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1
Cohesin-Mediated Genome Architecture Does Not Define DNA Replication Timing Domains
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Cohesin-Mediated Genome Architecture Does Not Define DNA Replication Timing Domains

Oldach, Phoebe ; Nieduszynski, Conrad A

Genes, 2019-03, Vol.10 (3), p.196 [Periódico revisado por pares]

Switzerland: MDPI AG

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2
Multiscale 3D Genome Rewiring during Mouse Neural Development
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Multiscale 3D Genome Rewiring during Mouse Neural Development

Bonev, Boyan ; Mendelson Cohen, Netta ; Szabo, Quentin ; Fritsch, Lauriane ; Papadopoulos, Giorgio L. ; Lubling, Yaniv ; Xu, Xiaole ; Lv, Xiaodan ; Hugnot, Jean-Philippe ; Tanay, Amos ; Cavalli, Giacomo

Cell, 2017-10, Vol.171 (3), p.557-572.e24 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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3
Chromatin extrusion explains key features of loop and domain formation in wild-type and engineered genomes
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Chromatin extrusion explains key features of loop and domain formation in wild-type and engineered genomes

Sanborn, Adrian L. ; Rao, Suhas S. P. ; Huang, Su-Chen ; Durand, Neva C. ; Huntley, Miriam H. ; Jewett, Andrew I. ; Bochkov, Ivan D. ; Chinnappan, Dharmaraj ; Cutkosky, Ashok ; Li, Jian ; Geeting, Kristopher P. ; Gnirke, Andreas ; Melnikov, Alexandre ; McKenna, Doug ; Stamenova, Elena K. ; Lander, Eric S. ; Aiden, Erez Lieberman

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2015-11, Vol.112 (47), p.E6456-E6465 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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4
Transferable model for chromosome architecture
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Transferable model for chromosome architecture

Di Pierro, Michele ; Zhang, Bin ; Aiden, Erez Lieberman ; Wolynes, Peter G. ; Onuchic, José N.

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2016-10, Vol.113 (43), p.12168-12173 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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5
Cohesin Loss Eliminates All Loop Domains
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Cohesin Loss Eliminates All Loop Domains

Rao, Suhas S.P. ; Huang, Su-Chen ; Glenn St Hilaire, Brian ; Engreitz, Jesse M. ; Perez, Elizabeth M. ; Kieffer-Kwon, Kyong-Rim ; Sanborn, Adrian L. ; Johnstone, Sarah E. ; Bascom, Gavin D. ; Bochkov, Ivan D. ; Huang, Xingfan ; Shamim, Muhammad S. ; Shin, Jaeweon ; Turner, Douglass ; Ye, Ziyi ; Omer, Arina D. ; Robinson, James T. ; Schlick, Tamar ; Bernstein, Bradley E. ; Casellas, Rafael ; Lander, Eric S. ; Aiden, Erez Lieberman

Cell, 2017-10, Vol.171 (2), p.305-320.e24 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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6
Mechanisms of Interplay between Transcription Factors and the 3D Genome
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Mechanisms of Interplay between Transcription Factors and the 3D Genome

Kim, Seungsoo ; Shendure, Jay

Molecular cell, 2019-10, Vol.76 (2), p.306-319 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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7
Complexity of chromatin folding is captured by the strings and binders switch model
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Complexity of chromatin folding is captured by the strings and binders switch model

Barbieri, Mariano ; Chotalia, Mita ; Fraser, James ; Lavitas, Liron-Mark ; Dostie, Josée ; Pombo, Ana ; Nicodemi, Mario

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2012-10, Vol.109 (40), p.16173-16178 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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8
Chromatin organization by an interplay of loop extrusion and compartmental segregation
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Chromatin organization by an interplay of loop extrusion and compartmental segregation

Nuebler, Johannes ; Fudenberg, Geoffrey ; Imakaev, Maxim ; Abdennur, Nezar ; Mirny, Leonid A.

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2018-07, Vol.115 (29), p.E6697-E6706 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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9
Microscopy-Based Chromosome Conformation Capture Enables Simultaneous Visualization of Genome Organization and Transcription in Intact Organisms
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Microscopy-Based Chromosome Conformation Capture Enables Simultaneous Visualization of Genome Organization and Transcription in Intact Organisms

Cardozo Gizzi, Andrés M. ; Cattoni, Diego I. ; Fiche, Jean-Bernard ; Espinola, Sergio M. ; Gurgo, Julian ; Messina, Olivier ; Houbron, Christophe ; Ogiyama, Yuki ; Papadopoulos, Giorgio L. ; Cavalli, Giacomo ; Lagha, Mounia ; Nollmann, Marcelo

Molecular cell, 2019-04, Vol.74 (1), p.212-222.e5 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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10
Nimble and Ready to Mingle: Transposon Outbursts of Early Development
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Nimble and Ready to Mingle: Transposon Outbursts of Early Development

Rodriguez-Terrones, Diego ; Torres-Padilla, Maria-Elena

Trends in genetics, 2018-10, Vol.34 (10), p.806-820 [Periódico revisado por pares]

England: Elsevier Ltd

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