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Enhlink infers distal and context-specific enhancer–promoter linkages
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Enhlink infers distal and context-specific enhancer–promoter linkages

Poirion, Olivier B. ; Zuo, Wulin ; Spruce, Catrina ; Baker, Candice N. ; Daigle, Sandra L. ; Olson, Ashley ; Skelly, Daniel A. ; Chesler, Elissa J. ; Baker, Christopher L. ; White, Brian S.

Genome Biology, 2024-09, Vol.25 (1), p.235, Article 235 [Periódico revisado por pares]

London: BioMed Central

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2
VCF observer: a user-friendly software tool for preliminary VCF file analysis and comparison
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VCF observer: a user-friendly software tool for preliminary VCF file analysis and comparison

Emül, Abdullah Asım ; Ergün, Mehmet Arif ; Ertürk, Rumeysa Aslıhan ; Çinal, Ömer ; Baysan, Mehmet

BMC bioinformatics, 2024-09, Vol.25 (1), p.290, Article 290 [Periódico revisado por pares]

London: BioMed Central

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3
Variant graph craft (VGC): a comprehensive tool for analyzing genetic variation and identifying disease-causing variants
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Variant graph craft (VGC): a comprehensive tool for analyzing genetic variation and identifying disease-causing variants

Li, Jennifer ; Yang, Andy ; Carneiro, Benedito A. ; Gamsiz Uzun, Ece D. ; Massingham, Lauren ; Uzun, Alper

BMC bioinformatics, 2024-09, Vol.25 (1), p.288, Article 288 [Periódico revisado por pares]

London: BioMed Central

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4
SmithHunter: a workflow for the identification of candidate smithRNAs and their targets
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SmithHunter: a workflow for the identification of candidate smithRNAs and their targets

Marturano, Giovanni ; Carli, Diego ; Cucini, Claudio ; Carapelli, Antonio ; Plazzi, Federico ; Frati, Francesco ; Passamonti, Marco ; Nardi, Francesco

BMC bioinformatics, 2024-09, Vol.25 (1), p.286, Article 286 [Periódico revisado por pares]

London: BioMed Central

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5
BactEXTRACT: an R Shiny app to quickly extract, plot and analyse bacterial growth and gene expression data
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BactEXTRACT: an R Shiny app to quickly extract, plot and analyse bacterial growth and gene expression data

Dénéréaz, Julien ; Veening, Jan-Willem

Access microbiology, 2024, Vol.6 (1) [Periódico revisado por pares]

England: Microbiology Society

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6
The Taxonomy Dictionary: a resource for correct spelling of taxa
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The Taxonomy Dictionary: a resource for correct spelling of taxa

Bagge, Kristian

Access microbiology, 2023, Vol.5 (5) [Periódico revisado por pares]

England: Microbiology Society

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7
Hallux Valgus Angular Measurements using WBCT Semiautomatic and Manual Assessments
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Hallux Valgus Angular Measurements using WBCT Semiautomatic and Manual Assessments

Carvalho, Kepler ; Walt, Jennifer S. ; Ehret, Amanda ; Tazegul, Tutku ; Mallavarapu, Vinnel ; Rojas, Edward O. ; Dibbern, Kevin N. ; Mansur, Nacime SB ; Lalevée, Matthieu ; Netto, Cesar de Cesar

Foot & ankle orthopaedics, 2022-11, Vol.7 (4), p.2473011421 [Periódico revisado por pares]

Los Angeles, CA: SAGE Publications

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8
documentclass[12pt]{minimal} \usepackage{amsmath} \usepackage{wasysym} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsbsy} \usepackage{mathrsfs} \usepackage{upgreek} \setlength{\oddsidemargin}{-69pt} \begin{document}$${\text{COSNet}}_i$$\end{document}COSNeti: ComplexOme-Structural Network Interpreter used to study spatial enrichment in metazoan ribosomes
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documentclass[12pt]{minimal} \usepackage{amsmath} \usepackage{wasysym} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsbsy} \usepackage{mathrsfs} \usepackage{upgreek} \setlength{\oddsidemargin}{-69pt} \begin{document}$${\text{COSNet}}_i$$\end{document}COSNeti: ComplexOme-Structural Network Interpreter used to study spatial enrichment in metazoan ribosomes

Martinez-Seidel, Federico ; Hsieh, Yin-Chen ; Walther, Dirk ; Kopka, Joachim ; Pereira Firmino, Alexandre Augusto

BMC bioinformatics, 2021-12, Vol.22 [Periódico revisado por pares]

London: BioMed Central

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9
CRISPRcruncher: A tool for engineering restriction sites into coding regions
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CRISPRcruncher: A tool for engineering restriction sites into coding regions

Fay, Samuel F ; Fay, David S ; Chhatre, Vikram E

microPublication biology, 2021-01, Vol.2021 [Periódico revisado por pares]

United States: Caltech Library

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10
BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis
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BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis

Bouckaert, Remco ; Vaughan, Timothy G ; Barido-Sottani, Joëlle ; Duchêne, Sebastián ; Fourment, Mathieu ; Gavryushkina, Alexandra ; Heled, Joseph ; Jones, Graham ; Kühnert, Denise ; De Maio, Nicola ; Matschiner, Michael ; Mendes, Fábio K ; Müller, Nicola F ; Ogilvie, Huw A ; du Plessis, Louis ; Popinga, Alex ; Rambaut, Andrew ; Rasmussen, David ; Siveroni, Igor ; Suchard, Marc A ; Wu, Chieh-Hsi ; Xie, Dong ; Zhang, Chi ; Stadler, Tanja ; Drummond, Alexei J Pertea, Mihaela

PLoS computational biology, 2019-04, Vol.15 (4), p.e1006650-e1006650 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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