Feature-based molecular networking in the GNPS analysis environment

Nothias, Louis-Félix ; Petras, Daniel ; Schmid, Robin ; Dührkop, Kai ; Rainer, Johannes ; Sarvepalli, Abinesh ; Protsyuk, Ivan ; Ernst, Madeleine ; Tsugawa, Hiroshi ; Fleischauer, Markus ; Aicheler, Fabian ; Aksenov, Alexander A ; Alka, Oliver ; Allard, Pierre-Marie ; Barsch, Aiko ; Cachet, Xavier ; Caraballo-Rodriguez, Andres Mauricio ; Da Silva, Ricardo R ; Dang, Tam ; Garg, Neha ; Gauglitz, Julia M ; Gurevich, Alexey ; Isaac, Giorgis ; Jarmusch, Alan K ; Kameník, Zdeněk ; Kang, Kyo Bin ; Kessler, Nikolas ; Koester, Irina ; Korf, Ansgar ; Le Gouellec, Audrey ; Ludwig, Marcus ; Martin H, Christian ; McCall, Laura-Isobel ; McSayles, Jonathan ; Meyer, Sven W ; Mohimani, Hosein ; Morsy, Mustafa ; Moyne, Oriane ; Neumann, Steffen ; Neuweger, Heiko ; Nguyen, Ngoc Hung ; Nothias-Esposito, Melissa ; Paolini, Julien ; Phelan, Vanessa V ; Pluskal, Tomáš ; Quinn, Robert A ; Rogers, Simon ; Shrestha, Bindesh ; Tripathi, Anupriya ; van der Hooft, Justin J J ; Vargas, Fernando ; Weldon, Kelly C ; Witting, Michael ; Yang, Heejung ; Zhang, Zheng ; Zubeil, Florian ; Kohlbacher, Oliver ; Böcker, Sebastian ; Alexandrov, Theodore ; Bandeira, Nuno ; Wang, Mingxun ; Dorrestein, Pieter C

United States: Nature Publishing Group

Texto completo disponível

TransDiscovery: Discovering Biotransformation from Human Microbiota by Integrating Metagenomic and Metabolomic Data

Yan, Donghui ; Cao, Liu ; Zhou, Muqing ; Mohimani, Hosein

Switzerland: MDPI AG

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Nerpa: A Tool for Discovering Biosynthetic Gene Clusters of Bacterial Nonribosomal Peptides

Kunyavskaya, Olga ; Tagirdzhanov, Azat M. ; Caraballo-Rodríguez, Andrés Mauricio ; Nothias, Louis-Félix ; Dorrestein, Pieter C. ; Korobeynikov, Anton ; Mohimani, Hosein ; Gurevich, Alexey

Basel: MDPI AG

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Sharing and community curation of mass spectrometry data with Global Natural Products Social Molecular Networking

Wang, Mingxun ; Carver, Jeremy J ; Phelan, Vanessa V ; Sanchez, Laura M ; Garg, Neha ; Peng, Yao ; Nguyen, Don Duy ; Watrous, Jeramie ; Kapono, Clifford A ; Porto, Carla ; Bouslimani, Amina ; Melnik, Alexey V ; Meehan, Michael J ; Liu, Wei-Ting ; Esquenazi, Eduardo ; Sandoval-Calderón, Mario ; Kersten, Roland D ; Quinn, Robert A ; Duncan, Katherine R ; Hsu, Cheng-Chih ; Floros, Dimitrios J ; Gavilan, Ronnie G ; Kleigrewe, Karin ; Northen, Trent ; Dutton, Rachel J ; Carlson, Erin E ; Aigle, Bertrand ; Michelsen, Charlotte F ; Jelsbak, Lars ; Edlund, Anna ; McLean, Jeffrey ; Piel, Jörn ; Murphy, Brian T ; Liaw, Chih-Chuang ; Yang, Yu-Liang ; Humpf, Hans-Ulrich ; Maansson, Maria ; Keyzers, Robert A ; Sims, Amy C ; Johnson, Andrew R ; Sidebottom, Ashley M ; Sedio, Brian E ; Klitgaard, Andreas ; Larson, Charles B ; P, Cristopher A Boya ; Torres-Mendoza, Daniel ; Gonzalez, David J ; Silva, Denise B ; Demarque, Daniel P ; Pociute, Egle ; O'Neill, Ellis C ; Briand, Enora ; Helfrich, Eric J N ; Granatosky, Eve A ; Glukhov, Evgenia ; Ryffel, Florian ; Mohimani, Hosein ; Kharbush, Jenan J ; Vorholt, Julia A ; Charusanti, Pep ; Vuong, Lisa ; Elfeki, Maryam ; Engene, Niclas ; Koyama, Nobuhiro ; Vining, Oliver B ; Baric, Ralph ; Silva, Ricardo R ; Mascuch, Samantha J ; Tomasi, Sophie ; Agarwal, Vinayak ; Williams, Philip G ; Dai, Jingqui ; Gurr, Joshua ; Rodríguez, Andrés M C ; Lamsa, Anne ; Zhang, Chen ; Dorrestein, Kathleen ; Almaliti, Jehad ; Phapale, Prasad ; Nothias, Louis-Felix ; Litaudon, Marc ; Wolfender, Jean-Luc ; Kyle, Jennifer E ; Metz, Thomas O ; Peryea, Tyler ; Nguyen, Dac-Trung ; VanLeer, Danielle ; Müller, Rolf ; Waters, Katrina M ; Shi, Wenyuan ; Liu, Xueting ; Zhang, Lixin ; Jensen, Paul R ; Palsson, Bernhard O ; Pogliano, Kit ; Linington, Roger G ; Gutiérrez, Marcelino ; Lopes, Norberto P ; Moore, Bradley S ; Dorrestein, Pieter C

