP 2002

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  • Título:
    Evidence of a new rotavirus P genotype in porcine samples from southern Brazil
  • Autor: S S Kroeff
  • V Munford; T A R Caruzo; Edison Luiz Durigon; M L Rácz; Congresso Instituto Ciências Biomédicas, IV (2002 São Paulo)
  • Assuntos: MICROBIOLOGIA
  • É parte de: Resumos São Paulo: Comissão de Cultura e Extensão Universitária do ICB/USP, 2002
  • Descrição: Porcine rotaviruses are a significant cause of diarrhea in swine farms worldwide. A total of 59 porcine rotavirus positive samples were previously characterized for G and P genotypes by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) with specific primers for porcine, bovine and human rotavirus genotypes. Common porcine G serotypes and P genotypes G3, G4, G5, P[6] and P[7] and atypical serotypes G9 and G10 were detected. Two samples (ICB2191 and ICB2212), from different farms in the same region (Castro, Paraná), displaying G5,P[6] (M37 like), a P genotype normally associated with viruses causing infection in humans, were characterized by partial sequencing of VP4 gene. Analysis of the VP4 nucleotide sequences for these two samples showed 98.8% nucleotide identity to each other, while in comparison with various viruses sequences, representing all 21 P genotypes, results were 79.4% and 78.1% nucleotide identity with the porcine P[13] MDR-13 and less than 60.2% and 59.2% with other P genotypes, including identity of 52.6% and 52.0% with P[6] human rotavirus. Our results suggest that a new P genotype may be occurring in porcine farms in Southern Brazil
  • Editor: São Paulo Comissão de Cultura e Extensão Universitária do ICB/USP
  • Data de criação/publicação: 2002
  • Formato: 1. (várias paginações) poster 377.; Disponível em CD-ROM.
  • Idioma: Inglês
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