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1
Deep learning for computational biology
Deep learning for computational biology
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Deep learning for computational biology

Angermueller, Christof ; Pärnamaa, Tanel ; Parts, Leopold ; Stegle, Oliver

Molecular systems biology, 2016-07, Vol.12 (7), p.878-n/a [Periódico revisado por pares]

England: EMBO Press

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2
Identifying viruses from metagenomic data using deep learning
Identifying viruses from metagenomic data using deep learning
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Identifying viruses from metagenomic data using deep learning

Ren, Jie ; Song, Kai ; Deng, Chao ; Ahlgren, Nathan A. ; Fuhrman, Jed A. ; Li, Yi ; Xie, Xiaohui ; Poplin, Ryan ; Sun, Fengzhu

Quantitative biology, 2020-03, Vol.8 (1), p.64-77 [Periódico revisado por pares]

Beijing: Higher Education Press

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3
High‐accuracy protein structure prediction in CASP14
High‐accuracy protein structure prediction in CASP14
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High‐accuracy protein structure prediction in CASP14

Pereira, Joana ; Simpkin, Adam J. ; Hartmann, Marcus D. ; Rigden, Daniel J. ; Keegan, Ronan M. ; Lupas, Andrei N.

Proteins, structure, function, and bioinformatics, 2021-12, Vol.89 (12), p.1687-1699 [Periódico revisado por pares]

Hoboken, USA: John Wiley & Sons, Inc

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4
Progress in molecular docking
Progress in molecular docking
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Progress in molecular docking

Fan, Jiyu ; Fu, Ailing ; Zhang, Le

Quantitative biology, 2019-06, Vol.7 (2), p.83-89 [Periódico revisado por pares]

Beijing: Higher Education Press

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5
Genotyping‐in‐Thousands by sequencing (GT‐seq): A cost effective SNP genotyping method based on custom amplicon sequencing
Genotyping‐in‐Thousands by sequencing (GT‐seq): A cost effective SNP genotyping method based on custom amplicon sequencing
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Genotyping‐in‐Thousands by sequencing (GT‐seq): A cost effective SNP genotyping method based on custom amplicon sequencing

Campbell, Nathan R. ; Harmon, Stephanie A. ; Narum, Shawn R.

Molecular ecology resources, 2015-07, Vol.15 (4), p.855-867 [Periódico revisado por pares]

England: Blackwell Pub

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6
The evolution of the antimicrobial peptide database over 18 years: Milestones and new features
The evolution of the antimicrobial peptide database over 18 years: Milestones and new features
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The evolution of the antimicrobial peptide database over 18 years: Milestones and new features

Wang, Guangshun ; Zietz, C. Michael ; Mudgapalli, Ashok ; Wang, Shuona ; Wang, Zhe

Protein science, 2022-01, Vol.31 (1), p.92-106 [Periódico revisado por pares]

Hoboken, USA: John Wiley & Sons, Inc

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7
Commercial proteases: Present and future
Commercial proteases: Present and future
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Commercial proteases: Present and future

Li, Qing ; Yi, Li ; Marek, Peter ; Iverson, Brent L.

FEBS letters, 2013-04, Vol.587 (8), p.1155-1163 [Periódico revisado por pares]

England: Elsevier B.V

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8
Measuring error rates in genomic perturbation screens: gold standards for human functional genomics
Measuring error rates in genomic perturbation screens: gold standards for human functional genomics
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Measuring error rates in genomic perturbation screens: gold standards for human functional genomics

Hart, Traver ; Brown, Kevin R ; Sircoulomb, Fabrice ; Rottapel, Robert ; Moffat, Jason

Molecular systems biology, 2014-07, Vol.10 (7), p.733-n/a [Periódico revisado por pares]

England: EMBO Press

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9
Prediction of homoprotein and heteroprotein complexes by protein docking and template-based modeling: A CASP-CAPRI experiment
Prediction of homoprotein and heteroprotein complexes by protein docking and template-based modeling: A CASP-CAPRI experiment
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Prediction of homoprotein and heteroprotein complexes by protein docking and template-based modeling: A CASP-CAPRI experiment

