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1
A community resource for paired genomic and metabolomic data mining
A community resource for paired genomic and metabolomic data mining
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

A community resource for paired genomic and metabolomic data mining

Michelle A. Schorn Stefan Verhoeven; Lars Ridder; Florian Huber; Deepa D. A Acharya; Alexander A Aksenov; Gajender Aleti; Jamshid Amiri Moghaddam; Allegra T Aron; Saefuddin Aziz; Anelize Bauermeister; Katherine D Bauman; Martin Baunach; Christine Beemelmanns; J. Michael Beman; María Victoria Berlanga Clavero; Alex A Blacutt; Helge B Bode; Anne Boullie; Asker Brejnrod; Tim S Bugni; Alexandra Calteau; Liu Cao; Víctor J Carrión; Raquel Castelo Branco; Shaurya Chanana; Alexander B Chase; Marc G Chevrette; Leticia Veras Costa Lotufo; Jason M Crawford; Cameron R Currie; Bart Cuypers; Tam Dang; Tristan de Rond; Alyssa M Demko; Elke Dittmann; Chao Du; Christopher Drozd; Jean-Claude Dujardin; Rachel J Dutton; Ann Edlund; David P Fewer; Neha Garg; Julia M Gauglitz; Emily C Gentry; Lena Gerwick; Evgenia Glukhov; Harald Gross; Muriel Gugger; Dulce G. Guillén Matus; Eric J. N Helfrich; Benjamin-Florian Hempel; Jae-Seoun Hur; Marianna Iorio; Paul R Jensen; Kyo Bin Kang; Leonard Kaysser; Neil L Kelleher; Chung Sub Kim; Ki Hyun Kim; Irina Koester; Gabriele M König; Tiago Leao; Seoung Rak Lee; Yi-Yuan Lee; Xuanji Li; Jessica C Little Maloney,Katherine N.; Daniel Männle; Christian Martin H.; Andrew C McAvoy; Willam W Metcalf; Hosein Mohimani; Carlos Molina Santiago; Bradley S Moore; Michael W Mullowney; Mitchell Muskat; Louis Félix Nothias; Ellis C O’Neill; Elizabeth I Parkinson; Daniel Petras; Jörn Piel; Emily C Pierce; Karine Pires; Raphael Reher; Diego Romero; M. Caroline Roper; Michael Rust; Hamada Saad; Carmen Saenz; Laura M Sanchez; Søren Johann Sørensen; Margherita Sosio; Roderich D Süssmuth; Douglas Sweeney; Kapil Tahlan; Regan J Thomson; Nicholas J Tobias; Amaro Emiliano Trindade Silva; Gilles P. van Wezel; Mingxun Wang; Kelly C Weldon; Fan Zhang; Nadine Ziemert; Katherine R Duncan; Max Crüsemann; Simon Rogers; Pieter C Dorrestein; Marnix H Medema; Justin J. J. van der Hooft

Nature Chemical Biology London 8 p., 2021

London 2021

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2
Accelerating the alignment phase of Minimap2 genome assembly algorithm Using GACT-X in a commercial Cloud FPGA machine.
Accelerating the alignment phase of Minimap2 genome assembly algorithm Using GACT-X in a commercial Cloud FPGA machine.
Material Type:
Dissertação de Mestrado 		Adicionar ao Meu Espaço

Accelerating the alignment phase of Minimap2 genome assembly algorithm Using GACT-X in a commercial Cloud FPGA machine.

Teng, Carolina

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Escola Politécnica 2022-07-27

Acesso online

3
Adapting the GACT-X aligner to accelerate minimap2 in an FPGA cloud instance
Adapting the GACT-X aligner to accelerate minimap2 in an FPGA cloud instance
Material Type:
Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Adapting the GACT-X aligner to accelerate minimap2 in an FPGA cloud instance

Carolina Teng Renan Weege Achjian; Jiang Chau Wang 1958-; Fernando Josepetti Fonseca 1959-

Applied Sciences Basel v. 13, n.7, Mar 2023. Article nº 4385

Basel 2023

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4
AGHmatrix genetic relationship matrices in R
AGHmatrix genetic relationship matrices in R
Material Type:
Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

AGHmatrix genetic relationship matrices in R

Rodrigo R Amadeu Antonio Augusto Franco Garcia; Patricio R Munoz; Luís Felipe V Ferrão

