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Uma abordagem de integração de dados públicos sobre comorbidade para a predição de associação de doenças complexas

Silva, Carla Fernandes Da

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto 2019-05-02

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

  • Título:
    Uma abordagem de integração de dados públicos sobre comorbidade para a predição de associação de doenças complexas
  • Autor: Silva, Carla Fernandes Da
  • Orientador: Ruiz, Evandro Eduardo Seron
  • Assuntos: Integração De Dados; Predição De Comorbidades; Predição De Links; Comorbidity Prediction; Data Integration; Link Prediction
  • Notas: Dissertação (Mestrado)
  • Descrição: Comorbidade é a coocorrência de dois ou mais distúrbios em uma pessoa. Identificar quais fatores genéticos ou quais são os mecanismos subjacentes à comorbidade é um grande desafio da ciência. Outra constatação relevante é que muitos pares de doenças que compartilham genes comuns não mostram comorbidade significativa nos registros clínicos. Vários estudos clínicos e epidemiológicos têm demonstrado que a comorbidade é uma situação médica universal porque pacientes com vários transtornos médicos são a regra e não a exceção. Neste trabalho, é proposta uma metodologia de predição de associação doença-doença por meio da integração de dados públicos sobre genes e sobre doenças e suas comorbidades. Analisando as redes formadas pelos genes e pelas doenças, a partir da utilização de cinco métodos de predição de links: Vizinhos Comuns, Adamic-Adar, Índice de Conexão Preferencial, Índice de Alocação de Recursos e Katz, a fim de encontrar novas relações de comorbidade. Como resultados foram criadas duas redes: uma rede epidemiológica chamada de rede_DATASUS com 1.941 nós e 248.508 arestas e uma rede gênica, rede_KEGG, com 288 nós e 1.983 arestas. E a predição em cima da rede_KEGG, e dentre as associações de doenças preditas e analisadas encontramos 6 associações preditas que estão presentes na rede_DATASUS e relatos na literatura. Acreditamos que as associações entre genes podem elucidar as causas de algumas comorbidades
  • DOI: 10.11606/D.59.2019.tde-30062019-204038
  • Editor: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto
  • Data de criação/publicação: 2019-05-02
  • Formato: Adobe PDF
  • Idioma: Português
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