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Introdução à genômica comparativa e funcional de Leishmania braziliensis através do uso de transposons

Eliane Cristina Laurentino Angela kaysel Cruz

2005

Localização: FMRP - Fac. Medicina de Ribeirão Preto    (Laurentino, Eliane Cristina )(Acessar)

  • Título:
    Introdução à genômica comparativa e funcional de Leishmania braziliensis através do uso de transposons
  • Autor: Eliane Cristina Laurentino
  • Angela kaysel Cruz
  • Assuntos: LEISHMANIA BRASILIENSIS; GENOMAS (ANÁLISE); GENÉTICA MOLECULAR
  • Notas: Tese (Doutorado)
  • Descrição: Nosso trabalho teve como objetivo conduzir estudos sobre o conteúdo do genoma deLeishmania Viannia brasiliensis conduzindo análises comparativas de organização de genoma e paralelamente desenvolvendo abordagens que permitam a análise funcional desse genoma. Para tanto, seguimos duas abordagens: i) avaliação do conteúdo do genoma através do uso de uma biblioteca de fragmentos aleatórios de L. (V.) brasiliensis submetida a sequenciamento por passagem única (GSSs -"genome survey sequences"), ii) desenvolvimento e teste de um sistema de transposição in vitro adequado para funcionar como captador de genes ("gene trapping"). A análise in silico do seqüenciamento de fragmentos aleatórios do genoma incluem busca por similaridades com seqüências depositadas em bancos de dados de domínio público, classificação funcional de genes putativos e comparação com genoma de organismos já completamente seqüenciados, com os tripanossomatídeos e, particularmente, com Leishmania major. A análise dos resultados o seqüenciamento da biblioteca de GSSs revelou que o baixo valor encontrado para similaridade entre as espécies comparadas, L. major e L. braziliensis (~60%), se deve predominantemente à baixa conservação das regiões não codificadoras. Um grande volume de genes conhecidos e hipotéticos envolvidos nos mais diferentes processos celulares foram identificados;estes representam um vasto material a ser explorado. Os estudos funcionais foram conduzidos com um sistema de
    transposição in vitro baseado no Tn5 e os resultados encontrados indicam que o método tem potencial aplicação para a captura de genes e mas requer ajustes para se tomar mais eficiente. Sistemas de transposição constituem uma ferramenta importante para análises sistemáticas de genomas e devem contribuir para a identificação e anotação dos genes. Em adição, os resultados e análises de GSSs permitiram avaliar e caracterizar de maneira preliminar o genoma de ... L. braziliensis e deve representar uma contribuição para uma compreensão da biologia destes parasitas
  • Data de criação/publicação: 2005
  • Formato: 81 p. anexos.
  • Idioma: Português
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