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Computing the binding free energy of thyroid hormone to a second site of its receptor using non-equilibrium steered molecular dynamics simulations
Computing the binding free energy of thyroid hormone to a second site of its receptor using non-equilibrium steered molecular dynamics simulations
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Artigo de Congresso 		Adicionar ao Meu Espaço

Computing the binding free energy of thyroid hormone to a second site of its receptor using non-equilibrium steered molecular dynamics simulations

Paulo C. T. Souza Igor Polikarpov; Leandro Martínez; Simpósio Brasileiro de Química Teórica - SBQT (16. 2011 Ouro Preto)

Livro de resumos Belo Horizonte: Universidade Federal de Minas Gerais, 2011

Belo Horizonte Universidade Federal de Minas Gerais 2011

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2
Studies of thyroid hormone receptor and its mutations
Studies of thyroid hormone receptor and its mutations
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Artigo de Congresso 		Adicionar ao Meu Espaço

Studies of thyroid hormone receptor and its mutations

Paulo C. T. Souza Leandro Martínez; Igor Polikarpov; Munir Salomão Skaf; Reunião Anual Sociedade Brasileira de Química - SBQ (33. 2010 Águas de Lindóia)

Programa e Resumos São Paulo : Sociedade Brasileira de Química - SBQ, 2010

São Paulo Sociedade Brasileira de Química - SBQ 2010

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3
Denaturation mechanisms of the ligand binding domain of thyroid hormone receptors
Denaturation mechanisms of the ligand binding domain of thyroid hormone receptors
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Artigo de Congresso 		Adicionar ao Meu Espaço

Denaturation mechanisms of the ligand binding domain of thyroid hormone receptors

Leandro Martínez Paulo C. T Souza; Igor Polikarpov; Munir S Skaf; International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computacional Biology - X-Meeting 2007 (3. 2007 São Paulo); Meeting (10 2007 São Paulo)

Resumos São Paulo : Sociedade Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional - SB3C, 2007

São Paulo Sociedade Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional - SB3C 2007

Localização: IFSC - Inst. Física de São Carlos    (PROD014105 ) e outros locais(Acessar)

4
CHARMM force field parameterization of rosiglitazone
CHARMM force field parameterization of rosiglitazone
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

CHARMM force field parameterization of rosiglitazone

Anders Hansson Paulo C. T Souza; Rodrigo L Silveira; Leandro Martínez; Munir S Skaf

International Journal of Quantum Chemistry Hoboken : John Wiley and Sons v. 111, n. 7/8, p. 1346-1354, June/July, 2011

Hoboken 2011

Localização: IFSC - Inst. Física de São Carlos    (PROD019004 )(Acessar)

5
An alternative conformation of ERβ bound to estradiol reveals H12 in a stable antagonist position
An alternative conformation of ERβ bound to estradiol reveals H12 in a stable antagonist position
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

An alternative conformation of ERβ bound to estradiol reveals H12 in a stable antagonist position

Paulo C. T. Souza Larissa C Textor; Denise C Melo; Alessandro Silva Nascimento; Munir S Skaf; Igor Polikarpov

Scientific Reports London : Nature v. 7, p. 3509-1-3509-11, June 2017

London 2017

Localização: IFSC - Inst. Física de São Carlos    (PROD026189 )(Acessar)

6
On the denaturation mechanisms of the ligand binding domain of thyroid hormone receptors
On the denaturation mechanisms of the ligand binding domain of thyroid hormone receptors
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On the denaturation mechanisms of the ligand binding domain of thyroid hormone receptors

Leandro Martínez Paulo C. T Souza; Wanius Garcia; Fernanda A. H Batista; Rodrigo V Portugal; Alessandro Silva Nascimento; Marcel Nakahira; Luis M. T. R Lima; Igor Polikarpov; Munir S Skaf

Journal of Physical Chemistry B Washington, DC : American Chemical Society - ACS v. 114, n. 3, p. 1529-1540, Jan. 2010

Washington, DC 2010

Localização: IFSC - Inst. Física de São Carlos    (PROD016942 )(Acessar)

7
Helix 12 dynamics and thyroid hormone receptor activity experimental and molecular dynamics studies of Ile280 mutants
Helix 12 dynamics and thyroid hormone receptor activity experimental and molecular dynamics studies of Ile280 mutants
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Helix 12 dynamics and thyroid hormone receptor activity experimental and molecular dynamics studies of Ile280 mutants

Paulo C. T. Souza Gustavo B Barra; Lara F. R Velasco; Isabel C. J Ribeiro; Luiz A Simeoni; Marie Togashi; Paul Webb; Francisco A. R Neves; Munir S Skaf; Leandro Martínez; Igor Polikarpov

Journal of Molecular Biology London : Academic Press v. 412, n. 5, p. 882-893, Oct. 2011

London 2011

Localização: IFSC - Inst. Física de São Carlos    (PROD018850 )(Acessar)

8
On the denaturation mechanisms of the ligand binding domain of thyroid hormone receptors
On the denaturation mechanisms of the ligand binding domain of thyroid hormone receptors
Material Type:
Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

On the denaturation mechanisms of the ligand binding domain of thyroid hormone receptors

Leandro Martínez Paulo C. T Souza; Wanius Garcia; Fernanda A. H Batista; Rodrigo V Portugal; Alessandro Silva Nascimento; Marcel Nakahira; Luis M. T. R Lima; Igor Polikarpov; Munir S Skaf

Journal of Physical Chemistry B Washington, DC : American Chemical Society - ACS v. 114, n. 3, p. 1529-1540, Jan. 2010

Washington, DC 2010

Localização: IFSC - Inst. Física de São Carlos    (PROD016942 )(Acessar)

9
Helix 12 dynamics and thyroid hormone receptor activity experimental and molecular dynamics studies of Ile280 mutants
Helix 12 dynamics and thyroid hormone receptor activity experimental and molecular dynamics studies of Ile280 mutants
Material Type:
Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Helix 12 dynamics and thyroid hormone receptor activity experimental and molecular dynamics studies of Ile280 mutants

Paulo C. T. Souza Gustavo B Barra; Lara F. R Velasco; Isabel C. J Ribeiro; Luiz A Simeoni; Marie Togashi; Paul Webb; Francisco A. R Neves; Munir S Skaf; Leandro Martínez; Igor Polikarpov

Journal of Molecular Biology London : Academic Press v. 412, n. 5, p. 882-893, Oct. 2011

London 2011

Localização: IFSC - Inst. Física de São Carlos    (PROD018850 )(Acessar)

10
Molecular mechanism of peroxisome proliferator-activated receptor α activation by WY14643 a new mode of ligand recognition and receptor stabilization
Molecular mechanism of peroxisome proliferator-activated receptor α activation by WY14643 a new mode of ligand recognition and receptor stabilization
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Molecular mechanism of peroxisome proliferator-activated receptor α activation by WY14643 a new mode of ligand recognition and receptor stabilization

Amanda Bernardes Paulo C. T Souza; João Renato Carvalho Muniz; Clarisse G Ricci; Stephen D Ayers; Nili M Parekh; André S Godoy; Daniela B. B Trivella; Peter Reinach; Paul Webb; Munir S Skaf; Igor Polikarpov

Journal of Molecular Biology Amsterdam : Elsevier v. 425, n. 16, p. 2878-2893, Aug. 2013

Amsterdam 2013

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