Bioinformatics Oxford v. 39, n. 7, art. btad445, p. 1-4, 2023

Oxford 2023

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5
Aliados improváveis. [Depoimento a Maria Guimarães]
Aliados improváveis. [Depoimento a Maria Guimarães]
Material Type:
Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Aliados improváveis. [Depoimento a Maria Guimarães]

Aline Maria Da Silva João Carlos Setubal; Robert Schooley; Sylvia Cardoso Leão; Victor Balcão; Roger Chammas; Aparecida Maria Fontes; Cleslei Zanelli; Danielle Pedrolli; Tal Danino; Tetsuhiro Harimoto; Rafael Silva Rocha; Otto Heringer; Cauã Westmann; Marcos Buckeridge

Pesquisa FAPESP São Paulo ed. 257, p. 19-25, jul. 2017

São Paulo 2017

Acesso online

6
Alinhamento múltiplo de genomas de eucariotos com montagens altamente fragmentadas
Alinhamento múltiplo de genomas de eucariotos com montagens altamente fragmentadas
Material Type:
Dissertação de Mestrado 		Adicionar ao Meu Espaço

Alinhamento múltiplo de genomas de eucariotos com montagens altamente fragmentadas

Epamino, George Willian Condomitti

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática 2017-08-04

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

7
Análise comparativa do genoma de bacteriófagos isolados da compostagem e estudo dos determinantes de sua interação com Pseudomonas aeruginosa
Análise comparativa do genoma de bacteriófagos isolados da compostagem e estudo dos determinantes de sua interação com Pseudomonas aeruginosa
Material Type:
Dissertação de Mestrado 		Adicionar ao Meu Espaço

Análise comparativa do genoma de bacteriófagos isolados da compostagem e estudo dos determinantes de sua interação com Pseudomonas aeruginosa

Rossi, Fernando Pacheco Nobre

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática 2019-09-04

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

8
Análise da diversidade e estrutura genética em uma população de melhoramento genético de Eucalyptus spp.
Análise da diversidade e estrutura genética em uma população de melhoramento genético de Eucalyptus spp.
Material Type:
Dissertação de Mestrado 		Adicionar ao Meu Espaço

Análise da diversidade e estrutura genética em uma população de melhoramento genético de Eucalyptus spp.

Malheiros, Angélica Costa

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz 2024-02-15

Acesso online

9
Análise da expressão gênica diferencial causada pela interação de feijoeiros (Phaseolus vulgaris L.) e fungos micorrízicos arbusculares sob efeito de déficit hídrico
Análise da expressão gênica diferencial causada pela interação de feijoeiros (Phaseolus vulgaris L.) e fungos micorrízicos arbusculares sob efeito de déficit hídrico
Material Type:
Tese de Doutorado 		Adicionar ao Meu Espaço

Análise da expressão gênica diferencial causada pela interação de feijoeiros (Phaseolus vulgaris L.) e fungos micorrízicos arbusculares sob efeito de déficit hídrico

Recchia, Gustavo Henrique

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Centro de Energia Nuclear na Agricultura 2015-12-04

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

10
Análise genômica de isolados bacterianos de cobaias (Cavia porcellus) e preguiças-de-garganta-marrom (Bradypus variegatus)
Análise genômica de isolados bacterianos de cobaias (Cavia porcellus) e preguiças-de-garganta-marrom (Bradypus variegatus)
Material Type:
Dissertação de Mestrado 		Adicionar ao Meu Espaço

Análise genômica de isolados bacterianos de cobaias (Cavia porcellus) e preguiças-de-garganta-marrom (Bradypus variegatus)

Dennis E. Carhuaricra Huaman Dennis Edgardo Carhuaricra Huaman Lenin Maturrano Abelardo Lenin Maturrano Hernández; João Carlos Setubal

2023

Localização: IME - Inst. Matemática e Estatística    (Clicar na URL para acesso ao texto na BDTD )(Acessar)

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Deste Autor:

  1. Carvalho, A
  2. Setubal, J
  3. Rocha, U
  4. Bonidia, R
  5. Digiampietri, L

Neste Assunto:

  1. Bioinformática
  2. Bioinformatics
  3. Genomics
  4. Computational Biology
  5. Neoplasias

  • Realização: ABCD-USP USP   Logos de Redes Sociais: Freepik

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