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High‐throughput computational investigation of protein electrostatics and cavity for SAM‐dependent methyltransferases
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High‐throughput computational investigation of protein electrostatics and cavity for SAM‐dependent methyltransferases

Jurich, Christopher ; Yang, Zhongyue J.

Protein science, 2023-07, Vol.32 (7), p.e4690-n/a [Periódico revisado por pares]

Hoboken, USA: John Wiley & Sons, Inc

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2
EnzyHTP: A High-Throughput Computational Platform for Enzyme Modeling
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EnzyHTP: A High-Throughput Computational Platform for Enzyme Modeling

Shao, Qianzhen ; Jiang, Yaoyukun ; Yang, Zhongyue J

Journal of chemical information and modeling, 2022-02, Vol.62 (3), p.647-655 [Periódico revisado por pares]

United States: American Chemical Society

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3
EnzyHTP Computational Directed Evolution with Adaptive Resource Allocation
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EnzyHTP Computational Directed Evolution with Adaptive Resource Allocation

Shao, Qianzhen ; Jiang, Yaoyukun ; Yang, Zhongyue J.

Journal of chemical information and modeling, 2023-09, Vol.63 (17), p.5650-5659 [Periódico revisado por pares]

Washington: American Chemical Society

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4
Data-driven enzyme engineering to identify function-enhancing enzymes
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Data-driven enzyme engineering to identify function-enhancing enzymes

Jiang, Yaoyukun ; Ran, Xinchun ; Yang, Zhongyue J

Protein engineering, design and selection, 2023-01, Vol.36 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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5
Accelerated Entropic Path Sampling with a Bidirectional Generative Adversarial Network
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Accelerated Entropic Path Sampling with a Bidirectional Generative Adversarial Network

Shin, Wook ; Ran, Xinchun ; Yang, Zhongyue J.

The journal of physical chemistry. B, 2023-05, Vol.127 (19), p.4254-4260 [Periódico revisado por pares]

United States: American Chemical Society

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6
IntEnzyDB: an Integrated Structure–Kinetics Enzymology Database
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IntEnzyDB: an Integrated Structure–Kinetics Enzymology Database

Yan, Bailu ; Ran, Xinchun ; Gollu, Anvita ; Cheng, Zihao ; Zhou, Xiang ; Chen, Yiwen ; Yang, Zhongyue J.

Journal of chemical information and modeling, 2022-11, Vol.62 (22), p.5841-5848 [Periódico revisado por pares]

United States: American Chemical Society

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7
Physiological Effects of Dietary Amino Acids on Gut Health and Functions of Swine
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Physiological Effects of Dietary Amino Acids on Gut Health and Functions of Swine

Yang, Zhongyue ; Liao, Shengfa F

Frontiers in veterinary science, 2019-06, Vol.6, p.169-169 [Periódico revisado por pares]

Switzerland: Frontiers Media S.A

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8
EnzyKR: a chirality-aware deep learning model for predicting the outcomes of the hydrolase-catalyzed kinetic resolution
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EnzyKR: a chirality-aware deep learning model for predicting the outcomes of the hydrolase-catalyzed kinetic resolution

Ran, Xinchun ; Jiang, Yaoyukun ; Shao, Qianzhen ; Yang, Zhongyue J

Chemical science (Cambridge), 2023-11, Vol.14 (43), p.1273-1282 [Periódico revisado por pares]

England: Royal Society of Chemistry

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9
Computational Strategies for Entropy Modeling in Chemical Processes
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Computational Strategies for Entropy Modeling in Chemical Processes

Shin, Wook ; Yang, Zhongyue J.

Chemistry, an Asian journal, 2023-05, Vol.18 (9), p.e202300117-n/a [Periódico revisado por pares]

Germany: Wiley Subscription Services, Inc

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10
Rate-Perturbing Single Amino Acid Mutation for Hydrolases: A Statistical Profiling
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Rate-Perturbing Single Amino Acid Mutation for Hydrolases: A Statistical Profiling

Yan, Bailu ; Ran, Xinchun ; Jiang, Yaoyukun ; Torrence, Sarah K ; Yuan, Li ; Shao, Qianzhen ; Yang, Zhongyue J

The journal of physical chemistry. B, 2021-09, Vol.125 (38), p.10682-10691 [Periódico revisado por pares]

American Chemical Society

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