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Prediccion a escala genomica de componentes de Saccharomyces cerevisiae mediante analisis de balance de flujos

Vargas Garcia, César Augusto ; Arguello Fuentes, Henry ; Torres Sáez, Rodrigo Gonzalo

Revista Colombiana de biotecnologia, 2012-08, Vol.14 (1), p.93-107 [Periódico revisado por pares]

Universidad Nacional de Colombia, Instituto de Biotecnologia

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  • Título:
    Prediccion a escala genomica de componentes de Saccharomyces cerevisiae mediante analisis de balance de flujos
  • Autor: Vargas Garcia, César Augusto ; Arguello Fuentes, Henry ; Torres Sáez, Rodrigo Gonzalo
  • Assuntos: analisis de balance de flujos ; BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY ; cerevisiae ; flux balance analysis ; genome scale reconstructions ; iMM904 ; reconstrucción a escala genómica ; S. cerevisiae
  • É parte de: Revista Colombiana de biotecnologia, 2012-08, Vol.14 (1), p.93-107
  • Descrição: El microorganismo Saccharomyces cerevisiae cuenta con gran número de modelos biológicos conocidos como reconstrucciones, las cuales pueden ser a escala genómica. De estas reconstrucciones a escala genómica provienen los modelos matemáticos, también llamados modelos estequiométricos. Una de las técnicas más usadas para estudiar estos modelos es el Análisis de Balance de Flujos (FBA). El proposito del FBA es predecir el crecimiento del microorganismo bajo estudio, y la producción y consumo de componentes como el etanol, C[O.sub.2], glicerol, sucinato, acetato y piruvato. Para determinar si las predicciones obtenidas mediante FBA son únicas se utiliza la técnica de Análisis de Variabilidad Flujos (FVA). El presente trabajo muestra los resultados de aplicar el FBA a la reconstrucción reciente del microorganismo S. cerevisiae, la denominada iMM904 y los compara con un conjunto de datos experimentales presente en la literatura. Este trabajo también estudia la existencia de múltiples predicciones FBA utilizando la técnica FVA. Los resultados ilustran que es posible predecir el crecimiento del microorganimo S. cerevisiae, con errores entre el 11% y 28%; la producción de C[O.sub.2], con errores entre el 0.3% y 4.5% y la producción de etanol, con errores entre el 11% y 13%.
  • Editor: Universidad Nacional de Colombia, Instituto de Biotecnologia
  • Idioma: Espanhol;Português
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