Lensink, Marc F. ; Velankar, Sameer ; Kryshtafovych, Andriy ; Huang, Shen-You ; Schneidman-Duhovny, Dina ; Segura, Joan ; Fernandez-Fuentes, Narcis ; Viswanath, Shruthi ; Elber, Ron ; Grudinin, Sergei ; Popov, Petr ; Neveu, Emilie ; Lee, Hasup ; Baek, Minkyung ; Park, Sangwoo ; Heo, Lim ; Rie Lee, Gyu ; Seok, Chaok ; Qin, Sanbo ; Zhou, Huan-Xiang ; Ritchie, David W. ; Maigret, Bernard ; Devignes, Marie-Dominique ; Ghoorah, Anisah ; Torchala, Mieczyslaw ; Chaleil, Raphaël A.G. ; Bates, Paul A. ; Ben-Zeev, Efrat ; Eisenstein, Miriam ; Negi, Surendra S. ; Weng, Zhiping ; Vreven, Thom ; Pierce, Brian G. ; Borrman, Tyler M. ; Yu, Jinchao ; Ochsenbein, Françoise ; Guerois, Raphaël ; Vangone, Anna ; Rodrigues, João P.G.L.M. ; van Zundert, Gydo ; Nellen, Mehdi ; Xue, Li ; Karaca, Ezgi ; Melquiond, Adrien S.J. ; Visscher, Koen ; Kastritis, Panagiotis L. ; Bonvin, Alexandre M.J.J. ; Xu, Xianjin ; Qiu, Liming ; Yan, Chengfei ; Li, Jilong ; Ma, Zhiwei ; Cheng, Jianlin ; Zou, Xiaoqin ; Shen, Yang ; Peterson, Lenna X. ; Kim, Hyung-Rae ; Roy, Amit ; Han, Xusi ; Esquivel-Rodriguez, Juan ; Kihara, Daisuke ; Yu, Xiaofeng ; Bruce, Neil J. ; Fuller, Jonathan C. ; Wade, Rebecca C. ; Anishchenko, Ivan ; Kundrotas, Petras J. ; Vakser, Ilya A. ; Imai, Kenichiro ; Yamada, Kazunori ; Oda, Toshiyuki ; Nakamura, Tsukasa ; Tomii, Kentaro ; Pallara, Chiara ; Romero-Durana, Miguel ; Jiménez-García, Brian ; Moal, Iain H. ; Férnandez-Recio, Juan ; Joung, Jong Young ; Kim, Jong Yun ; Joo, Keehyoung ; Lee, Jooyoung ; Kozakov, Dima ; Vajda, Sandor ; Mottarella, Scott ; Hall, David R. ; Beglov, Dmitri ; Mamonov, Artem ; Xia, Bing ; Bohnuud, Tanggis ; Del Carpio, Carlos A. ; Ichiishi, Eichiro ; Marze, Nicholas ; Kuroda, Daisuke ; Gray, Jeffrey J. ; Chermak, Edrisse ; Cavallo, Luigi ; Oliva, Romina ; Tovchigrechko, Andrey ; Wodak, Shoshana J.

Proteins, structure, function, and bioinformatics, 2016-09, Vol.84 (S1), p.323-348 [Periódico revisado por pares]

United States: Blackwell Publishing Ltd

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10
Predicting enhancer-promoter interaction from genomic sequence with deep neural networks
Predicting enhancer-promoter interaction from genomic sequence with deep neural networks
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Predicting enhancer-promoter interaction from genomic sequence with deep neural networks

Singh, Shashank ; Yang, Yang ; Póczos, Barnabás ; Ma, Jian

Quantitative biology, 2019-06, Vol.7 (2), p.122-137 [Periódico revisado por pares]

Beijing: Higher Education Press

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