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Mapeamento genético de marcadores AFLP e de retrotransposons em cana-de-açúcar (Saccharum spp.)

Palhares, Alessandra Carolina

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz 2010-05-17

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

  • Título:
    Mapeamento genético de marcadores AFLP e de retrotransposons em cana-de-açúcar (Saccharum spp.)
  • Autor: Palhares, Alessandra Carolina
  • Orientador: Vieira, Maria Lucia Carneiro
  • Assuntos: Cana-De-Açúcar; Polimorfismo; Marcador Genético; Mapamento Genético; Genomas; Genomes; Genetic Marker; Genetic Mapping; Polymorphism; Sugarcane
  • Notas: Dissertação (Mestrado)
  • Descrição: No presente trabalho, AFLPs e marcadores baseados em retrotransposons foram utilizados para a construção de um mapa de ligação integrado em cana-de-açúcar. Dois retrotransposons encontrados no genoma da cana-de-açúcar, denominados SURE e Garapa, foram estudados. Os princípios da técnica NBS-profiling foram usados para gerar marcadores direcionados às sequências desses retrotransposons. Os marcadores foram analisados numa população F1 de cana-de-açúcar, composta por 188 indivíduos, oriunda do cruzamento entre os genitores IAC66-6 e TUC71-7. O mapa integrado foi construído usando-se o software OneMap, especialmente desenvolvido para mapear espécies não endogâmicas. Excelentes padrões de AFLP e de marcas direcionadas ao retrotransposon SURE foram obtidos; entretanto, para o Garapa, ainda são necessários ajustes na técnica. Um total de 600 marcadores de dose única foi obtido a partir de 22 combinações de enzimas de restrição/primers de AFLP e seis combinações otimizadas para amplificar marcas direcionadas ao retrotransposon SURE. Construiu-se um mapa com 107 grupos de ligação, com tamanho de 4.316,5 cM e densidade de 8,74 cM/marcador. O mapeamento dos marcadores derivados do retrotransposon SURE revelou que esse elemento não está uniformemente distribuído nos grupos de ligação e confirmou o seu baixo número de cópias no genoma da cana, conforme foi sugerido na literatura.
  • DOI: 10.11606/D.11.2010.tde-24052010-105229
  • Editor: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz
  • Data de criação/publicação: 2010-05-17
  • Formato: Adobe PDF
  • Idioma: Português
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