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Clonagem de um cDNA de Arabidopsis thaliana homólogo ao gene humano XPB envolvido em reparo de DNA e transcrição

Denise Teixeira Ribeiro Carlos Frederico Martins Menck

1997

Localização: IB - Instituto de Biociências    (D-670 )(Acessar)

  • Título:
    Clonagem de um cDNA de Arabidopsis thaliana homólogo ao gene humano XPB envolvido em reparo de DNA e transcrição
  • Autor: Denise Teixeira Ribeiro
  • Carlos Frederico Martins Menck
  • Assuntos: GENÉTICA
  • Notas: Tese (Doutorado)
  • Descrição: O gene humano XPB, deficiente em pacientes de xeroderma pigmentosum do grupo de complementação B, codifica um DNA helicaste ATP-dependente envolvida em várias vias metabólicas, incluindo reparo de DNA e transcrição. A alta conseração deste gene permitiu a clonagem de homólogos em várias espécies, como camundongo, Drosophila e levedura. Ao contrário destes organismos, as bases moleculares do reparo por excisão de nucleotídeos em plantas é totalmente desconhecida. Um fragmento homólogo ao gene XPB foi isolado em Arabidopsis thaliana através de PCR ("polymerase chain reaction") com oligonucleotídeos degenerados, baseados em domínios da proteína conservados entre várias espécies. A triagem de clones em uma biblioteca de cDNA de Arabidopsis levou à identificação e isolamento de um clone de cDNA com 2.670 bp codificando uma proteína predita de 767 aminoácidos, denominada araXPB. A análise comparativa do DNA genômico com o cDNA por PCR revelou um padrão de distribuição de introns diferente do gene humano. A hibridação do RNA total da planta em "northern blot" com o cDNA isolado revelou um transcrito principal, com tamanho estimado em 2.800 b, em concordância com o tamanho do cDNA. A proteína araXPB tem aproximadamente 50% de identidade e 70% de similaridade com proteínas homólogas de levedura e humana. A proteína vegetal mantém todos os domínios funcionais encontrados nas outras proteínas, incluindo o sinal de localização nuclear, o domínio de ligação ao DNA e os
    motivos helicase, sugerindo que também deve atuar na transição e reparo de DNA em plantas. No entanto, o cDNA do araXPB não foi capaz de complementar células de ovário de hamster chinês deficientes em XPB (CHO 27-1). É provável que a proteína não funcione em sistemas heterólogos devido à necessidade de interação em um complexo protéico, como ocorre com as proteínas de levedura e humana
  • Data de criação/publicação: 1997
  • Formato: 122 p.
  • Idioma: Português
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