United States: Nature Publishing Group

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Fast mass spectrometry search and clustering of untargeted metabolomics data

Mongia, Mihir ; Yasaka, Tyler M ; Liu, Yudong ; Guler, Mustafa ; Lu, Liang ; Bhagwat, Aditya ; Behsaz, Bahar ; Wang, Mingxun ; Dorrestein, Pieter C ; Mohimani, Hosein

United States

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Multiplex de novo sequencing of peptide antibiotics

Mohimani, Hosein ; Liu, Wei-Ting ; Yang, Yu-Liang ; Gaudêncio, Susana P ; Fenical, William ; Dorrestein, Pieter C ; Pevzner, Pavel A

United States: Mary Ann Liebert, Inc

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Sharing and community curation of mass spectrometry data with GNPS

Wang, Mingxun ; Carver, Jeremy J ; Phelan, Vanessa V ; Sanchez, Laura M ; Garg, Neha ; Peng, Yao ; Nguyen, Don Duy ; Watrous, Jeramie ; Kapono, Clifford A ; Luzzatto-Knaan, Tal ; Bouslimani, Amina ; Melnik, Alexey V ; Meehan, Michael J ; Liu, Wei-Ting ; Crüsemann, Max ; Sandoval-Calderón, Mario ; Kersten, Roland D ; Quinn, Robert A ; Hsu, Cheng-Chih ; Gavilan, Ronnie G ; Kleigrewe, Karin ; Northen, Trent ; Dutton, Rachel J ; Parrot, Delphine ; Carlson, Erin E ; Aigle, Bertrand ; Michelsen, Charlotte F ; Jelsbak, Lars ; Sohlenkamp, Christian ; Pevzner, Pavel ; McLean, Jeffrey ; Piel, Jörn ; Murphy, Brian T ; Gerwick, Lena ; Liaw, Chih-Chuang ; Yang, Yu-Liang ; Humpf, Hans-Ulrich ; Keyzers, Robert A ; Sims, Amy C ; Johnson, Andrew R. ; Sidebottom, Ashley M ; Klitgaard, Andreas ; Larson, Charles B ; P., Cristopher A Boya ; Torres-Mendoza, Daniel ; Silva, Denise B ; Marques, Lucas M ; Demarque, Daniel P ; Pociute, Egle ; Briand, Enora ; Granatosky, Eve A ; Ryffel, Florian ; Houson, Hailey ; Mohimani, Hosein ; Kharbush, Jenan J ; Zeng, Yi ; Vorholt, Julia A ; Kurita, Kenji L ; Charusanti, Pep ; McPhail, Kerry L ; Nielsen, Kristian Fog ; Elfeki, Maryam ; Traxler, Matthew F ; Engene, Niclas ; Koyama, Nobuhiro ; Vining, Oliver B ; Baric, Ralph ; Silva, Ricardo R ; Mascuch, Samantha J ; Hoffman, Thomas ; Agarwal, Vinayak ; Dai, Jingqui ; Gurr, Joshua ; Rodríguez, Andrés M. C. ; Zhang, Chen ; Dorrestein, Kathleen ; Duggan, Brendan M ; Phapale, Prasad ; Nothias, Louis-Felix ; Litaudon, Marc ; Wolfender, Jean-Luc ; Kyle, Jennifer E ; Metz, Thomas O ; Peryea, Tyler ; Nguyen, Dac-Trung ; VanLeer, Danielle ; Shinn, Paul ; Jadhav, Ajit ; Müller, Rolf ; Waters, Katrina M ; Shi, Wenyuan ; Zhang, Lixin ; Knight, Rob ; Jensen, Paul R ; Pogliano, Kit ; Linington, Roger G ; Gutiérrez, Marcelino ; Lopes, Norberto P ; Gerwick, William H ; Dorrestein, Pieter C

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